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Line 
1/*ARBDB ASCII*/
2species_data            %% (%
3        species         :5000   %$ (%
4                name            :7600   "CytLyti6"
5                flag            :7000   "m"
6                full_name               "Cytophaga lytica"
7                acc                     "ARB_6B3852E"
8                transl_table            "12"
9                codon_start             "2"
10                ali_dna                 %% (%
11                        data            :7000   "---------ATGGCAAAGGAAACTTTTGATCGTTCCAAACCGCACTTAAATATAGGTACTATTGGACACGTAGATCACGGTAAAACTACTTTAACTGCTGCTATTACAASAGTATTG---------"
12                        %) /*ali_dna*/
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15                        data            :7000   "XWQRKLLIVPNRT*-I*-VLLDT*ITVKLL*SSLLZZYX-X."
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21                name            :7600   "TaxOcell"
22                flag            :7000   "m"
23                full_name               "Taxeobacter ocellatus"
24                acc                     "ARB_21595EF"
25                transl_table            "21"
26                codon_start             "2"
27                ali_dna                 %% (%
28                        data            :7000   "------------------ATGGCTAAAGAAACTTTTGACCGGTCCAAGCCGCACGTAAACATCGGCACGATCGGTCACGTGGACCACGGCAAAACGACTCTGACCGCTGCTATCACCACGGTGCTG"
29                        %) /*ali_dna*/
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32                        data            :7000   "XG*SNFWPVQAARNHRHD--RSRGPRQBDSDRCYHHGAX-.."
33                        %) /*ali_pro*/
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38                name            :7600   "BctFra12"
39                flag            :7000   "h"
40                full_name               "Bacteroides fragilis"
41                acc                     "ARB_4560B41C"
42                transl_table            "1"
43                codon_start             "2"
44                ali_dna                 %% (%
45                        data            :7000   "ATGGCTAAAGAGAAATTTGAACGTACCAAACCGCACGTAAACATTGGTACAATCGGTCACGTTGACCACGGTAAAACCACTTTGACTGCTGCTATCACTACTGTGTTG------------------"
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49                        data            :7000   "MAKEK-FERTK-PHVNIGT-IGHVDHGKTTLTAAITTVLX.."
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55                name            :7600   "StrRamo3"
56                flag            :7000   "h"
57                full_name               "Streptomyces ramocissimus"
58                acc                     "ARB_30F12BA8"
59                transl_table            "1"
60                codon_start             "2"
61                ali_dna                 %% (%
62                        data            :7000   "ATGTCCAAGACGGCATACGTGCGCACCAAACCGCATCTGAACATCGGCACGATGGGTCATGTCGACCACGGCAAGACCACGTTGACCGCCGCCATCACCAAGGTCCTC------------------"
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66                        data            :7000   "MSKTAYVRTKPHLNIGTMGHVDHGKTTLTAAITKVXXX-X.."
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72                name            :7600   "StrCoel9"
73                acc                     "X77040"
74                full_name               "Streptomyces coelicolor"
75                transl_table            "1"
76                codon_start             "1"
77                ali_dna                 %% (%
78                        data            :7000   "------------------------------------ATGTCCAAGACGGCGTACGTCCGCCCACCTGAGGCACGATGGCCCGACCACGGCAAGACCACCCTGACCGCCGCCATCACCAAGGTCCTC"
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88                name            :7600   "MucRacem"
89                flag            :7000   "h"
90                full_name               "Mucor racemosus"
91                acc                     "ARB_5ADBD66E"
92                transl_table            "1"
93                codon_start             "2"
94                ali_dna                 %% (%
95                        data            :7000   "...........ATGGGTAAAGAGAAGACTCACGTTAACGTCGTCGTCATTGGTCACGTCGATTCCGGTAAATCTACTACTACTGGTCACTTGATTTACAAGTGTGGTGGTATAAA-----------"
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99                        data            :7000   "..MGKE---KTHVNVVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIX.."
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107                full_name               "Mucor racemosus"
108                acc                     "ARB_3627F120"
109                transl_table            "1"
110                codon_start             "2"
111                ali_dna                 %% (%
112                        data            :7000   ".ATGGGTAAGGAGAAGACTCACGTTAACGTCGTCGTCATTGGTCACGTCGATTCCGGTAAATCTACTACTACTGGTCACTTGATTTACAAGTGTGGTGGT-ATNNN-ATAA-A------------."
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123                flag            :7000   "h"
124                full_name               "Mucor racemosus"
125                acc                     "ARB_73CEEA74"
126                transl_table            "1"
127                codon_start             "1"
128                ali_dna                 %% (%
129                        data            :7000   "-----------ATGGGTAAAGAGAAGACTCACGTTRAYGTTGTCGTTATTGGTCACGTCRATTCCGGTAAGTCCACCNCCRCTGGTCACTTGATTTACAAGTGTGGTGGTATAA-A----------"
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141                full_name               "Absidia glauca"
142                acc                     "ARB_A706F312"
143                transl_table            "1"
144                codon_start             "1"
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158                full_name               "Candida albicans"
159                acc                     "ARB_10F3627F"
160                transl_table            "1"
161                codon_start             "1"
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174tree_data               %% (%
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1167
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1183
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1199
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1376
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.