source: tags/ms_r16q2/PROBE_SET/ps_my2ascii.cxx

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Line 
1// =============================================================== //
2//                                                                 //
3//   File      : ps_my2ascii.cxx                                   //
4//   Purpose   :                                                   //
5//                                                                 //
6//   Coded by Wolfram Foerster in October 2002                     //
7//   Institute of Microbiology (Technical University Munich)       //
8//   http://www.arb-home.de/                                       //
9//                                                                 //
10// =============================================================== //
11
12#include "ps_node.hxx"
13
14//  ====================================================
15//  ====================================================
16
17int main(int argc,   char *argv[]) {
18
19    //
20    // check arguments
21    //
22    if (argc < 3) {
23        printf("Missing arguments\n Usage %s <input database name> <output database name>\n", argv[0]);
24        exit(1);
25    }
26
27    //
28    // open probe-set-database
29    //
30    PS_Node       *root          = new PS_Node(-1);
31    const char    *input_DB_name = argv[1];
32    PS_FileBuffer *ps_db_fb      = new PS_FileBuffer(input_DB_name, PS_FileBuffer::READONLY);
33
34    printf("Opening input-probe-set-database '%s'..\n", input_DB_name);
35    root->load(ps_db_fb);
36    printf("loaded database (enter to continue)\n");
37
38    //
39    // write as ASCII
40    //
41    const char *output_DB_name = argv[2];
42    printf("writing probe-data to %s\n", output_DB_name);
43    ps_db_fb->reinit(output_DB_name, PS_FileBuffer::WRITEONLY);
44    char *buffer = (char *)malloc(512);
45    root->saveASCII(ps_db_fb, buffer);
46    printf("(enter to continue)\n");
47
48    //
49    // clean up
50    //
51    free(buffer);
52    delete ps_db_fb;
53    printf("(enter to continue)\n");
54
55    return 0;
56}
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.