source: branches/stable/PHYLO/PH_filter.hxx

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  • reintegrates 'ui' into 'trunk'
    • implements #656
    • adds instant update for
      • next neighbour search
      • branch analysis (mark functions)
      • arb-phylo (filter setup)
  • adds: log:branches/ui@14588:14621
  • Property svn:eol-style set to native
  • Property svn:keywords set to Author Date Id Revision
File size: 1011 bytes
Line 
1// =========================================================== //
2//                                                             //
3//   File      : PH_filter.hxx                                 //
4//   Purpose   :                                               //
5//                                                             //
6//   Institute of Microbiology (Technical University Munich)   //
7//   http://www.arb-home.de/                                   //
8//                                                             //
9// =========================================================== //
10
11#ifndef PH_FILTER_HXX
12#define PH_FILTER_HXX
13
14#ifndef ARBTOOLS_H
15#include <arbtools.h>
16#endif
17
18class PH_filter : virtual Noncopyable {
19    char *filter;         // 0 1
20    long  filter_len;
21    long  real_len;       // how many 1
22    long  update;
23
24public:
25
26
27    PH_filter();
28    ~PH_filter();
29
30    char *init(long size);
31
32    float *calculate_column_homology();
33};
34
35#else
36#error PH_filter.hxx included twice
37#endif
38
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.