source: branches/help/GDEHELP/FASTA/GENBANK/gbrna.seq

Last change on this file was 2, checked in by oldcode, 24 years ago

Initial revision

  • Property svn:eol-style set to native
  • Property svn:keywords set to Author Date Id Revision
File size: 70.0 KB
Line 
1GBRNA.SEQ          Genetic Sequence Data Bank
2                         15 August 1993
3
4                NCBI-GenBank Flat File Release 78
5
6                     Structural RNA Sequences
7
8    3348 loci,   1987296 bases, from   3348 reported sequences
9
10LOCUS       AAURRA        118 bp ss-rRNA            RNA       16-JUN-1986
11DEFINITION  A.auricula-judae (mushroom) 5S ribosomal RNA.
12ACCESSION   K03160
13KEYWORDS    5S ribosomal RNA; ribosomal RNA.
14SOURCE      A.auricula-judae (mushroom) ribosomal RNA.
15  ORGANISM  Auricularia auricula-judae
16            Eukaryota; Fungi; Eumycota; Basidiomycotina; Phragmobasidiomycetes;
17            Heterobasidiomycetidae; Auriculariales; Auriculariaceae.
18REFERENCE   1  (bases 1 to 118)
19  AUTHORS   Huysmans,E., Dams,E., Vandenberghe,A. and De Wachter,R.
20  TITLE     The nucleotide sequences of the 5S rRNAs of four mushrooms and
21            their use in studying the phylogenetic position of basidiomycetes
22            among the eukaryotes
23  JOURNAL   Nucleic Acids Res. 11, 2871-2880 (1983)
24  STANDARD  full automatic
25FEATURES             Location/Qualifiers
26     rRNA            1..118
27                     /note="5S ribosomal RNA"
28     source          1..118
29                     /organism="Auricularia auricula-judae"
30BASE COUNT       27 a     34 c     34 g     23 t
31ORIGIN      5' end of mature rRNA.
32        1 atccacggcc ataggactct gaaagcactg catcccgtcc gatctgcaaa gttaaccaga
33       61 gtaccgccca gttagtacca cggtggggga ccacgcggga atcctgggtg ctgtggtt
34//
35LOCUS       ABCRR5SA      120 bp ss-rRNA            RNA       08-DEC-1992
36DEFINITION  Acetobacter pasteurianus 5S ribosomal RNA.
37ACCESSION   M76569
38KEYWORDS    5S ribosomal RNA.
39SOURCE      Acetobacter pasteurianus (library: NCIB 12228) rRNA.
40  ORGANISM  Acetobacter pasteurianus
41            Prokaryotae; Gracilicutes; Scotobacteria; Aerobic rods and cocci;
42            Azotobacteraceae.
43REFERENCE   1  (bases 1 to 120)
44  AUTHORS   Bulygina,E.S., Gulikova,O.M., Dikanskaya,E.M., Netrusov,A.I.,
45            Tourova,T.P. and Chumakov,K.M.
46  TITLE     Taxonomic studies of the genera Acidomonas, Acetobacter and
47            Gluconobacter by 5S ribosomal RNA sequencing
48  JOURNAL   J. Gen. Microbiol. 138, 2283-2286 (1992)
49  STANDARD  full automatic
50FEATURES             Location/Qualifiers
51     rRNA            1..120
52                     /product="5S ribosomal RNA"
53                     /gene="5S rRNA"
54     source          1..120
55                     /organism="Acetobacter pasteurianus"
56BASE COUNT       25 a     40 c     34 g     19 t      2 others
57ORIGIN     
58        1 rracctggtg gccatggcgg gagagatcca cccgatccca tcccgaactc ggccgtgaaa
59       61 acccccagcg cctatgatac gttggcttaa gccacgggaa agtcggtcgc cgccaggtct
60//
61LOCUS       ABCRR5SC      120 bp ss-rRNA            RNA       08-DEC-1992
62DEFINITION  Acetobacter methanolicus 5S ribosomal RNA.
63ACCESSION   M76571
64KEYWORDS    5S ribosomal RNA.
65SOURCE      Acetobacter methanolicus (strain MB58) rRNA.
66  ORGANISM  Acetobacter methanolicus
67            Prokaryotae; Gracilicutes; Scotobacteria; Aerobic rods and cocci;
68            Azotobacteraceae.
69REFERENCE   1  (bases 1 to 120)
70  AUTHORS   Bulygina,E.S., Gulikova,O.M., Dikanskaya,E.M., Netrusov,A.I.,
71            Tourova,T.P. and Chumakov,K.M.
72  TITLE     Taxonomic studies of the genera Acidomonas, Acetobacter and
73            Gluconobacter by 5S ribosomal RNA sequencing
74  JOURNAL   J. Gen. Microbiol. 138, 2283-2286 (1992)
75  STANDARD  full automatic
76FEATURES             Location/Qualifiers
77     rRNA            1..120
78                     /product="5S ribosomal RNA"
79                     /gene="5S rRNA"
80     source          1..120
81                     /organism="Acetobacter methanolicus"
82BASE COUNT       27 a     41 c     32 g     18 t      2 others
83ORIGIN     
84        1 ngatctggtg gccatggcgg gagcaaatca gccgatccca tcccgaactc ggccgtcaaa
85       61 tgccccagcg cccatgatac tctgcctcaa ggcacggaaa agtcggtcgc cgccagatcy
86//
87LOCUS       ABCRR5SD      120 bp ss-rRNA            RNA       08-DEC-1992
88DEFINITION  Acetobacter xylinum 5S ribosomal RNA.
89ACCESSION   M76572
90KEYWORDS    5S ribosomal RNA.
91SOURCE      Acetobacter xylinum (strain VKM 820) rRNA.
92  ORGANISM  Acetobacter xylinum
93            Prokaryotae; Gracilicutes; Scotobacteria; Aerobic rods and cocci;
94            Azotobacteraceae.
95REFERENCE   1  (bases 1 to 120)
96  AUTHORS   Bulygina,E.S., Gulikova,O.M., Dikanskaya,E.M., Netrusov,A.I.,
97            Tourova,T.P. and Chumakov,K.M.
98  TITLE     Taxonomic studies of the genera Acidomonas, Acetobacter and
99            Gluconobacter by 5S ribosomal RNA sequencing
100  JOURNAL   J. Gen. Microbiol. 138, 2283-2286 (1992)
101  STANDARD  full automatic
102FEATURES             Location/Qualifiers
103     rRNA            1..120
104                     /product="5S ribosomal RNA"
105                     /gene="5S rRNA"
106     source          1..120
107                     /organism="Acetobacter xylinum"
108BASE COUNT       26 a     39 c     35 g     20 t
109ORIGIN     
110        1 agacctggtg gcaatggcgg ggaatatcca cccgatccca tcccgaactc ggccgtgaaa
111       61 tgccccagcg cccatgatac tgtgccttaa ggcacgggaa agtcggtcgc cgccaggtct
112//
113LOCUS       ABCRR5SE      120 bp ss-rRNA            RNA       08-DEC-1992
114DEFINITION  Acetobacter aceti (NCIB 8621) 5S ribosomal RNA.
115ACCESSION   M76573
116KEYWORDS    5S ribosomal RNA.
117SOURCE      Acetobacter aceti (library: NCIB 8621) rRNA.
118  ORGANISM  Acetobacter aceti
119            Prokaryotae; Gracilicutes; Scotobacteria; Aerobic rods and cocci;
120            Azotobacteraceae.
121REFERENCE   1  (bases 1 to 120)
122  AUTHORS   Bulygina,E.S., Gulikova,O.M., Dikanskaya,E.M., Netrusov,A.I.,
123            Tourova,T.P. and Chumakov,K.M.
124  TITLE     Taxonomic studies of the genera Acidomonas, Acetobacter and
125            Gluconobacter by 5S ribosomal RNA sequencing
126  JOURNAL   J. Gen. Microbiol. 138, 2283-2286 (1992)
127  STANDARD  full automatic
128FEATURES             Location/Qualifiers
129     rRNA            1..120
130                     /product="5S ribosomal RNA"
131                     /gene="5S rRNA"
132     source          1..120
133                     /organism="Acetobacter aceti"
134BASE COUNT       24 a     39 c     36 g     20 t      1 others
135ORIGIN     
136        1 rgacctggtg gctatggcgg gagagatcca cccgatccca tcccgaactc ggccgtgaaa
137       61 acccccagcg cctatgatac tgcggcttaa gccgtgggaa agtcggtcgc cgccaggtct
138//
139LOCUS       ABCRR5SF      120 bp ss-rRNA            RNA       08-DEC-1992
140DEFINITION  Acetobacter sp. (strain 867) 5S ribosomal RNA.
141ACCESSION   M76574
142KEYWORDS    5S ribosomal RNA.
143SOURCE      Acetobacter sp. (strain 867) rRNA.
144  ORGANISM  Acetobacter sp.
145            Prokaryotae; Gracilicutes; Scotobacteria; Aerobic rods and cocci;
146            Azotobacteraceae.
147REFERENCE   1  (bases 1 to 120)
148  AUTHORS   Bulygina,E.S., Gulikova,O.M., Dikanskaya,E.M., Netrusov,A.I.,
149            Tourova,T.P. and Chumakov,K.M.
150  TITLE     Taxonomic studies of the genera Acidomonas, Acetobacter and
151            Gluconobacter by 5S ribosomal RNA sequencing
152  JOURNAL   J. Gen. Microbiol. 138, 2283-2286 (1992)
153  STANDARD  full automatic
154FEATURES             Location/Qualifiers
155     rRNA            1..120
156                     /product="5S ribosomal RNA"
157                     /gene="5S rRNA"
158     source          1..120
159                     /organism="Acetobacter sp."
160BASE COUNT       27 a     42 c     31 g     18 t      2 others
161ORIGIN     
162        1 ngatctggtg gccatggcgg cagcaaatca cccgatccca tgccgaactc ggccgtcaaa
163       61 tgccccagcg cccatgatac tctgcctcaa ggcacggaaa agtcggtcgc cgccagatcy
164//
165LOCUS       ABCRR5SG      120 bp ss-rRNA            RNA       08-DEC-1992
166DEFINITION  Acetobacter sp. (strain 913) 5S ribosomal RNA.
167ACCESSION   M76575
168KEYWORDS    5S ribosomal RNA.
169SOURCE      Acetobacter sp. (strain 913) rRNA.
170  ORGANISM  Acetobacter sp.
171            Prokaryotae; Gracilicutes; Scotobacteria; Aerobic rods and cocci;
172            Azotobacteraceae.
173REFERENCE   1  (bases 1 to 120)
174  AUTHORS   Bulygina,E.S., Gulikova,O.M., Dikanskaya,E.M., Netrusov,A.I.,
175            Tourova,T.P. and Chumakov,K.M.
176  TITLE     Taxonomic studies of the genera Acidomonas, Acetobacter and
177            Gluconobacter by 5S ribosomal RNA sequencing
178  JOURNAL   J. Gen. Microbiol. 138, 2283-2286 (1992)
179  STANDARD  full automatic
180FEATURES             Location/Qualifiers
181     rRNA            1..120
182                     /product="5S ribosomal RNA"
183                     /gene="5S rRNA"
184     source          1..120
185                     /organism="Acetobacter sp."
186BASE COUNT       28 a     41 c     30 g     20 t      1 others
187ORIGIN     
188        1 ngatctggtg gtcatagcgg gagtaaatca cccgatccca tcccgaactc ggccgtcaaa
189       61 tgcctcagcg cccatgatac tctgcctcaa ggcacggaaa agtcggtcgc cgccagaccc
190//
191LOCUS       ABCRR5SH      120 bp ss-rRNA            RNA       08-DEC-1992
192DEFINITION  Acetobacter sp. (strain 924) 5S ribosomal RNA.
193ACCESSION   M76576
194KEYWORDS    5S ribosomal RNA.
195SOURCE      Acetobacter sp. (strain 924) rRNA.
196  ORGANISM  Acetobacter sp.
197            Prokaryotae; Gracilicutes; Scotobacteria; Aerobic rods and cocci;
198            Azotobacteraceae.
199REFERENCE   1  (bases 1 to 120)
200  AUTHORS   Bulygina,E.S., Gulikova,O.M., Dikanskaya,E.M., Netrusov,A.I.,
201            Tourova,T.P. and Chumakov,K.M.
202  TITLE     Taxonomic studies of the genera Acidomonas, Acetobacter and
203            Gluconobacter by 5S ribosomal RNA sequencing
204  JOURNAL   J. Gen. Microbiol. 138, 2283-2286 (1992)
205  STANDARD  full automatic
206FEATURES             Location/Qualifiers
207     rRNA            1..120
208                     /product="5S ribosomal RNA"
209                     /gene="5S rRNA"
210     source          1..120
211                     /organism="Acetobacter sp."
212BASE COUNT       29 a     42 c     29 g     18 t      2 others
213ORIGIN     
214        1 ngatctgatg accatggcgg gagcaaatca cccgatccca tcccgaactc ggccgtcaaa
215       61 tgccccagcg cccatgatac tctgcctcaa ggcacggaaa agtcggtcgc cgccagatcy
216//
217LOCUS       ABCRR5SI      120 bp ss-rRNA            RNA       08-DEC-1992
218DEFINITION  Acetobacter aceti (strain VKM 879) 5S ribosomal RNA.
219ACCESSION   M76578
220KEYWORDS    5S ribosomal RNA.
221SOURCE      Acetobacter aceti (strain VKM 879) rRNA.
222  ORGANISM  Acetobacter aceti
223            Prokaryotae; Gracilicutes; Scotobacteria; Aerobic rods and cocci;
224            Azotobacteraceae.
225REFERENCE   1  (bases 1 to 120)
226  AUTHORS   Bulygina,E.S., Gulikova,O.M., Dikanskaya,E.M., Netrusov,A.I.,
227            Tourova,T.P. and Chumakov,K.M.
228  TITLE     Taxonomic studies of the genera Acidomonas, Acetobacter and
229            Gluconobacter by 5S ribosomal RNA sequencing
230  JOURNAL   J. Gen. Microbiol. 138, 2283-2286 (1992)
231  STANDARD  full automatic
232FEATURES             Location/Qualifiers
233     rRNA            1..120
234                     /product="5S ribosomal RNA"
235                     /gene="5S rRNA"
236     source          1..120
237                     /organism="Acetobacter aceti"
238BASE COUNT       24 a     40 c     37 g     19 t
239ORIGIN     
240        1 ggacctggtg gctatggcgg gagagatcca cccgatccca tcccgaactc ggccgtgaaa
241       61 acccccagcg cctatgatac tgcggcttaa gccgtgggaa agtcggtcgc cgccaggtcc
242//
243LOCUS       ABCRR5SJ      120 bp ss-rRNA            RNA       08-DEC-1992
244DEFINITION  Acetobacter sp. (strain 914) 5S ribosomal RNA.
245ACCESSION   M76580
246KEYWORDS    5S ribosomal RNA.
247SOURCE      Acetobacter sp. (strain 914) rRNA.
248  ORGANISM  Acetobacter sp.
249            Prokaryotae; Gracilicutes; Scotobacteria; Aerobic rods and cocci;
250            Azotobacteraceae.
251REFERENCE   1  (bases 1 to 120)
252  AUTHORS   Bulygina,E.S., Gulikova,O.M., Dikanskaya,E.M., Netrusov,A.I.,
253            Tourova,T.P. and Chumakov,K.M.
254  TITLE     Taxonomic studies of the genera Acidomonas, Acetobacter and
255            Gluconobacter by 5S ribosomal RNA sequencing
256  JOURNAL   J. Gen. Microbiol. 138, 2283-2286 (1992)
257  STANDARD  full automatic
258FEATURES             Location/Qualifiers
259     rRNA            1..120
260                     /product="5S ribosomal RNA"
261                     /gene="5S rRNA"
262     source          1..120
263                     /organism="Acetobacter sp."
264BASE COUNT       28 a     42 c     30 g     18 t      2 others
265ORIGIN     
266        1 ngatctgatg gccatggcgg gagcaaatca cccgatccca tcccgaactc ggccgtcaaa
267       61 tgccccagcg cccatgatac tctgcctcaa ggcacggaaa agtcggtcgc cgccagatcy
268//
269LOCUS       ABCRRAA       118 bp ss-rRNA            RNA       15-SEP-1990
270DEFINITION  Acetobacter sp. (strain MB 58) 5S ribosomal RNA, complete sequence.
271ACCESSION   M34766
272KEYWORDS    5S ribosomal RNA.
273SOURCE      Acetobacter sp. (strain MB 58) rRNA.
274  ORGANISM  Acetobacter sp.
275            Prokaryotae; Gracilicutes; Scotobacteria; Aerobic rods and cocci;
276            Azotobacteraceae.
277REFERENCE   1  (bases 1 to 118)
278  AUTHORS   Bulygina,E.S., Galchenko,V.F., Govorukhina,N.I., Netrusov,A.I.,
279            Nikitin,D.I., Trotsenko,Y.A. and Chumakov,K.M.
280  TITLE     Taxonomic studies of methylotrophic bacteria by 5S ribosomal RNA
281            sequencing
282  JOURNAL   J. Gen. Microbiol. 136, 441-446 (1990)
283  STANDARD  full automatic
284FEATURES             Location/Qualifiers
285     rRNA            1..118
286                     /note="5S ribosomal RNA"
287     source          1..118
288                     /organism="Acetobacter sp."
289BASE COUNT       27 a     40 c     32 g     17 t      2 others
290ORIGIN     
291        1 gatctggtgg ccatggcggg agcaaatcag ccgatcccat cccgaactcg gccgtcaaat
292       61 gccccagcgc ccatgatact ctgcctcaag gcacggaaaa gtcggtcgcc gccagayy
293//
294LOCUS       ABCRRAB       118 bp ss-rRNA            RNA       15-SEP-1990
295DEFINITION  Acetobacter sp. (strain 914) 5S ribosomal RNA, complete sequence.
296ACCESSION   M34767
297KEYWORDS    5S ribosomal RNA.
298SOURCE      Acetobacter sp. (strain 914) rRNA.
299  ORGANISM  Acetobacter sp.
300            Prokaryotae; Gracilicutes; Scotobacteria; Aerobic rods and cocci;
301            Azotobacteraceae.
302REFERENCE   1  (bases 1 to 118)
303  AUTHORS   Bulygina,E.S., Galchenko,V.F., Govorukhina,N.I., Netrusov,A.I.,
304            Nikitin,D.I., Trotsenko,Y.A. and Chumakov,K.M.
305  TITLE     Taxonomic studies of methylotrophic bacteria by 5S ribosomal RNA
306            sequencing
307  JOURNAL   J. Gen. Microbiol. 136, 441-446 (1990)
308  STANDARD  full automatic
309FEATURES             Location/Qualifiers
310     rRNA            1..118
311                     /note="5S ribosomal RNA"
312     source          1..118
313                     /organism="Acetobacter sp."
314BASE COUNT       27 a     42 c     29 g     18 t      2 others
315ORIGIN     
316        1 nntctgatgg ccatggcggg agcaaatcac ccgatcccat cccgaactcg gccgtcaaat
317       61 gccccagcgc ccatgatact ctgcctcaag gcacggaaaa gtcggtcgcc gccagatc
318//
319LOCUS       ABCRRS5B      120 bp ss-rRNA            RNA       08-DEC-1992
320DEFINITION  Acetobacter sp. (strain MB 58/4) 5S ribosomal RNA.
321ACCESSION   M76570
322KEYWORDS    5S ribosomal RNA.
323SOURCE      Acetobacter sp. (strain MB 58/4) rRNA.
324  ORGANISM  Acetobacter sp.
325            Prokaryotae; Gracilicutes; Scotobacteria; Aerobic rods and cocci;
326            Azotobacteraceae.
327REFERENCE   1  (bases 1 to 120)
328  AUTHORS   Bulygina,E.S., Gulikova,O.M., Dikanskaya,E.M., Netrusov,A.I.,
329            Tourova,T.P. and Chumakov,K.M.
330  TITLE     Taxonomic studies of the genera Acidomonas, Acetobacter and
331            Gluconobacter by 5S ribosomal RNA sequencing
332  JOURNAL   J. Gen. Microbiol. 138, 2283-2286 (1992)
333  STANDARD  full automatic
334FEATURES             Location/Qualifiers
335     rRNA            1..120
336                     /product="5S ribosomal RNA"
337                     /gene="5S rRNA"
338     source          1..120
339                     /organism="Acetobacter sp."
340BASE COUNT       25 a     44 c     32 g     18 t      1 others
341ORIGIN     
342        1 ngatctggtg gccatggcgg ggcgcaatca cccgatccca tcccgaactc ggccgtcaaa
343       61 tgccccagcg cccatgatac tctgcctcaa ggcacggaaa agtcggtcgc cgccagatcc
344//
345LOCUS       ABLREAA      1441 bp ss-rRNA            RNA       17-OCT-1991
346DEFINITION  Amblyomma americanum 18S rRNA sequence.
347ACCESSION   M60487
348KEYWORDS    ribosomal RNA.
349SOURCE      Amblyomma americanum rRNA.
350  ORGANISM  Amblyomma americanum
351            Eukaryota; Animalia; Metazoa; Arthropoda; Chelicerata; Arachnida;
352            Acari; Parasitiformes; Ixodida; Ixodoidea; Ixodidae.
353REFERENCE   1  (bases 1 to 1441)
354  AUTHORS   Turbeville,J.M., Pfeifer,D.M., Field,K.G. and Raff,R.A.
355  TITLE     The phylogenetic status of arthropods, as inferred 18S rRNA
356            sequences
357  JOURNAL   Mol. Biol. Evol. 8, 669-686 (1991)
358  STANDARD  full automatic
359FEATURES             Location/Qualifiers
360     rRNA            <1..>1441
361     source          1..1441
362                     /organism="Amblyomma americanum"
363BASE COUNT      357 a    330 c    393 g    351 t     10 others
364ORIGIN     
365        1 tggcggccgc tctagagcta atacatgcat tgagcctgaa ggcctttggc tgacgggcgc
366       61 ttttattaga ccaagaccca tcgggttctg cccgtactct gtggtgactc tggataactt
367      121 tgtgctgatc gcatggccat gagccggcga cgtttctttc aagtgtctgc cttatcaact
368      181 ttcgatggta ggttacttgc ctaccatggt tgttacgggt aacggagaat cagggttcga
369      241 ttccggagag ggagcctgag aaacggctac cacatccaag gaaggcagca ggcgcgcaaa
370      301 ttacccactc ccggcacggg gaggtagtga cgaaaaataa caatacggga ctcttttgag
371      361 gccccgtaat tgaaatgagt acactctaaa tcctttaacg aggatcaatt ggagggcaag
372      421 tctggtgcca gcanccgcgg taattccagc tccaatagcg tatattaann ctgctgcggt
373      481 taaaaagctc gtagttggat ctcagttcca gactgagtag tgcatctacc cgatgcgacg
374      541 gctcggactg aacatcatgc cggtcctctc ttggtgccct tcattggtgc gtctcgagga
375      601 ggcctgcgct tttactttga aaaaattaga gtgctcaacg cagcgagtcg cctgaataaa
376      661 cttgcatgga ataatagaac aagaccccgt ttctgttctg ttggtttttg gaatacgggg
377      721 taatgattaa gagggacaga cgggggcatt cgtattgcgg cgctagaggt gaaattcttg
378      781 gaccgtcgca agacgaacta ctgcgaaagc atttgccaag aatgttttct ttgatcaaga
379      841 acgaaagtca gaggttcgaa ggcgatcaga taccgcccta gttctgacca taaacgatgc
380      901 caaccagcga tccgcctgag ttactcaaat gactcggcgg gcagcttccg ggaaaccaaa
381      961 gtatttgggt tccgggggaa gtatggttgc aaagctgaaa cttaaaggaa ttgacngann
382     1021 ggcaccacca ggagtggagc ctgcgcttaa tttgactcaa cacgggaaaa cttacncgnn
383     1081 ncggacactg ggaggattga cagattgaga gctctttctt gattcggtgg atggtggtgc
384     1141 atggccgttc ttagttggtg gagcgatttg tctggttaat tccgataacg aacgagactc
385     1201 tagcctatta atagtgcggg ttcccagcac cttacaacct tcttagaggg acaacgctcc
386     1261 tagccgcacg aaacagagca ataacaggtc tgtgatgccc ttagatgtcc ggggccgcac
387     1321 gcgcgctaca ctgaaggaag cagcgtgtct ttatccctgt ctgaaaagac tgggtaaccc
388     1381 gtggaacttc cttcgtgatt gggatagggg cttgcaattg ttccccttga acgaggaatt
389     1441 c
390//
391LOCUS       ABYMTRR12S    952 bp ss-rRNA            RNA       10-DEC-1992
392DEFINITION  Amblysomus hottentotus mitochondrial 12S ribosomal RNA.
393ACCESSION   M95108
394KEYWORDS    12S ribosomal RNA.
395SOURCE      Amblysomus hottentotus (organelle Mitochondrion Amblysomus
396            hottentotus) liver rRNA.
397  ORGANISM  Amblysomus hottentotus
398            Eukaryota; Animalia; Chordata; Vertebrata; Mammalia; Theria;
399            Eutheria; Insectivora; Lipotyphla; Chrysochloridae.
400REFERENCE   1  (bases 1 to 952)
401  AUTHORS   Allard,M.W. and Miyamoto,M.M.
402  TITLE     Testing phylogenetic approaches with empirical data as illustrated
403            with the parsimony method
404  JOURNAL   Mol. Biol. Evol. 9, 778-786 (1992)
405  STANDARD  full automatic
406FEATURES             Location/Qualifiers
407     rRNA            1..952
408                     /product="12S ribosomal RNA"
409                     /gene="12S rRNA"
410     source          1..952
411                     /organism="Amblysomus hottentotus"
412BASE COUNT      347 a    187 c    161 g    257 t
413ORIGIN     
414        1 taaaggtttg gtcctggcct ttttattagt tggtagtaaa attatacatg caagtttcag
415       61 caacccagtg agaataccct ttaaatctgc tagattaata ggagtaggta tcaagcacac
416      121 cattaggtag ctaataacac cttgcttagc cacaccccca cgggttacag cagtaacaaa
417      181 aatttagcaa ttaacgaaag ttagactaag ttatactact ctagggttgg taaatttcgt
418      241 gccagccacc gcggtcatac gattaaccca aactaataaa taccggcgta aagcgtgttc
419      301 aggggaaaca aaacaataaa gatgaaatat ttctacactg taaaaagtta tagaagtact
420      361 aaaaatatac tacgaaagtg actttattac accttacaac acgatagcta agacacaaac
421      421 tgggattaga taccccacta tgcttagccc taaactttaa taatttaaaa caaaattatt
422      481 cgccagagaa ctactagcaa tagcctaaaa cttaaaggac ttggcggtgc tttatatcca
423      541 cctagaggag cctgttatat aatcgataaa ccccgataaa cctcaccact tcttgctaat
424      601 ccagtctata taccgccatc ttcagcaaac ccttaaaagg caaaacagta agcttaataa
425      661 tttccataaa aacgttaggt caaggtgtag cctatgtagt ggtattcaat gggctacatt
426      721 ttctgatcca gaacattctt aacggatatt tttatgaaat taaaaattaa aggaggattt
427      781 agtagtaaac taagaataga gagcttagtt gaattaggcc atgaagcacg tacacaccgc
428      841 ccgtcaccct cctcaagtaa ctatattcta ttaaacatat tttatcctaa taaatacaag
429      901 aggagataag tcgtaacaag gtaagcatac tggaaagtgt gcttggaaaa ct
430//
431LOCUS       ACARR58S      162 bp ss-rRNA            RNA       15-MAR-1989
432DEFINITION  A.castellanii (amoeba) 5.8S ribosomal RNA.
433ACCESSION   K00471
434KEYWORDS    5.8S ribosomal RNA; ribosomal RNA.
435SOURCE      A.castellani (amoeba; strain ATCC 30010) rRNA.
436  ORGANISM  Acanthamoeba castellanii
437            Eukaryota; Animalia; Protozoa; Sarcomastigophora; Sarcodina;
438            Rhizopoda; Lobosa; Gymnamoeba; Amoebida; Acanthopodina;
439            Acanthamoebidae.
440REFERENCE   1  (bases 1 to 162)
441  AUTHORS   Mackay,R.M. and Doolittle,W.F.
442  TITLE     Nucleotide sequences of AcanthamoebA.castellanii 5S and 5.8S
443            ribosomal ribonucleic acids: Phylogenetic and comparative
444            structural analyses
445  JOURNAL   Nucleic Acids Res. 9, 3321-3334 (1981)
446  STANDARD  full automatic
447COMMENT     [1] also sequenced A.castellanii 5S rRNA <K03160>.
448FEATURES             Location/Qualifiers
449     rRNA            1..162
450                     /note="5.8S rRNA"
451     source          1..162
452                     /organism="Acanthamoeba castellanii"
453BASE COUNT       40 a     39 c     44 g     39 t
454ORIGIN      5' end of mature rRNA.
455        1 aactcctaac aacggatatc ttggttctcg cgaggatgaa gaacgcagcg aaatgcgata
456       61 cgtagtgtga atcgcaggga tcagtgaatc atcgaatctt tgaacgcaag ttgcgctctc
457      121 gtggtttaac cccccgggag cacgttcgct tgagtgccgc tt
458//
459LOCUS       ACARRDX       119 bp ss-rRNA            RNA       15-SEP-1990
460DEFINITION  A.castellani 5S ribosomal RNA.
461ACCESSION   M28984
462KEYWORDS    5S ribosomal RNA.
463SOURCE      A.castellani ribosomal RNA from Viluy encephalomyelitis patient
464            KPN..
465  ORGANISM  Acanthamoeba castellanii
466            Eukaryota; Animalia; Protozoa; Sarcomastigophora; Sarcodina;
467            Rhizopoda; Lobosa; Gymnamoeba; Amoebida; Acanthopodina;
468            Acanthamoebidae.
469REFERENCE   1  (bases 1 to 119)
470  AUTHORS   Chumakov,K.M. and Karavanov,A.S.
471  TITLE     Preliminary characterization of an organism isolated from a case of
472            Viluy encephalomyelitis indicates a protozoal, rather than viral,
473            aetiology
474  JOURNAL   J. Gen. Microbiol. 132, 1127-1133 (1986)
475  STANDARD  full automatic
476FEATURES             Location/Qualifiers
477     rRNA            1..119
478                     /note="5S ribosomal RNA"
479     source          1..119
480                     /organism="Acanthamoeba castellanii"
481BASE COUNT       26 a     36 c     37 g     20 t
482ORIGIN     
483        1 ggatacggcc atactgcgca gaaagcaccg cttcccatcc gaacagcgaa gttaagctgc
484       61 gcgaggcggt gttagtactg gggtgggcga ccacccggga atccaccgtg ccgtatcct
485//
486LOCUS       ACARRJJE      241 bp ss-rRNA            RNA       05-NOV-1990
487DEFINITION  A.castellanii 18S ribosomal RNA.
488ACCESSION   M57865 M33241
489KEYWORDS    18S ribosomal RNA.
490SOURCE      A.castellanii (strain 013) ribosomal RNA.
491  ORGANISM  Acanthamoeba castellanii
492            Eukaryota; Animalia; Protozoa; Sarcomastigophora; Sarcodina;
493            Rhizopoda; Lobosa; Gymnamoeba; Amoebida; Acanthopodina;
494            Acanthamoebidae.
495REFERENCE   1  (bases 1 to 241)
496  AUTHORS   Johnson,A.M., Fielke,R., Christy,P.E., Robinson,B. and
497            Baverstock,P.R.
498  TITLE     Small subunit ribosomal RNA evolution in the genus Acanthamoeba
499  JOURNAL   J. Gen. Microbiol. 136, 1689-1698 (1990)
500  STANDARD  full automatic
501FEATURES             Location/Qualifiers
502     source          1..241
503                     /organism="Acanthamoeba castellanii"
504BASE COUNT       60 a     39 c     57 g     48 t     37 others
505ORIGIN      A region.
506        1 ccctatnaac tttngatggt ngatagaggc ctncatggtc gtaangcggt annggagaat
507       61 tagggttnga ttgcnggann anngagccgt gagaaatcgg ctnnccatct tntaaggnng
508      121 gcagcaggng cnnnnattac ccnatccgac nnggggagng nntgacaata aataacaata
509      181 caggcgctcg ataagagnct tgtaattgga atgagtacaa tttaancccc ttancnnntn
510      241 n
511//
512LOCUS       ACARRJJEA     258 bp ss-rRNA            RNA       05-NOV-1990
513DEFINITION  A.castellanii 18S ribosomal RNA.
514ACCESSION   M57866 M33242
515KEYWORDS    18S ribosomal RNA.
516SOURCE      A.castellanii (strain 010) ribosomal RNA.
517  ORGANISM  Acanthamoeba castellanii
518            Eukaryota; Animalia; Protozoa; Sarcomastigophora; Sarcodina;
519            Rhizopoda; Lobosa; Gymnamoeba; Amoebida; Acanthopodina;
520            Acanthamoebidae.
521REFERENCE   1  (bases 1 to 258)
522  AUTHORS   Johnson,A.M., Fielke,R., Christy,P.E., Robinson,B. and
523            Baverstock,P.R.
524  TITLE     Small subunit ribosomal RNA evolution in the genus Acanthamoeba
525  JOURNAL   J. Gen. Microbiol. 136, 1689-1698 (1990)
526  STANDARD  full automatic
527FEATURES             Location/Qualifiers
528     source          1..258
529                     /organism="Acanthamoeba castellanii"
530BASE COUNT       67 a     43 c     66 g     56 t     26 others
531ORIGIN      A region.
532        1 aaaatttctn ccctatacaa ctttngatgg tagnatagag gcctacnatg gtcagtaang
533       61 cggtancgnn naattagggt tcgattnccc gagannnnng agctctgaga aatcggctnc
534      121 catcttgcta nangggnngg cagcaggcgc nnnaattngc ccagagtcgc agacnngggg
535      181 aggtgatgtg agctatataa agtgagatca atacaggcgg cctcgataag agtcttgtaa
536      241 ttggaatgag tacaattt
537//
538LOCUS       ACARRJJEB     257 bp ss-rRNA            RNA       05-NOV-1990
539DEFINITION  A.castellanii 18S ribosomal RNA.
540ACCESSION   M57867 M33243
541KEYWORDS    18S ribosomal RNA.
542SOURCE      A.castellanii (strain 102) ribosomal RNA.
543  ORGANISM  Acanthamoeba castellanii
544            Eukaryota; Animalia; Protozoa; Sarcomastigophora; Sarcodina;
545            Rhizopoda; Lobosa; Gymnamoeba; Amoebida; Acanthopodina;
546            Acanthamoebidae.
547REFERENCE   1  (bases 1 to 257)
548  AUTHORS   Johnson,A.M., Fielke,R., Christy,P.E., Robinson,B. and
549            Baverstock,P.R.
550  TITLE     Small subunit ribosomal RNA evolution in the genus Acanthamoeba
551  JOURNAL   J. Gen. Microbiol. 136, 1689-1698 (1990)
552  STANDARD  full automatic
553FEATURES             Location/Qualifiers
554     source          1..257
555                     /organism="Acanthamoeba castellanii"
556BASE COUNT       66 a     50 c     66 g     56 t     19 others
557ORIGIN      A region.
558        1 acggcgacga ttcattacaa atttctgccc tatcancttt cgatggtagg atagaggtcc
559       61 taccatggtc gtaacgcggt aacggagaat tagggttcga ttnccggann anngagccgt
560      121 gagaaatcgg ctnccntctt gcntgaaggg nnggcagcag gcgcnnnaat tncccaatcc
561      181 gacnngggga ggtngtgnca ataaataatc aatacaggcc ctcgataaga gtcttgtaat
562      241 tggaatgagt gacaatt
563//
564LOCUS       ACARRJJEC     261 bp ss-rRNA            RNA       05-NOV-1990
565DEFINITION  A.castellanii 18S ribosomal RNA.
566ACCESSION   M57868 M33244
567KEYWORDS    18S ribosomal RNA.
568SOURCE      A.castellanii (strain 014) ribosomal RNA.
569  ORGANISM  Acanthamoeba castellanii
570            Eukaryota; Animalia; Protozoa; Sarcomastigophora; Sarcodina;
571            Rhizopoda; Lobosa; Gymnamoeba; Amoebida; Acanthopodina;
572            Acanthamoebidae.
573REFERENCE   1  (bases 1 to 261)
574  AUTHORS   Johnson,A.M., Fielke,R., Christy,P.E., Robinson,B. and
575            Baverstock,P.R.
576  TITLE     Small subunit ribosomal RNA evolution in the genus Acanthamoeba
577  JOURNAL   J. Gen. Microbiol. 136, 1689-1698 (1990)
578  STANDARD  full automatic
579FEATURES             Location/Qualifiers
580     source          1..261
581                     /organism="Acanthamoeba castellanii"
582BASE COUNT       71 a     46 c     69 g     55 t     20 others
583ORIGIN      A region.
584        1 ggcgacgatt cattacaaat ttctgcccta tcaactttcg atggtaggat agaggcctac
585       61 catggtcgta angcggtaac ggngaatata gggttcgatt ncnnnagann nngagcctga
586      121 gaaatcggct nccatcttnc taagggnngg cagcaggcgc nnnaattacc caagtccaga
587      181 cnnggggagg tgagtgagca atanaagtga gatcaataca ggcgctcgat aagagtcttg
588      241 taattggaat gagtgacaat t
589//
590LOCUS       ACARRJJED     223 bp ss-rRNA            RNA       05-NOV-1990
591DEFINITION  A.castellanii 18S ribosomal RNA.
592ACCESSION   M57869 M33245
593KEYWORDS    18S ribosomal RNA.
594SOURCE      A.castellanii (strain 001) ribosomal RNA.
595  ORGANISM  Acanthamoeba castellanii
596            Eukaryota; Animalia; Protozoa; Sarcomastigophora; Sarcodina;
597            Rhizopoda; Lobosa; Gymnamoeba; Amoebida; Acanthopodina;
598            Acanthamoebidae.
599REFERENCE   1  (bases 1 to 223)
600  AUTHORS   Johnson,A.M., Fielke,R., Christy,P.E., Robinson,B. and
601            Baverstock,P.R.
602  TITLE     Small subunit ribosomal RNA evolution in the genus Acanthamoeba
603  JOURNAL   J. Gen. Microbiol. 136, 1689-1698 (1990)
604  STANDARD  full automatic
605FEATURES             Location/Qualifiers
606     source          1..223
607                     /organism="Acanthamoeba castellanii"
608BASE COUNT       61 a     42 c     55 g     43 t     22 others
609ORIGIN      A region.
610        1 ncctgcccta tnaacttcga tggtaggata gaggcctacn tngtcgtaag gggnancgnn
611       61 naattagggn tncnattccg gaaanngagc ctgagaaatc ggctaccact tctaaggnng
612      121 gcagcaggcg cnnnaattac ccaatccgac nnggggaggt agtgacaata aataacnata
613      181 caggcgctcg acaagagtct tgtaattgga atgagtacaa ttt
614//
615LOCUS       ACARRJJEE     209 bp ss-rRNA            RNA       05-NOV-1990
616DEFINITION  A.castellanii 18S ribosomal RNA.
617ACCESSION   M57870 M33246
618KEYWORDS    18S ribosomal RNA.
619SOURCE      A.castellanii (strain 151) ribosomal RNA.
620  ORGANISM  Acanthamoeba castellanii
621            Eukaryota; Animalia; Protozoa; Sarcomastigophora; Sarcodina;
622            Rhizopoda; Lobosa; Gymnamoeba; Amoebida; Acanthopodina;
623            Acanthamoebidae.
624REFERENCE   1  (bases 1 to 209)
625  AUTHORS   Johnson,A.M., Fielke,R., Christy,P.E., Robinson,B. and
626            Baverstock,P.R.
627  TITLE     Small subunit ribosomal RNA evolution in the genus Acanthamoeba
628  JOURNAL   J. Gen. Microbiol. 136, 1689-1698 (1990)
629  STANDARD  full automatic
630FEATURES             Location/Qualifiers
631     source          1..209
632                     /organism="Acanthamoeba castellanii"
633BASE COUNT       50 a     40 c     51 g     40 t     28 others
634ORIGIN      A region.
635        1 atggtaggat agaggcctac acatcggtcg taaccgggnn ccgnnnaatt agggttcgat
636       61 tccggaannn agcctgagaa atggctaccc acttctaagg nggcagcagg cgcnnnnatt
637      121 ccnnatccgn nncggggagn tagtgacaat aaataacnat acaggtctcg annngagtct
638      181 tgtnattggn atgagtacaa tttnnnccc
639//
640LOCUS       ACARRJJEF     187 bp ss-rRNA            RNA       05-NOV-1990
641DEFINITION  A.castellanii 18S ribosomal RNA.
642ACCESSION   M57871 M33247
643KEYWORDS    18S ribosomal RNA.
644SOURCE      A.castellanii (strain 009) ribosomal RNA.
645  ORGANISM  Acanthamoeba castellanii
646            Eukaryota; Animalia; Protozoa; Sarcomastigophora; Sarcodina;
647            Rhizopoda; Lobosa; Gymnamoeba; Amoebida; Acanthopodina;
648            Acanthamoebidae.
649REFERENCE   1  (bases 1 to 187)
650  AUTHORS   Johnson,A.M., Fielke,R., Christy,P.E., Robinson,B. and
651            Baverstock,P.R.
652  TITLE     Small subunit ribosomal RNA evolution in the genus Acanthamoeba
653  JOURNAL   J. Gen. Microbiol. 136, 1689-1698 (1990)
654  STANDARD  full automatic
655FEATURES             Location/Qualifiers
656     source          1..187
657                     /organism="Acanthamoeba castellanii"
658BASE COUNT       44 a     32 c     43 g     35 t     33 others
659ORIGIN      A region.
660        1 gtcgtaancg ggnnncgnnn aatagggttc gattccggan nnngagcctg agaaatggct
661       61 nccacttcta agnnggcagc aggcgnnnnn attncccaat gccgnnnngg ggaantagtg
662      121 aacaataaat aacnatacag gtctcgannn gagtcttgta attggnatga gtacaatttn
663      181 nccccnt
664//
665LOCUS       ACARRJJEG     247 bp ss-rRNA            RNA       05-NOV-1990
666DEFINITION  A.castellanii 18S ribosomal RNA.
667ACCESSION   M57872 M33248
668KEYWORDS    18S ribosomal RNA.
669SOURCE      A.castellanii (strain 013) ribosomal RNA.
670  ORGANISM  Acanthamoeba castellanii
671            Eukaryota; Animalia; Protozoa; Sarcomastigophora; Sarcodina;
672            Rhizopoda; Lobosa; Gymnamoeba; Amoebida; Acanthopodina;
673            Acanthamoebidae.
674REFERENCE   1  (bases 1 to 247)
675  AUTHORS   Johnson,A.M., Fielke,R., Christy,P.E., Robinson,B. and
676            Baverstock,P.R.
677  TITLE     Small subunit ribosomal RNA evolution in the genus Acanthamoeba
678  JOURNAL   J. Gen. Microbiol. 136, 1689-1698 (1990)
679  STANDARD  full automatic
680FEATURES             Location/Qualifiers
681     source          1..247
682                     /organism="Acanthamoeba castellanii"
683BASE COUNT       49 a     41 c     58 g     47 t     52 others
684ORIGIN      B region.
685        1 ganagttann nnatngaann cnatnngata annntcgtag tnnnnaccat aagaactgat
686       61 gtcnnagcgc agactgactt aatgnggagc agcgtgtgnt agtntcataa tactatccac
687      121 nantcggcgc ggtngtcctt ggcgtcngtc cnnttcaacg ggnnnnggcg nnaggncggt
688      181 ttagcnggtn nnaccggtga atgactcccc nngcngcttg tgagaaatca taagnnnntg
689      241 ggnnnnn
690//
691LOCUS       ACARRJJEH     278 bp ss-rRNA            RNA       05-NOV-1990
692DEFINITION  A.castellanii 18S ribosomal RNA.
693ACCESSION   M57873 M33249
694KEYWORDS    18S ribosomal RNA.
695SOURCE      A.castellanii (strain 010) ribosomal RNA.
696  ORGANISM  Acanthamoeba castellanii
697            Eukaryota; Animalia; Protozoa; Sarcomastigophora; Sarcodina;
698            Rhizopoda; Lobosa; Gymnamoeba; Amoebida; Acanthopodina;
699            Acanthamoebidae.
700REFERENCE   1  (bases 1 to 278)
701  AUTHORS   Johnson,A.M., Fielke,R., Christy,P.E., Robinson,B. and
702            Baverstock,P.R.
703  TITLE     Small subunit ribosomal RNA evolution in the genus Acanthamoeba
704  JOURNAL   J. Gen. Microbiol. 136, 1689-1698 (1990)
705  STANDARD  full automatic
706FEATURES             Location/Qualifiers
707     source          1..278
708                     /organism="Acanthamoeba castellanii"
709BASE COUNT       63 a     56 c     65 g     57 t     37 others
710ORIGIN      B region.
711        1 ctgccaagca ctnnnttcaa ttantnaann nnganagtta agggaatacg aaggactgat
712       61 cagataacng tcgtaggtcn nnatctctat tacagacgaa ttgcnnagcg nancgattaa
713      121 ggaggangtg tggcatagtc atcaatacat acnccacnat cggcgcngtn gtccttggcg
714      181 gtgtctcngc ttcacggccn ngncgcgcna nggncggttt acgcnggtnn naccggtgaa
715      241 tgnctcccct agcagtcgtt gtgagaaatc ataagnnt
716//
717LOCUS       ACARRJJEI     250 bp ss-rRNA            RNA       05-NOV-1990
718DEFINITION  A.castellanii 18S ribosomal RNA.
719ACCESSION   M57874 M33250
720KEYWORDS    18S ribosomal RNA.
721SOURCE      A.castellanii (strain 102) ribosomal RNA.
722  ORGANISM  Acanthamoeba castellanii
723            Eukaryota; Animalia; Protozoa; Sarcomastigophora; Sarcodina;
724            Rhizopoda; Lobosa; Gymnamoeba; Amoebida; Acanthopodina;
725            Acanthamoebidae.
726REFERENCE   1  (bases 1 to 250)
727  AUTHORS   Johnson,A.M., Fielke,R., Christy,P.E., Robinson,B. and
728            Baverstock,P.R.
729  TITLE     Small subunit ribosomal RNA evolution in the genus Acanthamoeba
730  JOURNAL   J. Gen. Microbiol. 136, 1689-1698 (1990)
731  STANDARD  full automatic
732FEATURES             Location/Qualifiers
733     source          1..250
734                     /organism="Acanthamoeba castellanii"
735BASE COUNT       59 a     47 c     61 g     51 t     32 others
736ORIGIN      B region.
737        1 ccattaatca aanngacaag ttgatgggga tcngaagaac gactcagact acngtgcgta
738       61 gtcnnnacca taaacgatgc ngacnagcga ttaggagaag cgttgagatc atcgacataa
739      121 ctacccacca tccggtgcgg tcggttcttn gnnngtcgtt ggnctcgcnn gnnnatggng
740      181 tnnnggggcn atttanctga tgnnatnggt gaatgnctcc cctagcagct tgtgagaaat
741      241 cataagnntn
742//
743LOCUS       ACARRJJEJ     271 bp ss-rRNA            RNA       05-NOV-1990
744DEFINITION  A.castellanii 18S ribosomal RNA.
745ACCESSION   M57875 M33251
746KEYWORDS    18S ribosomal RNA.
747SOURCE      A.castellanii (strain 014) ribosomal RNA.
748  ORGANISM  Acanthamoeba castellanii
749            Eukaryota; Animalia; Protozoa; Sarcomastigophora; Sarcodina;
750            Rhizopoda; Lobosa; Gymnamoeba; Amoebida; Acanthopodina;
751            Acanthamoebidae.
752REFERENCE   1  (bases 1 to 271)
753  AUTHORS   Johnson,A.M., Fielke,R., Christy,P.E., Robinson,B. and
754            Baverstock,P.R.
755  TITLE     Small subunit ribosomal RNA evolution in the genus Acanthamoeba
756  JOURNAL   J. Gen. Microbiol. 136, 1689-1698 (1990)
757  STANDARD  full automatic
758FEATURES             Location/Qualifiers
759     source          1..271
760                     /organism="Acanthamoeba castellanii"
761BASE COUNT       81 a     51 c     63 g     58 t     18 others
762ORIGIN      B region.
763        1 atttagtgaa agattaccgt tctgcnagac acgcatctag ccaagagatg nnttcagtta
764       61 atcaaggnng aagacgtgta gcgggatcga gagacgatca gatacngtcg tagtcnnnag
765      121 cgcataaacg atgccgacca gcgattagga gacgttgaat acaaaacacc accatacata
766      181 attcagtaca tggccagtca aatggttgtg natnnnttgt gtatgnnacc ggtgaatgnc
767      241 tcccctagca gcttgtgaga aatcataagn n
768//
769LOCUS       ACARRJJEK     248 bp ss-rRNA            RNA       05-NOV-1990
770DEFINITION  A.castellanii 18S ribosomal RNA.
771ACCESSION   M57876 M33252
772KEYWORDS    18S ribosomal RNA.
773SOURCE      A.castellanii (strain 001) ribosomal RNA.
774  ORGANISM  Acanthamoeba castellanii
775            Eukaryota; Animalia; Protozoa; Sarcomastigophora; Sarcodina;
776            Rhizopoda; Lobosa; Gymnamoeba; Amoebida; Acanthopodina;
777            Acanthamoebidae.
778REFERENCE   1  (bases 1 to 248)
779  AUTHORS   Johnson,A.M., Fielke,R., Christy,P.E., Robinson,B. and
780            Baverstock,P.R.
781  TITLE     Small subunit ribosomal RNA evolution in the genus Acanthamoeba
782  JOURNAL   J. Gen. Microbiol. 136, 1689-1698 (1990)
783  STANDARD  full automatic
784FEATURES             Location/Qualifiers
785     source          1..248
786                     /organism="Acanthamoeba castellanii"
787BASE COUNT       70 a     47 c     56 g     58 t     17 others
788ORIGIN      B region.
789        1 gcgaaagcat ctgccaagga ngnnttcatt aatcaagnng aaagttaggg gatcgaagac
790       61 gancagatnc ngtcgtagtc nnaccataaa cgatgccgac cagcgattag gagacgttga
791      121 atacaaaaca ccatccattt agcatggtcg ntttcaaata ttcctttttg cgaaggttgt
792      181 ttgggaacnn ttcgtcctga tgnatctggn gaatgactcc cctagcagct tgtgagaaat
793      241 cataagnn
794//
795LOCUS       ACARRJJEL     217 bp ss-rRNA            RNA       05-NOV-1990
796DEFINITION  A.castellanii 18S ribosomal RNA.
797ACCESSION   M57877 M33253
798KEYWORDS    18S ribosomal RNA.
799SOURCE      A.castellanii (strain 151) ribosomal RNA.
800  ORGANISM  Acanthamoeba castellanii
801            Eukaryota; Animalia; Protozoa; Sarcomastigophora; Sarcodina;
802            Rhizopoda; Lobosa; Gymnamoeba; Amoebida; Acanthopodina;
803            Acanthamoebidae.
804REFERENCE   1  (bases 1 to 217)
805  AUTHORS   Johnson,A.M., Fielke,R., Christy,P.E., Robinson,B. and
806            Baverstock,P.R.
807  TITLE     Small subunit ribosomal RNA evolution in the genus Acanthamoeba
808  JOURNAL   J. Gen. Microbiol. 136, 1689-1698 (1990)
809  STANDARD  full automatic
810FEATURES             Location/Qualifiers
811     source          1..217
812                     /organism="Acanthamoeba castellanii"
813BASE COUNT       49 a     48 c     52 g     43 t     25 others
814ORIGIN      B region.
815        1 cattcaatca annnaaagta ggatcgaagt cgattagatn nngtcgtagt cttaaccata
816       61 aaccatgcca ccagcgattg ggcgacgttt cacnnggaag tggnnccggn ggggggcgcc
817      121 nctttgctct gtnnnnnagn ncngagcaga gcnnnnntcc tttgggctgc ttccactaaa
818      181 ggatgactcc cccagcagct tgtgagaaat catcaag
819//
820LOCUS       ACARRJJEM     255 bp ss-rRNA            RNA       05-NOV-1990
821DEFINITION  A.castellanii 18S ribosomal RNA.
822ACCESSION   M57878 M33254
823KEYWORDS    18S ribosomal RNA.
824SOURCE      A.castellanii (strain 009) ribosomal RNA.
825  ORGANISM  Acanthamoeba castellanii
826            Eukaryota; Animalia; Protozoa; Sarcomastigophora; Sarcodina;
827            Rhizopoda; Lobosa; Gymnamoeba; Amoebida; Acanthopodina;
828            Acanthamoebidae.
829REFERENCE   1  (bases 1 to 255)
830  AUTHORS   Johnson,A.M., Fielke,R., Christy,P.E., Robinson,B. and
831            Baverstock,P.R.
832  TITLE     Small subunit ribosomal RNA evolution in the genus Acanthamoeba
833  JOURNAL   J. Gen. Microbiol. 136, 1689-1698 (1990)
834  STANDARD  full automatic
835FEATURES             Location/Qualifiers
836     source          1..255
837                     /organism="Acanthamoeba castellanii"
838BASE COUNT       62 a     53 c     67 g     56 t     17 others
839ORIGIN      B region.
840        1 ttatgaaaga ttacttctgc gaaagcatct gccaaggatg ttttcattaa tcaagnngaa
841       61 agttagggga tcgaagacga ttagatacng tcgtagtctt aaccataaac catgccgacc
842      121 agcgattggg ngacgtttca cacggaggtt ggcncgggcg ccgtgccnnt gtcgcgcaag
843      181 cggcaggcgc gannnntttt gggcngcttc cnctnaagga tgactccnnn agcagcttgt
844      241 gagaaatcat caagt
845//
846LOCUS       ACARRJJEN     108 bp ss-rRNA            RNA       05-NOV-1990
847DEFINITION  A.castellanii 18S ribosomal RNA.
848ACCESSION   M57879 M33255
849KEYWORDS    18S ribosomal RNA.
850SOURCE      A.castellanii (strain 013) ribosomal RNA.
851  ORGANISM  Acanthamoeba castellanii
852            Eukaryota; Animalia; Protozoa; Sarcomastigophora; Sarcodina;
853            Rhizopoda; Lobosa; Gymnamoeba; Amoebida; Acanthopodina;
854            Acanthamoebidae.
855REFERENCE   1  (bases 1 to 108)
856  AUTHORS   Johnson,A.M., Fielke,R., Christy,P.E., Robinson,B. and
857            Baverstock,P.R.
858  TITLE     Small subunit ribosomal RNA evolution in the genus Acanthamoeba
859  JOURNAL   J. Gen. Microbiol. 136, 1689-1698 (1990)
860  STANDARD  full automatic
861FEATURES             Location/Qualifiers
862     source          1..108
863                     /organism="Acanthamoeba castellanii"
864BASE COUNT       20 a     17 c     16 g     30 t     25 others
865ORIGIN      C region.
866        1 cngnnnnann tnttgcaaan tttnatcgtn ctncngatng ctcnntgtaa ttnttagatg
867       61 ctatcganan gnnnnattcc tngtaatncc gagtactatg cagtcgtc
868//
869LOCUS       ACARRJJEO     131 bp ss-rRNA            RNA       05-NOV-1990
870DEFINITION  A.castellanii 18S ribosomal RNA.
871ACCESSION   M57880 M33256
872KEYWORDS    18S ribosomal RNA.
873SOURCE      A.castellanii (strain 010) ribosomal RNA.
874  ORGANISM  Acanthamoeba castellanii
875            Eukaryota; Animalia; Protozoa; Sarcomastigophora; Sarcodina;
876            Rhizopoda; Lobosa; Gymnamoeba; Amoebida; Acanthopodina;
877            Acanthamoebidae.
878REFERENCE   1  (bases 1 to 131)
879  AUTHORS   Johnson,A.M., Fielke,R., Christy,P.E., Robinson,B. and
880            Baverstock,P.R.
881  TITLE     Small subunit ribosomal RNA evolution in the genus Acanthamoeba
882  JOURNAL   J. Gen. Microbiol. 136, 1689-1698 (1990)
883  STANDARD  full automatic
884FEATURES             Location/Qualifiers
885     source          1..131
886                     /organism="Acanthamoeba castellanii"
887BASE COUNT       26 a     16 c     32 g     37 t     20 others
888ORIGIN      C region.
889        1 gncggctgan tcnnnnatnt ggcagcntgg gcnnanaggt ctgnnnnatc tttgcaaatt
890       61 taatcgtgct tggggataga tcattgtaat tattgatgnt tcgaagnngg nattcctagt
891      121 tatangcgag t
892//
893LOCUS       ACARRJJEP     111 bp ss-rRNA            RNA       05-NOV-1990
894DEFINITION  A.castellanii 18S ribosomal RNA.
895ACCESSION   M57881 M33257
896KEYWORDS    18S ribosomal RNA.
897SOURCE      A.castellanii (strain 102) ribosomal RNA.
898  ORGANISM  Acanthamoeba castellanii
899            Eukaryota; Animalia; Protozoa; Sarcomastigophora; Sarcodina;
900            Rhizopoda; Lobosa; Gymnamoeba; Amoebida; Acanthopodina;
901            Acanthamoebidae.
902REFERENCE   1  (bases 1 to 111)
903  AUTHORS   Johnson,A.M., Fielke,R., Christy,P.E., Robinson,B. and
904            Baverstock,P.R.
905  TITLE     Small subunit ribosomal RNA evolution in the genus Acanthamoeba
906  JOURNAL   J. Gen. Microbiol. 136, 1689-1698 (1990)
907  STANDARD  full automatic
908FEATURES             Location/Qualifiers
909     source          1..111
910                     /organism="Acanthamoeba castellanii"
911BASE COUNT       24 a     15 c     22 g     32 t     18 others
912ORIGIN      C region.
913        1 gtngtcnnng atngncctgg gcnnataggt cagnnnnatc tttncaaatt taatcgtgct
914       61 ggggatanat cattgtaatt attgatcttc aannnggnat tcctagtaag c
915//
916LOCUS       ACARRJJEQ     141 bp ss-rRNA            RNA       05-NOV-1990
917DEFINITION  A.castellanii 18S ribosomal RNA.
918ACCESSION   M57882 M33258
919KEYWORDS    18S ribosomal RNA.
920SOURCE      A.castellanii (strain 014) ribosomal RNA.
921  ORGANISM  Acanthamoeba castellanii
922            Eukaryota; Animalia; Protozoa; Sarcomastigophora; Sarcodina;
923            Rhizopoda; Lobosa; Gymnamoeba; Amoebida; Acanthopodina;
924            Acanthamoebidae.
925REFERENCE   1  (bases 1 to 141)
926  AUTHORS   Johnson,A.M., Fielke,R., Christy,P.E., Robinson,B. and
927            Baverstock,P.R.
928  TITLE     Small subunit ribosomal RNA evolution in the genus Acanthamoeba
929  JOURNAL   J. Gen. Microbiol. 136, 1689-1698 (1990)
930  STANDARD  full automatic
931FEATURES             Location/Qualifiers
932     source          1..141
933                     /organism="Acanthamoeba castellanii"
934BASE COUNT       28 a     24 c     33 g     42 t     14 others
935ORIGIN      C region.
936        1 ggngtcaanc cgtatcgtat gttgctgtcc nngatntgcg cctgggccga taggtccgnn
937       61 nnatctttnc aaatttaatc gtgcttgggg atagatcatt gtaattattg atcttcaann
938      121 nggnattcct agtaagcgag t
939//
940LOCUS       ACARRJJER     237 bp ss-rRNA            RNA       05-NOV-1990
941DEFINITION  A.castellanii 18S ribosomal RNA.
942ACCESSION   M57883 M33259
943KEYWORDS    18S ribosomal RNA.
944SOURCE      A.castellanii (strain 001) ribosomal RNA.
945  ORGANISM  Acanthamoeba castellanii
946            Eukaryota; Animalia; Protozoa; Sarcomastigophora; Sarcodina;
947            Rhizopoda; Lobosa; Gymnamoeba; Amoebida; Acanthopodina;
948            Acanthamoebidae.
949REFERENCE   1  (bases 1 to 237)
950  AUTHORS   Johnson,A.M., Fielke,R., Christy,P.E., Robinson,B. and
951            Baverstock,P.R.
952  TITLE     Small subunit ribosomal RNA evolution in the genus Acanthamoeba
953  JOURNAL   J. Gen. Microbiol. 136, 1689-1698 (1990)
954  STANDARD  full automatic
955FEATURES             Location/Qualifiers
956     source          1..237
957                     /organism="Acanthamoeba castellanii"
958BASE COUNT       49 a     43 c     46 g     67 t     32 others
959ORIGIN      C region.
960        1 nnnnagatnt nctcgggnnc angcgcgcta cactgattaa ttcaacgagt cnncttcaan
961       61 cnaggcgtag atnngttttg gtttgtgtna gncatcaacc aanactattt ctgcncttcc
962      121 nnnatcgcgc ctgggccgat aggttctggn naatctttgc aaatttaact nctgtgctng
963      181 gggatagatc tacttgtaat tattgatctt caantnggna ttcctagtaa ngnnagt
964//
965LOCUS       ACARRJJES     174 bp ss-rRNA            RNA       05-NOV-1990
966DEFINITION  A.castellanii 18S ribosomal RNA.
967ACCESSION   M57884 M33260
968KEYWORDS    18S ribosomal RNA.
969SOURCE      A.castellanii (strain 151) ribosomal RNA.
970  ORGANISM  Acanthamoeba castellanii
971            Eukaryota; Animalia; Protozoa; Sarcomastigophora; Sarcodina;
972            Rhizopoda; Lobosa; Gymnamoeba; Amoebida; Acanthopodina;
973            Acanthamoebidae.
974REFERENCE   1  (bases 1 to 174)
975  AUTHORS   Johnson,A.M., Fielke,R., Christy,P.E., Robinson,B. and
976            Baverstock,P.R.
977  TITLE     Small subunit ribosomal RNA evolution in the genus Acanthamoeba
978  JOURNAL   J. Gen. Microbiol. 136, 1689-1698 (1990)
979  STANDARD  full automatic
980FEATURES             Location/Qualifiers
981     source          1..174
982                     /organism="Acanthamoeba castellanii"
983BASE COUNT       33 a     30 c     45 g     42 t     24 others
984ORIGIN      C region.
985        1 gcttgcgctc anaaggactg ggtccttcgt ncangnnagc ggggaggcgg cngnnctngt
986       61 ccctgggccg ataggatcta gnnnaatcct tgtgaaattt aatccgtgct ggggatagat
987      121 cattgtaatt attgatcttc annnnggnat tcctagtaan gnnagtnnnn agct
988//
989LOCUS       ACARRJJET     210 bp ss-rRNA            RNA       05-NOV-1990
990DEFINITION  A.castellanii 18S ribosomal RNA.
991ACCESSION   M57885 M33261
992KEYWORDS    18S ribosomal RNA.
993SOURCE      A.castellanii (strain 009) ribosomal RNA.
994  ORGANISM  Acanthamoeba castellanii
995            Eukaryota; Animalia; Protozoa; Sarcomastigophora; Sarcodina;
996            Rhizopoda; Lobosa; Gymnamoeba; Amoebida; Acanthopodina;
997            Acanthamoebidae.
998REFERENCE   1  (bases 1 to 210)
999  AUTHORS   Johnson,A.M., Fielke,R., Christy,P.E., Robinson,B. and
1000            Baverstock,P.R.
1001  TITLE     Small subunit ribosomal RNA evolution in the genus Acanthamoeba
1002  JOURNAL   J. Gen. Microbiol. 136, 1689-1698 (1990)
1003  STANDARD  full automatic
1004FEATURES             Location/Qualifiers
1005     source          1..210
1006                     /organism="Acanthamoeba castellanii"
1007BASE COUNT       36 a     40 c     52 g     57 t     25 others
1008ORIGIN      C region.
1009        1 attaattcca cgagttccac tgcnncntng tacgtgggtg gngcgtcgtn ctctgagatc
1010       61 gacaaggctg gtngtgcggc ntcgtnntgc ggcngcnctn tccctgggcc gataggtctg
1011      121 nnnnatcttt gtgaaattta atcgtgctcg gggatagatc attgtaatta ttgatcttca
1012      181 nnnnggnatt cctagtaang nnagtcatca
1013//
1014LOCUS       ACCRRSAA     1536 bp ss-rRNA            RNA       15-SEP-1990
1015DEFINITION  A.calcoaceticus 16S ribosomal RNA.
1016ACCESSION   M34139
1017KEYWORDS    16S ribosomal RNA.
1018SOURCE      A.calcoaceticus (strain 33604) ribosomal RNA.
1019  ORGANISM  Acinetobacter calcoaceticus
1020            Prokaryotae; Gracilicutes; Scotobacteria; Neisseriaceae.
1021REFERENCE   1  (bases 1 to 1536)
1022  AUTHORS   Woese,C.R.
1023  JOURNAL   Unpublished (1990)
1024  STANDARD  full automatic
1025COMMENT     Draft entry and computer-readable sequence for [1] kindly submitted
1026            by C.R.Woese, 09-MAY-1990.
1027             
1028              Author address: C.R.Woese
1029              University of Illinois
1030              Dept. Microbiology
1031              131 Burrill Hall
1032              407 S. Goodwin Ave.
1033              Urbana, IL 61801
1034              (217) 333-9369.
1035FEATURES             Location/Qualifiers
1036     rRNA            1..1536
1037                     /note="16S ribosomal RNA"
1038     source          1..1536
1039                     /organism="Acinetobacter calcoaceticus"
1040BASE COUNT      387 a    329 c    460 g    330 t     30 others
1041ORIGIN     
1042        1 ttaactgaag agtttgatca tggctcagat tgaacgctgg cggcaggctt aacacatgca
1043       61 agtcgagcgg ggaaggttgc ttcggtaact gactagcggc ggacgggtga gtaatgctta
1044      121 ggaatctgcc atttagtggg ggacaacatt ccgaanggaa tgctaatacc gcatacgtcc
1045      181 tacaggagaa agcaggggat ctccggacct tgcgctaaat gatgagccta agtcggatta
1046      241 gctagttggt ggggtaaagg cctaccaagg cgacgatctg tagcgggtct gagaggatga
1047      301 tccgccacac tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca gtggggaata
1048      361 ttggacaatg ggcgcaagcc ngatccagcc atgccgcgtg tgtgaagaag gccttttggt
1049      421 tgtaaagcac tttaagcgag gaggaggctc tcttagttaa tacctaagat gagtggacgt
1050      481 tactcgcaga ataagcaccg gctaactctg tgccagcagc cgcggtaata cagagngtgc
1051      541 gagcgttaat cggatttact gggcgtaaag cgtgcgtagg cggcttttta agtcggatgt
1052      601 gaaatccccg agcttaactt gggaattgca ttcgatactg ggaagctaga gtatgggaga
1053      661 ggatggtaga attccaggtg tagcggtgaa atgcgtagag atctggagga ataccgatgg
1054      721 cgaaggcagc catctggcct aatactgacg ctgaggtacg naagcatggg gagcaaacag
1055      781 gattagatac cctggtagtc catgccgtaa acgatgtcta ctagccgttg gggcctttga
1056      841 ggctttagtg gcgcagctaa cgcgataagt agactgcctg gggagtacgg tcgcaagact
1057      901 aaaactcaaa tgaattgacg ggggcncgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat
1058      961 gcaacgcgaa gaaccttacc tggccttgac atactagaaa ctttccagag atggattggt
1059     1021 gccttcggga atctagatac aggtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt
1060     1081 tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tttccttact tgccagcatt tcggatggga
1061     1141 actttaagga tactgccagt gacaaactgg aggaaggcgg ggacgacgtc aagtcatcat
1062     1201 ggcccttacg gctagggcta cacacgtgct acaatggtcg gtacaaaggg ttgctaccta
1063     1261 gcgataggat gctaatctca aaaagccgat cgtagttcgg attggagtct gcaactcgac
1064     1321 tccatgaagt cggaatcgct agtaatcgcg gatcagaatg ccgcggtgaa tacgttcccg
1065     1381 ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtttgtt gcaccagaag tagctagcct
1066     1441 aactgcaaag agggcggtta ccacggtgtg gccgatgact agggnnnnnn ngtaacaagn
1067     1501 nnnnnnnnnn ngaacctgnn nnnngatcac ctcctt
1068//
1069LOCUS       ACDRRAAC      122 bp ss-rRNA            RNA       15-MAR-1988
1070DEFINITION  Acidiphilium cryptum 5S ribosomal RNA.
1071ACCESSION   M11545
1072KEYWORDS    5S ribosomal RNA.
1073SOURCE      Acidiphilium cryptum (ATCC 33463) ribosomal RNA.
1074  ORGANISM  Acidiphilium cryptum
1075            Prokaryotae; Gracilicutes; Scotobacteria; Aerobic rods and cocci;
1076            Alcaligenaceae.
1077REFERENCE   1  (bases 1 to 122)
1078  AUTHORS   Lane,D.J., Stahl,D.A., Olsen,G.J., Heller,D.J. and Pace,N.R.
1079  TITLE     Phylogenetic analysis of the genera Thiobacillus and Thiomicrospira
1080            by 5S rRNA sequences
1081  JOURNAL   J. Bacteriol. 163, 75-81 (1985)
1082  STANDARD  full automatic
1083FEATURES             Location/Qualifiers
1084     rRNA            1..122
1085                     /note="5S ribosomal RNA"
1086     source          1..122
1087                     /organism="Acidiphilium cryptum"
1088BASE COUNT       22 a     44 c     37 g     19 t
1089ORIGIN      5' end of mature 5S rRNA.
1090        1 cgacctggtg gccattgcgg ggagcctgca cccgatccca tcccgaactc ggccgtgaaa
1091       61 atccccagcg cccatggtac tgtgcctcaa ggcacgggag agtaggtcgc cgccaggtcc
1092      121 tc
1093//
1094LOCUS       ACDRRDA01     316 bp ss-rRNA            RNA       24-JUN-1993
1095DEFINITION  Acidiphilium angustum 16S rRNA sequence.
1096ACCESSION   M79363
1097KEYWORDS    16S ribosomal RNA.
1098SEGMENT     1 of 3
1099SOURCE      Acidiphilium angustum (library: ATCC 35903) rRNA.
1100  ORGANISM  Acidiphilium angustum
1101            Prokaryotae; Gracilicutes; Scotobacteria; Aerobic rods and cocci;
1102            Alcaligenaceae.
1103REFERENCE   1  (bases 1 to 316)
1104  AUTHORS   Lane,D.J., Harrison,A.P., Stahl,D.A., Pace,B., Giovannoni,S.J.,
1105            Olsen,G.J. and Pace,N.R.
1106  TITLE     Evolutionary relationships among sulfur- and iron-oxidizing
1107            eubacteria
1108  JOURNAL   J. Bacteriol. 174, 269-278 (1992)
1109  STANDARD  full automatic
1110FEATURES             Location/Qualifiers
1111     rRNA            1..316
1112                     /product="16S ribosomal RNA"
1113                     /gene="16S rRNA"
1114                     /partial
1115     source          1..316
1116                     /organism="Acidiphilium angustum"
1117                     /sequenced_mol="rRNA"
1118                     /tissue_lib="ATCC 35903"
1119BASE COUNT       77 a     65 c     98 g     58 t     18 others
1120ORIGIN     
1121        1 aanctacggc taatacngca taatgcctga gggcnaaaga cgtaagtcgt cttggnagga
1122       61 gcctgcgtct gattaggtag ttggtggggt aaaggcctac nnagccnncg atcagtagct
1123      121 ngtctgagag gatgatcagc cacattggga ctgagacacg gccnnaactc ctacgggagg
1124      181 cagcagtggg gaatattgga caatgggggc aacccnnatc cagcaatgcc gcgtgggtga
1125      241 agaaggtntt cggattgtaa agccnntttg gcggggacga tgatgacggt acccgcagaa
1126      301 taagctccgg cnnact
1127//
1128LOCUS       ACDRRDA02     321 bp ss-rRNA            RNA       24-JUN-1993
1129DEFINITION  Acidiphilium angustum 16S rRNA sequence.
1130ACCESSION   M79364
1131KEYWORDS    16S ribosomal RNA.
1132SEGMENT     2 of 3
1133SOURCE      Acidiphilium angustum (library: ATCC 35903) rRNA.
1134  ORGANISM  Acidiphilium angustum
1135            Prokaryotae; Gracilicutes; Scotobacteria; Aerobic rods and cocci;
1136            Alcaligenaceae.
1137REFERENCE   1  (bases 1 to 321)
1138  AUTHORS   Lane,D.J., Harrison,A.P., Stahl,D.A., Pace,B., Giovannoni,S.J.,
1139            Olsen,G.J. and Pace,N.R.
1140  TITLE     Evolutionary relationships among sulfur- and iron-oxidizing
1141            eubacteria
1142  JOURNAL   J. Bacteriol. 174, 269-278 (1992)
1143  STANDARD  full automatic
1144FEATURES             Location/Qualifiers
1145     rRNA            1..321
1146                     /product="16S ribosomal RNA"
1147                     /gene="16S rRNA"
1148                     /partial
1149     source          1..321
1150                     /organism="Acidiphilium angustum"
1151                     /sequenced_mol="rRNA"
1152                     /tissue_lib="ATCC 35903"
1153BASE COUNT       76 a     63 c     98 g     71 t     13 others
1154ORIGIN     
1155        1 cgtaggcgct tacatagtta ggcgtgaaat tcctnggctc aacctgggnc tgcgtctnat
1156       61 acatgtagcn ygagtgtgaa agagggtcgt sgaatttcca gtgtagaggt gaaattcgta
1157      121 gatattggaa agaacaccgg tggcgaaggc ggcgacctng ttcattactg acgctgaggc
1158      181 gcnaaagcgt ggggagcaaa caggattaga taccctngta gtccacgctg taaacgatgt
1159      241 gtsctsgatg ttggggtgct tagcacttca gtgtcgtast aacgcggtaa gcacaccgcc
1160      301 tngggagtac ggccgcaagg t
1161//
1162LOCUS       ACDRRDA03     339 bp ss-rRNA            RNA       24-JUN-1993
1163DEFINITION  Acidiphilium angustum 16S rRNA sequence.
1164ACCESSION   M79365
1165KEYWORDS    16S ribosomal RNA.
1166SEGMENT     3 of 3
1167SOURCE      Acidiphilium angustum (library: ATCC 35903) rRNA.
1168  ORGANISM  Acidiphilium angustum
1169            Prokaryotae; Gracilicutes; Scotobacteria; Aerobic rods and cocci;
1170            Alcaligenaceae.
1171REFERENCE   1  (bases 1 to 339)
1172  AUTHORS   Lane,D.J., Harrison,A.P., Stahl,D.A., Pace,B., Giovannoni,S.J.,
1173            Olsen,G.J. and Pace,N.R.
1174  TITLE     Evolutionary relationships among sulfur- and iron-oxidizing
1175            eubacteria
1176  JOURNAL   J. Bacteriol. 174, 269-278 (1992)
1177  STANDARD  full automatic
1178FEATURES             Location/Qualifiers
1179     rRNA            1..339
1180                     /product="16S ribosomal RNA"
1181                     /gene="16S rRNA"
1182                     /partial
1183     source          1..339
1184                     /organism="Acidiphilium angustum"
1185                     /sequenced_mol="rRNA"
1186                     /tissue_lib="ATCC 35903"
1187BASE COUNT       72 a     83 c    103 g     74 t      7 others
1188ORIGIN     
1189        1 acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac
1190       61 gagcgcaacc ctcgccttta gttgccagca cgtttgggtg ggnactctag aggaactgcc
1191      121 ggtgacaagc cggaggaagg tgggnatgac gtcaagtcct catggccctt atgtcctggg
1192      181 ctacacacgt gctacaatgg cggtgacagt gggaagccaa gcagcgatgc tnagctnatc
1193      241 ctgaaaagcc gtctcagttc ggattgcact ctgcaactcg ggtgcatgaa ggtggaatcg
1194      301 ctagtaatcg cggatcagca tgccgcngtn aatacnttc
1195//
1196LOCUS       ACDRRDD01     315 bp ss-rRNA            RNA       24-JUN-1993
1197DEFINITION  Acidiphilium cryptum 16S rRNA sequence.
1198ACCESSION   M79366
1199KEYWORDS    16S ribosomal RNA.
1200SEGMENT     1 of 3
1201SOURCE      Acidiphilium cryptum (library: ATCC 33463) rRNA.
1202  ORGANISM  Acidiphilium cryptum
1203            Prokaryotae; Gracilicutes; Scotobacteria; Aerobic rods and cocci;
1204            Alcaligenaceae.
1205REFERENCE   1  (bases 1 to 315)
1206  AUTHORS   Lane,D.J., Harrison,A.P., Stahl,D.A., Pace,B., Giovannoni,S.J.,
1207            Olsen,G.J. and Pace,N.R.
1208  TITLE     Evolutionary relationships among sulfur- and iron-oxidizing
1209            eubacteria
1210  JOURNAL   J. Bacteriol. 174, 269-278 (1992)
1211  STANDARD  full automatic
1212FEATURES             Location/Qualifiers
1213     rRNA            1..315
1214                     /product="16S ribosomal RNA"
1215                     /gene="16S rRNA"
1216                     /partial
1217     source          1..315
1218                     /organism="Acidiphilium cryptum"
1219                     /sequenced_mol="rRNA"
1220                     /tissue_lib="ATCC 33463"
1221BASE COUNT       78 a     68 c     99 g     57 t     13 others
1222ORIGIN     
1223        1 aaactacgnc taatacngca tgatcctgag gggcaaagnn nnaagtcgcc tgaggaggag
1224       61 cctgcgtctg attaggtagt tggtggggta aaggcctacc aagcctncga tcagtagctg
1225      121 gtctgagagg atgatcagcc acactgggac tgagacacgg cccngactcc tacgggaggc
1226      181 agcagtgggg aatattggac aatgggcgaa agcctnatcc agcaatgccg cgtggatgaa
1227      241 gaaggtcttc ggattgtaaa gtccntttgg cggggacgat gatgacggta cccgcagaat
1228      301 aagctccggc nnnct
1229//
1230LOCUS       ACDRRDD02     350 bp ss-rRNA            RNA       24-JUN-1993
1231DEFINITION  Acidiphilium cryptum 16S rRNA sequence.
1232ACCESSION   M79367
1233KEYWORDS    16S ribosomal RNA.
1234SEGMENT     2 of 3
1235SOURCE      Acidiphilium cryptum (library: ATCC 33463) rRNA.
1236  ORGANISM  Acidiphilium cryptum
1237            Prokaryotae; Gracilicutes; Scotobacteria; Aerobic rods and cocci;
1238            Alcaligenaceae.
1239REFERENCE   1  (bases 1 to 350)
1240  AUTHORS   Lane,D.J., Harrison,A.P., Stahl,D.A., Pace,B., Giovannoni,S.J.,
1241            Olsen,G.J. and Pace,N.R.
1242  TITLE     Evolutionary relationships among sulfur- and iron-oxidizing
1243            eubacteria
1244  JOURNAL   J. Bacteriol. 174, 269-278 (1992)
1245  STANDARD  full automatic
1246FEATURES             Location/Qualifiers
1247     rRNA            1..350
1248                     /product="16S ribosomal RNA"
1249                     /gene="16S rRNA"
1250                     /partial
1251     source          1..350
1252                     /organism="Acidiphilium cryptum"
1253                     /sequenced_mol="rRNA"
1254                     /tissue_lib="ATCC 33463"
1255BASE COUNT       79 a     71 c    122 g     74 t      4 others
1256ORIGIN     
1257        1 agcgttgctc ggaatgactg ggcgtaaagg gcgcgtaggc ggacggcaca gtcaggcgtg
1258       61 aaattcctgg gctcaacctg ggnctgcgtc tgagacgtgt tgtcttgagt atggaagagg
1259      121 gttgtggaat ttccagtgta gaggtgaaat tcgtagatat tggaaagaac accggtggcg
1260      181 aaggcggcaa cctggtccat tnctgacgct gaggcgcgaa agcgtgggga gcaaacagga
1261      241 ttagataccc tggtagtcca cgctgtaaac gatgtgtgct ggatgttggg gtgcttagca
1262      301 cttcagtgtc gtacgtaacg cggtaagcac accgccnngg gagtacggcc
1263//
1264LOCUS       ACDRRDD03     303 bp ss-rRNA            RNA       24-JUN-1993
1265DEFINITION  Acidiphilium cryptum 16S rRNA sequence.
1266ACCESSION   M79368
1267KEYWORDS    16S ribosomal RNA.
1268SEGMENT     3 of 3
1269SOURCE      Acidiphilium cryptum (library: ATCC 33463) rRNA.
1270  ORGANISM  Acidiphilium cryptum
1271            Prokaryotae; Gracilicutes; Scotobacteria; Aerobic rods and cocci;
1272            Alcaligenaceae.
1273REFERENCE   1  (bases 1 to 303)
1274  AUTHORS   Lane,D.J., Harrison,A.P., Stahl,D.A., Pace,B., Giovannoni,S.J.,
1275            Olsen,G.J. and Pace,N.R.
1276  TITLE     Evolutionary relationships among sulfur- and iron-oxidizing
1277            eubacteria
1278  JOURNAL   J. Bacteriol. 174, 269-278 (1992)
1279  STANDARD  full automatic
1280FEATURES             Location/Qualifiers
1281     rRNA            1..303
1282                     /product="16S ribosomal RNA"
1283                     /gene="16S rRNA"
1284                     /partial
1285     source          1..303
1286                     /organism="Acidiphilium cryptum"
1287                     /sequenced_mol="rRNA"
1288                     /tissue_lib="ATCC 33463"
1289BASE COUNT       62 a     72 c     97 g     66 t      6 others
1290ORIGIN     
1291        1 tgtcgtgaga tgttgggtta agtccgcaac gagcgcaacc ctcgccntca gttgccagca
1292       61 tgtttgggtg ggcactctga aggaactgcc ggtgacaagc cggaggaagg tggggatgac
1293      121 gtcaagtcct catggcccnt atgtcctggg ctacacacgt gctactatgg cggtgacwgt
1294      181 gggaagccag gtggtgacac cgagctgatc tcaaaaagcc gnctcwgttc ggattgcact
1295      241 ctgctactcg agtgcatgaa ggtggaatcg ctagttatcg cggatctgca tgcngcggtg
1296      301 aat
1297//
1298LOCUS       ACDRRDG01     264 bp ss-rRNA            RNA       24-JUN-1993
1299DEFINITION  Acidiphilium facilis 16S rRNA sequence.
1300ACCESSION   M79369
1301KEYWORDS    16S ribosomal RNA.
1302SEGMENT     1 of 3
1303SOURCE      Acidiphilium facilis (library: ATCC 35904) rRNA.
1304  ORGANISM  Acidiphilium facilis
1305            Prokaryotae; Gracilicutes; Scotobacteria; Aerobic rods and cocci;
1306            Alcaligenaceae.
1307REFERENCE   1  (bases 1 to 264)
1308  AUTHORS   Lane,D.J., Harrison,A.P., Stahl,D.A., Pace,B., Giovannoni,S.J.,
1309            Olsen,G.J. and Pace,N.R.
1310  TITLE     Evolutionary relationships among sulfur- and iron-oxidizing
1311            eubacteria
1312  JOURNAL   J. Bacteriol. 174, 269-278 (1992)
1313  STANDARD  full automatic
1314FEATURES             Location/Qualifiers
1315     rRNA            1..264
1316                     /product="16S ribosomal RNA"
1317                     /gene="16S rRNA"
1318                     /partial
1319     source          1..264
1320                     /organism="Acidiphilium facilis"
1321                     /sequenced_mol="rRNA"
1322                     /tissue_lib="ATCC 35904"
1323BASE COUNT       60 a     54 c     75 g     46 t     29 others
1324ORIGIN     
1325        1 aggagcctgc gtctgattag ctkgttggtg gggtnaaggc ctaccaagnn nnckatcagt
1326       61 agctggtctg agaggatgat cagccacatt gggactgaga cacggccnna actcctacgg
1327      121 gaggcagcag tgggmmatat tggacaatgg gcgcaagcch matccagcaa tgccgmgtgt
1328      181 gtgaagaagg hmhhcnnatt gtaaagcach httggcangg mctgattgat gacggtacch
1329      241 mcagaataag ccccvgchma cttc
1330//
1331LOCUS       ACDRRDG02     313 bp ss-rRNA            RNA       24-JUN-1993
1332DEFINITION  Acidiphilium facilis 16S rRNA sequence.
1333ACCESSION   M79370
1334KEYWORDS    16S ribosomal RNA.
1335SEGMENT     2 of 3
1336SOURCE      Acidiphilium facilis (library: ATCC 35904) rRNA.
1337  ORGANISM  Acidiphilium facilis
1338            Prokaryotae; Gracilicutes; Scotobacteria; Aerobic rods and cocci;
1339            Alcaligenaceae.
1340REFERENCE   1  (bases 1 to 313)
1341  AUTHORS   Lane,D.J., Harrison,A.P., Stahl,D.A., Pace,B., Giovannoni,S.J.,
1342            Olsen,G.J. and Pace,N.R.
1343  TITLE     Evolutionary relationships among sulfur- and iron-oxidizing
1344            eubacteria
1345  JOURNAL   J. Bacteriol. 174, 269-278 (1992)
1346  STANDARD  full automatic
1347FEATURES             Location/Qualifiers
1348     rRNA            1..313
1349                     /product="16S ribosomal RNA"
1350                     /partial
1351     source          1..313
1352                     /organism="Acidiphilium facilis"
1353                     /sequenced_mol="rRNA"
1354                     /tissue_lib="ATCC 35904"
1355BASE COUNT       83 a     59 c     97 g     69 t      5 others
1356ORIGIN     
1357        1 tgtacagtca gaagtgaaat tcctggctca acctgggnac tgcttttgat acgtgcaagc
1358       61 tagagtgagg aagagggttg tggaatttcc agtgtagagg tgaaattcgt agatattgga
1359      121 aagaacaccg gtggcgaagg cggcaacctg gtcctnaact gacgctgagg cgcnaaagcg
1360      181 tggggagcaa acaggattag ataccctrgt agtccacgct gtaaacgatg tgtgctagat
1361      241 gttggggaac ttagtttctc agtgtcgtac gtaacgcgat aagcacacag cctrgggagt
1362      301 acggccgcaa ggt
1363//
1364LOCUS       ACDRRDG03     345 bp ss-rRNA            RNA       24-JUN-1993
1365DEFINITION  Acidiphilium facilis 16S rRNA sequence.
1366ACCESSION   M79371
1367KEYWORDS    16S ribosomal RNA.
1368SEGMENT     3 of 3
1369SOURCE      Acidiphilium facilis (library: ATCC 35904) rRNA.
1370  ORGANISM  Acidiphilium facilis
1371            Prokaryotae; Gracilicutes; Scotobacteria; Aerobic rods and cocci;
1372            Alcaligenaceae.
1373REFERENCE   1  (bases 1 to 345)
1374  AUTHORS   Lane,D.J., Harrison,A.P., Stahl,D.A., Pace,B., Giovannoni,S.J.,
1375            Olsen,G.J. and Pace,N.R.
1376  TITLE     Evolutionary relationships among sulfur- and iron-oxidizing
1377            eubacteria
1378  JOURNAL   J. Bacteriol. 174, 269-278 (1992)
1379  STANDARD  full automatic
1380FEATURES             Location/Qualifiers
1381     rRNA            1..345
1382                     /product="16S ribosomal RNA"
1383                     /partial
1384     source          1..345
1385                     /organism="Acidiphilium facilis"
1386                     /sequenced_mol="rRNA"
1387                     /tissue_lib="ATCC 35904"
1388BASE COUNT       76 a     84 c     97 g     86 t      2 others
1389ORIGIN     
1390        1 ccttccgaca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc
1391       61 ccgcaacgag cgcaaccctt gcctttagtt gccatcattt agttgggcac tctacaggaa
1392      121 ctgccggtga caagccggag gaaggtgggg atgacgtcaa gtcctcatgg cccttatgtc
1393      181 ctgggctaca cacgtgctac aatggtggtg acagtgggaa gctaggtagt gataccgtgc
1394      241 tcatctctaa aagccatctc agttcagatt gtactctgca actcgagtmc atgaaggtgg
1395      301 aatcgctagt aatcgtggat cagcatgcca cggtnaatac gttcc
1396//
1397LOCUS       ACDRRDJ01     363 bp ss-rRNA            RNA       24-JUN-1993
1398DEFINITION  Acidiphilium rubrum 16S rRNA sequence.
1399ACCESSION   M79377
1400KEYWORDS    16S ribosomal RNA.
1401SEGMENT     1 of 3
1402SOURCE      Acidiphilium rubrum (library: ATCC 35905) rRNA.
1403  ORGANISM  Acidiphilium rubrum
1404            Prokaryotae; Gracilicutes; Scotobacteria; Aerobic rods and cocci;
1405            Alcaligenaceae.
1406REFERENCE   1  (bases 1 to 363)
1407  AUTHORS   Lane,D.J., Harrison,A.P., Stahl,D.A., Pace,B., Giovannoni,S.J.,
1408            Olsen,G.J. and Pace,N.R.
1409  TITLE     Evolutionary relationships among sulfur- and iron-oxidizing
1410            eubacteria
1411  JOURNAL   J. Bacteriol. 174, 269-278 (1992)
1412  STANDARD  full automatic
1413FEATURES             Location/Qualifiers
1414     rRNA            1..363
1415                     /product="16S ribosomal RNA"
1416                     /gene="16S rRNA"
1417                     /partial
1418     source          1..363
1419                     /organism="Acidiphilium rubrum"
1420                     /sequenced_mol="rRNA"
1421                     /tissue_lib="ATCC 35905"
1422BASE COUNT       83 a     71 c    110 g     64 t     35 others
1423ORIGIN     
1424        1 ggtagtacgc gtaggaatct atccnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnggaaac tacggctaat
1425       61 accgcataat sctgagggcg aaagacgtaa gtcgtctggg gaggagcctg cgtctgatta
1426      121 ggtagttggt ggggtnaagg cctacnnagc cnncgatcag tagctggtct gagaggatga
1427      181 tcagccacat tgggactgag acacggccnn aactcctacg ggaggcagca gtggggaata
1428      241 ttggacaatg ggggcaaccc tnatccagca atgccgcgtg ggtgaagaag gtnttcggat
1429      301 tgtaaagccn nnttggcggg gacgatgatg acggtacccg cagaataagc tccggcnnac
1430      361 ttc
1431//
1432LOCUS       ACDRRDJ02     347 bp ss-rRNA            RNA       24-JUN-1993
1433DEFINITION  Acidiphilium rubrum 16S rRNA sequence.
1434ACCESSION   M79378
1435KEYWORDS    16S ribosomal RNA.
1436SEGMENT     2 of 3
1437SOURCE      Acidiphilium rubrum (library: ATCC 35905) rRNA.
1438  ORGANISM  Acidiphilium rubrum
1439            Prokaryotae; Gracilicutes; Scotobacteria; Aerobic rods and cocci;
1440            Alcaligenaceae.
1441REFERENCE   1  (bases 1 to 347)
1442  AUTHORS   Lane,D.J., Harrison,A.P., Stahl,D.A., Pace,B., Giovannoni,S.J.,
1443            Olsen,G.J. and Pace,N.R.
1444  TITLE     Evolutionary relationships among sulfur- and iron-oxidizing
1445            eubacteria
1446  JOURNAL   J. Bacteriol. 174, 269-278 (1992)
1447  STANDARD  full automatic
1448FEATURES             Location/Qualifiers
1449     rRNA            1..347
1450                     /product="16S ribosomal RNA"
1451                     /gene="16S rRNA"
1452                     /partial
1453     source          1..347
1454                     /organism="Acidiphilium rubrum"
1455                     /sequenced_mol="rRNA"
1456                     /tissue_lib="ATCC 35905"
1457BASE COUNT       83 a     67 c    114 g     78 t      5 others
1458ORIGIN     
1459        1 tctgaatgac tgggcgtaaa gggncgtagg cgcttacata gttaggcgtg aaattcctgg
1460       61 gctcaacctg gggctgcgtc taatacatgt aggcttgagt gtgaaagagg gtcgtggaat
1461      121 ttccagtgta gaggtgaaat tcgtagatat tggaaagaac accggtggcg aaggcggcga
1462      181 cctngttcat tactgacgct gaggcgcnaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc
1463      241 tngtagtcca cgctgtaaac gatgtgtgct ggatgttggg gtgcttagca cttcagtgtc
1464      301 gtagctaacg cggtaagcac accgcctngg gagtacggcc gcaaggt
1465//
1466LOCUS       ACDRRDJ03     383 bp ss-rRNA            RNA       24-JUN-1993
1467DEFINITION  Acidiphilium rubrum 16S rRNA sequence.
1468ACCESSION   M79379
1469KEYWORDS    16S ribosomal RNA.
1470SEGMENT     3 of 3
1471SOURCE      Acidiphilium rubrum (library: ATCC 35905) rRNA.
1472  ORGANISM  Acidiphilium rubrum
1473            Prokaryotae; Gracilicutes; Scotobacteria; Aerobic rods and cocci;
1474            Alcaligenaceae.
1475REFERENCE   1  (bases 1 to 383)
1476  AUTHORS   Lane,D.J., Harrison,A.P., Stahl,D.A., Pace,B., Giovannoni,S.J.,
1477            Olsen,G.J. and Pace,N.R.
1478  TITLE     Evolutionary relationships among sulfur- and iron-oxidizing
1479            eubacteria
1480  JOURNAL   J. Bacteriol. 174, 269-278 (1992)
1481  STANDARD  full automatic
1482FEATURES             Location/Qualifiers
1483     rRNA            1..383
1484                     /product="16S ribosomal RNA"
1485                     /gene="16S rRNA"
1486                     /partial
1487     source          1..383
1488                     /organism="Acidiphilium rubrum"
1489                     /sequenced_mol="rRNA"
1490                     /tissue_lib="ATCC 35905"
1491BASE COUNT       79 a     92 c    120 g     84 t      8 others
1492ORIGIN     
1493        1 ttgacatgag agcgtgccag agatnnnttc cgcaggnnct ttgcacaggt gctgcatggc
1494       61 tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aaccctcgcc
1495      121 tttagttgcc agcacgtttg ggtgggnact ctagaggrac tgccggtgac aagccggagg
1496      181 aaggtgggna tgacgtcaag tcctcatggc ccttatgtcc tgggctacac acgtgctaca
1497      241 atggcggtga cagtgggaag ccaagcagcg atgctgagct gatcctgaaa agccgtctca
1498      301 gttcggattg cactctgcaa ctcgggtgca tgaaggtgga atcgctagta atcgcggatc
1499      361 agcatgccgc ggtgaatacg ttc
1500//
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.