| 1 | // =============================================================== // |
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| 3 | // File : RNA3D_Main.cxx // |
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| 4 | // Purpose : // |
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| 6 | // Coded by Yadhukumar in December 2004 // |
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| 7 | // Institute of Microbiology (Technical University Munich) // |
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| 8 | // http://www.arb-home.de/ // |
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| 9 | // // |
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| 10 | // =============================================================== // |
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| 12 | #include "RNA3D_GlobalHeader.hxx" |
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| 13 | #include "RNA3D_Global.hxx" |
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| 14 | #include "RNA3D_Interface.hxx" |
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| 15 | #include "rna3d_extern.hxx" |
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| 16 | |
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| 17 | #include <aw_root.hxx> |
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| 18 | #include <aw_window.hxx> |
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| 19 | #include <arbdb.h> |
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| 20 | |
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| 21 | static void CreateRNA3DAwars(AW_root *root) { |
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| 22 | // Display Base Section |
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| 23 | root->awar_int(AWAR_3D_DISPLAY_BASES, 0, AW_ROOT_DEFAULT); |
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| 24 | root->awar_float(AWAR_3D_DISPLAY_SIZE, 10, AW_ROOT_DEFAULT); |
|---|
| 25 | root->awar_int(AWAR_3D_BASES_MODE, 0, AW_ROOT_DEFAULT); |
|---|
| 26 | root->awar_int(AWAR_3D_BASES_HELIX, 1, AW_ROOT_DEFAULT); |
|---|
| 27 | root->awar_int(AWAR_3D_BASES_UNPAIRED_HELIX, 1, AW_ROOT_DEFAULT); |
|---|
| 28 | root->awar_int(AWAR_3D_BASES_NON_HELIX, 1, AW_ROOT_DEFAULT); |
|---|
| 29 | root->awar_int(AWAR_3D_SHAPES_HELIX, 1, AW_ROOT_DEFAULT); |
|---|
| 30 | root->awar_int(AWAR_3D_SHAPES_UNPAIRED_HELIX, 3, AW_ROOT_DEFAULT); |
|---|
| 31 | root->awar_int(AWAR_3D_SHAPES_NON_HELIX, 1, AW_ROOT_DEFAULT); |
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| 32 | |
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| 33 | // Display Helix Section |
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| 34 | root->awar_int(AWAR_3D_DISPLAY_HELIX, 0, AW_ROOT_DEFAULT); |
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| 35 | root->awar_int(AWAR_3D_HELIX_BACKBONE, 0, AW_ROOT_DEFAULT); |
|---|
| 36 | root->awar_int(AWAR_3D_HELIX_MIDPOINT, 0, AW_ROOT_DEFAULT); |
|---|
| 37 | root->awar_int(AWAR_3D_HELIX_FROM, 1, AW_ROOT_DEFAULT); |
|---|
| 38 | root->awar_int(AWAR_3D_HELIX_TO, 50, AW_ROOT_DEFAULT); |
|---|
| 39 | root->awar_int(AWAR_3D_HELIX_NUMBER, 0, AW_ROOT_DEFAULT); |
|---|
| 40 | root->awar_float(AWAR_3D_HELIX_SIZE, 0.5, AW_ROOT_DEFAULT); |
|---|
| 41 | root->awar_int(AWAR_3D_DISPLAY_TERTIARY_INTRACTIONS, 0, AW_ROOT_DEFAULT); |
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| 42 | |
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| 43 | // General Molecule Display Section |
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| 44 | root->awar_int(AWAR_3D_MOL_BACKBONE, 1, AW_ROOT_DEFAULT); |
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| 45 | root->awar_int(AWAR_3D_MOL_COLORIZE, 0, AW_ROOT_DEFAULT); |
|---|
| 46 | root->awar_int(AWAR_3D_MAP_SPECIES, 0, AW_ROOT_DEFAULT); |
|---|
| 47 | root->awar_int(AWAR_3D_MAP_SPECIES_DISP_BASE, 1, AW_ROOT_DEFAULT); |
|---|
| 48 | root->awar_int(AWAR_3D_MAP_SPECIES_DISP_POS, 0, AW_ROOT_DEFAULT); |
|---|
| 49 | root->awar_int(AWAR_3D_MAP_SPECIES_DISP_DELETIONS, 1, AW_ROOT_DEFAULT); |
|---|
| 50 | root->awar_int(AWAR_3D_MAP_SPECIES_DISP_MISSING, 1, AW_ROOT_DEFAULT); |
|---|
| 51 | root->awar_int(AWAR_3D_MAP_SPECIES_DISP_INSERTIONS, 1, AW_ROOT_DEFAULT); |
|---|
| 52 | root->awar_int(AWAR_3D_MAP_SPECIES_DISP_INSERTIONS_INFO, 0, AW_ROOT_DEFAULT); |
|---|
| 53 | root->awar_int(AWAR_3D_CURSOR_POSITION, 0, AW_ROOT_DEFAULT); |
|---|
| 54 | root->awar_float(AWAR_3D_MOL_SIZE, 0.5, AW_ROOT_DEFAULT); |
|---|
| 55 | root->awar_int(AWAR_3D_MOL_DISP_POS, 0, AW_ROOT_DEFAULT); |
|---|
| 56 | root->awar_int(AWAR_3D_MOL_ROTATE, 0, AW_ROOT_DEFAULT); |
|---|
| 57 | root->awar_int(AWAR_3D_MOL_POS_INTERVAL, 25, AW_ROOT_DEFAULT); |
|---|
| 58 | root->awar_string(AWAR_3D_SELECTED_SPECIES, "", AW_ROOT_DEFAULT); |
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| 59 | |
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| 60 | // Display SAI Section |
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| 61 | root->awar_int(AWAR_3D_MAP_SAI, 0, AW_ROOT_DEFAULT); |
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| 62 | root->awar_int(AWAR_3D_MAP_ENABLE, 0, AW_ROOT_DEFAULT); |
|---|
| 63 | root->awar_int(AWAR_3D_MAP_SEARCH_STRINGS, 0, AW_ROOT_DEFAULT); |
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| 64 | |
|---|
| 65 | root->awar_int(AWAR_3D_DISPLAY_MASK, 0, AW_ROOT_DEFAULT); |
|---|
| 66 | root->awar_int(AWAR_3D_23S_RRNA_MOL, 3, AW_ROOT_DEFAULT); |
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| 67 | } |
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| 68 | |
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| 69 | AW_window *start_RNA3D_plugin(ED4_plugin_host& host) { |
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| 70 | CreateRNA3DAwars(host.get_application_root()); |
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| 71 | return CreateRNA3DMainWindow(host.get_application_root(), host.get_database(), host); |
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| 72 | } |
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| 73 | |
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