source: branches/ali/UNIT_TESTER/run/tools/read_tree_out_expected.arb

Last change on this file was 17953, checked in by westram, 5 years ago
  • fix number of tabs between key and data (ASCII DB format)
    • auto-updated all databases.
File size: 2.7 KB
Line 
1/*ARBDB ASCII*/
2tree_data               :7000   %% (%
3        tree_newick                     %% (%
4                tree                            "N0.1,0.1;LHelPylor\AN0.1,0.1;N0.1,0.1;N0.1,0.1;LAnaMargi\ALEhrEhrli\ALCowRumin\AN0.1,0.1;LRhdSphae\AN0.1,0.1;LAzoCauli\ALBraJapon\A"
5                nnodes                          %i 6
6                order                           %i 1
7                remark                          "test newick\nunittest-tree\n<date removed for testing>"
8                %) /*tree_newick*/
9
10        tree_newick_sq                  %% (%
11                tree                            "N0.1,0.1;LHelPylor\AN0.1,0.1;N0.1,0.1;N0.1,0.1;LAnaMargi\ALEhrEhrli\ALCowRumin\AN0.1,0.1;LRhdSphae\AN0.1,0.1;LAzoCauli\ALBraJapon\A"
12                nnodes                          %i 6
13                order                           %i 2
14                remark                          "test newick_sq\nThe ARB software is a graphically oriented package comprising various tools for\nsequence database handling and data analysis. A central database of processed\n(aligned) sequences and any type of additional data linked to the respective\nsequence entries is structured according to phylogeny or other user defined\ncriteria. Take a look at some features.  To get a quick impression, see how we\npresented ARB on several conferences.\n\nunittest-tree\n<date removed for testing>"
15                %) /*tree_newick_sq*/
16
17        tree_newick_dq                  %% (%
18                tree                            "N0.05,0.05;LHelPylor\AN0.05,0.05;N0.05,0.05;N0.05,0.05;LAnaMargi\ALEhrEhrli\ALCowRumin\AN0.05,0.05;LRhdSphae\AN0.05,0.05;LAzoCauli\ALBraJapon\A"
19                nnodes                          %i 6
20                order                           %i 3
21                remark                          "test newick_dq\nunittest-tree\n<date removed for testing>"
22                %) /*tree_newick_dq*/
23
24        tree_newick_group               %% (%
25                tree                            "N0.1,0.1;LHelPylor\AR10%\AN0.1,0.1;R10%\AN0.1,0.1;R10%\AN0.1,0.1;LAnaMargi\ALEhrEhrli\ALCowRumin\AR10%\AN0.1,0.1;LRhdSphae\AR10%\AN0.1,0.1;LAzoCauli\ALBraJapon\A"
26                node                            %% (%
27                        group_name                      "inner"
28                        id                              %i 0
29                        %) /*node*/
30
31                node                            %% (%
32                        group_name                      "group2"
33                        id                              %i 1
34                        %) /*node*/
35
36                nnodes                          %i 6
37                order                           %i 4
38                remark                          "test newick_group\nunittest-tree\n<date removed for testing>"
39                %) /*tree_newick_group*/
40
41        tree_newick_len                 %% (%
42                tree                            "N0.21343,0.02023;LHelPylor\AN0.09626,0.05478;N0.02299,0.08864;N0.05387,0.0572;LAnaMargi\ALEhrEhrli\ALCowRumin\AN0.11648,0.02901;LRhdSphae\AN0.07795,0.09907;LAzoCauli\ALBraJapon\A"
43                nnodes                          %i 6
44                order                           %i 5
45                remark                          "test newick_len\nunittest-tree\n<date removed for testing>"
46                %) /*tree_newick_len*/
47
48        tree_newick_len_group           %% (%
49                tree                            "N0.21343,0.02023;LHelPylor\AN0.09626,0.05478;N0.02299,0.08864;N0.05387,0.0572;LAnaMargi\ALEhrEhrli\ALCowRumin\AN0.11648,0.02901;LRhdSphae\AN0.07795,0.09907;LAzoCauli\ALBraJapon\A"
50                node                            %% (%
51                        group_name                      "inner"
52                        id                              %i 0
53                        %) /*node*/
54
55                node                            %% (%
56                        group_name                      "group2"
57                        id                              %i 1
58                        %) /*node*/
59
60                nnodes                          %i 6
61                order                           %i 6
62                remark                          "test newick_len_group\nunittest-tree\n<date removed for testing>"
63                %) /*tree_newick_len_group*/
64
65        %) /*tree_data*/
66
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.