source: branches/stable/lib/dtd/arb_seq_export.dtd

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Line 
1<!-- ==================================================================== -->
2<!--                                                                      -->
3<!--   File      : arb_seq_export.dtd                                     -->
4<!--   Purpose   : DTD for ARB sequence export                            -->
5<!--                                                                      -->
6<!-- Coded by Ralf Westram (coder@reallysoft.de) in July 2002             -->
7<!-- Copyright Department of Microbiology (Technical University Munich)   -->
8<!--                                                                      -->
9<!-- Visit our web site at: http://www.arb-home.de/                       -->
10<!--                                                                      -->
11<!-- ==================================================================== -->
12<!--                                                                      -->
13<!--  Please note: This file is just a templete for you to create         -->
14<!--               your own DTD according to your database contents       -->
15<!--                                                                      -->
16<!-- ==================================================================== -->
17
18<!ELEMENT ARB_SEQ_EXPORT (SPECIES)* >
19<!ATTLIST ARB_SEQ_EXPORT database CDATA #IMPLIED> <!--name of ARB database sequences were exported from-->
20<!ATTLIST ARB_SEQ_EXPORT export_date CDATA #IMPLIED>
21
22<!--1. elements with name attribute-->
23
24<!ELEMENT SPECIES ANY >
25<!ATTLIST SPECIES name ID #REQUIRED> <!--name should always be treated as ID because ARB does the same-->
26
27<!ELEMENT ALIGNMENT (DATA,REMARK?) >
28<!ATTLIST ALIGNMENT name CDATA #REQUIRED>
29
30<!ELEMENT DATA (#PCDATA) > <!--the sequence data-->
31<!ELEMENT REMARK (#PCDATA) > <!--sequence remarks-->
32
33<!-- 2. simple text elements-->
34<!-- 2.1 'Standard' elements-->
35
36<!ELEMENT FULL_NAME (#PCDATA) >
37<!ELEMENT ACC (#PCDATA) >
38<!ELEMENT ARB_COLOR (#PCDATA) >
39
40<!-- 2.2 Other common elements-->
41
42<!ELEMENT BER_ID (#PCDATA) >
43<!ELEMENT BER_DATE (#PCDATA) >
44<!ELEMENT BER_DE (#PCDATA) >
45<!ELEMENT BER_FULL_NAME (#PCDATA) >
46<!ELEMENT BER_TAX (#PCDATA) >
47<!ELEMENT BER_AUTHOR (#PCDATA) >
48<!ELEMENT BER_TITLE (#PCDATA) >
49<!ELEMENT BER_JOURNAL (#PCDATA) >
50<!ELEMENT BER_AC (#PCDATA) >
51
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.