source: branches/help/ISLAND_HOPPING/i-hopper.h

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  • fixed compile error (assert)
  • fixed includes
  • added include wrappers
  • renamed functions "overloaded" by defines
  • Property svn:eol-style set to native
  • Property svn:keywords set to Author Date Id Revision
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Line 
1// ============================================================= //
2//                                                               //
3//   File      : i-hopper.h                                      //
4//   Purpose   :                                                 //
5//                                                               //
6//   Institute of Microbiology (Technical University Munich)     //
7//   http://www.arb-home.de/                                     //
8//                                                               //
9// ============================================================= //
10
11#ifndef I_HOPPER_H
12#define I_HOPPER_H
13
14#ifdef EXTERN
15#define EXT extern
16#else
17#define EXT
18#endif
19
20#include "defs.h"
21
22EXT const char *Error;
23
24void Align(
25           int nX,char X[],int secX[],char **XX,int nY,char Y[],int secY[],char **YY,
26           int freqs,double fT,double fC,double fA,double fG,
27           double rTC,double rTA,double rTG,double rCA,double rCG,double rAG,
28           double dist,double supp,double gapA,double gapB,double gapC,double thres
29           );
30
31#undef EXT
32
33#else
34#error i-hopper.h included twice
35#endif // I_HOPPER_H
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.