| Line | |
|---|
| 1 | /*ARBDB ASCII*/ |
|---|
| 2 | presets %% (% |
|---|
| 3 | alignment %% (% |
|---|
| 4 | alignment_name "ali_genom" |
|---|
| 5 | alignment_len %i 66 |
|---|
| 6 | %) /*alignment*/ |
|---|
| 7 | |
|---|
| 8 | use "ali_genom" |
|---|
| 9 | %) /*presets*/ |
|---|
| 10 | |
|---|
| 11 | species_data %% (% |
|---|
| 12 | species %% (% |
|---|
| 13 | name "genome1" |
|---|
| 14 | ali_genom %% (% |
|---|
| 15 | data "AUUCUGGUUGAUCCUGCCAGAGGUUACUGCUAUCGGUGUUCGCCUAAGCCAUGCGAGUCAUAUGUA" |
|---|
| 16 | %) /*ali_genom*/ |
|---|
| 17 | |
|---|
| 18 | gene_data %% (% |
|---|
| 19 | gene %% (% |
|---|
| 20 | name "gene1" |
|---|
| 21 | pos_start "3" |
|---|
| 22 | pos_stop "6" |
|---|
| 23 | pos_complement "0" |
|---|
| 24 | %) /*gene*/ |
|---|
| 25 | |
|---|
| 26 | gene %% (% |
|---|
| 27 | name "gene2" |
|---|
| 28 | pos_start "9" |
|---|
| 29 | pos_stop "17" |
|---|
| 30 | pos_complement "0" |
|---|
| 31 | %) /*gene*/ |
|---|
| 32 | |
|---|
| 33 | gene %% (% |
|---|
| 34 | name "gene3" |
|---|
| 35 | pos_start "4" |
|---|
| 36 | pos_stop "11" |
|---|
| 37 | pos_complement "1" |
|---|
| 38 | %) /*gene*/ |
|---|
| 39 | |
|---|
| 40 | gene %% (% |
|---|
| 41 | name "joined1" |
|---|
| 42 | pos_joined %i 2 |
|---|
| 43 | pos_start "4,7" |
|---|
| 44 | pos_stop "11,17" |
|---|
| 45 | pos_complement "0,1" |
|---|
| 46 | %) /*gene*/ |
|---|
| 47 | |
|---|
| 48 | %) /*gene_data*/ |
|---|
| 49 | |
|---|
| 50 | %) /*species*/ |
|---|
| 51 | |
|---|
| 52 | species %% (% |
|---|
| 53 | name "genome2" |
|---|
| 54 | ali_genom %% (% |
|---|
| 55 | data "AUUUCGGUUGAUCCUGCCAGAGGUUACUGCAUUCGGUGUUCGCCUAAGCACUGCGAGUCAUAUGUA" |
|---|
| 56 | %) /*ali_genom*/ |
|---|
| 57 | |
|---|
| 58 | gene_data %% (% |
|---|
| 59 | gene %% (% |
|---|
| 60 | name "gene1" |
|---|
| 61 | pos_start "1" |
|---|
| 62 | pos_stop "8" |
|---|
| 63 | pos_complement "0" |
|---|
| 64 | %) /*gene*/ |
|---|
| 65 | |
|---|
| 66 | gene %% (% |
|---|
| 67 | name "gene2" |
|---|
| 68 | pos_start "7" |
|---|
| 69 | pos_stop "19" |
|---|
| 70 | pos_complement "0" |
|---|
| 71 | %) /*gene*/ |
|---|
| 72 | |
|---|
| 73 | gene %% (% |
|---|
| 74 | name "gene3" |
|---|
| 75 | pos_start "2" |
|---|
| 76 | pos_stop "13" |
|---|
| 77 | pos_complement "1" |
|---|
| 78 | %) /*gene*/ |
|---|
| 79 | |
|---|
| 80 | gene %% (% |
|---|
| 81 | name "joined1" |
|---|
| 82 | pos_joined %i 2 |
|---|
| 83 | pos_start "2,5" |
|---|
| 84 | pos_stop "13,19" |
|---|
| 85 | pos_complement "0,1" |
|---|
| 86 | %) /*gene*/ |
|---|
| 87 | |
|---|
| 88 | %) /*gene_data*/ |
|---|
| 89 | |
|---|
| 90 | %) /*species*/ |
|---|
| 91 | |
|---|
| 92 | %) /*species_data*/ |
|---|
| 93 | |
|---|
Note: See
TracBrowser
for help on using the repository browser.
