source: tags/ms_r18q1/EDIT4/ED4_seq_colors.cxx

Last change on this file was 16763, checked in by westram, 6 years ago
  • Property svn:eol-style set to native
  • Property svn:keywords set to Author Date Id Revision
File size: 19.9 KB
Line 
1// ================================================================ //
2//                                                                  //
3//   File      : ED4_seq_colors.cxx                                 //
4//   Purpose   : Sequence foreground coloring.                      //
5//               Viewing differences only.                          //
6//                                                                  //
7//   Institute of Microbiology (Technical University Munich)        //
8//   http://www.arb-home.de/                                        //
9//                                                                  //
10// ================================================================ //
11
12#include "ed4_seq_colors.hxx"
13#include "ed4_class.hxx"
14#include "ed4_extern.hxx"
15
16#include <aw_root.hxx>
17#include <aw_awar.hxx>
18#include <aw_awar_defs.hxx>
19#include <aw_msg.hxx>
20#include <arbdbt.h>
21
22#include <cctype>
23
24static int default_NUC_set = 0;     // number of default nucleotide set
25static int default_AMI_set = 3;     // number of default amino acid set
26
27#define SEQ_COLOR_SETS      8
28#define SEQ_COLOR_SET_ELEMS 28 // has to be a even number!
29
30#define AWAR_SEQ_PATH                  "awt/seq_colors/"
31#define AWAR_SEQ_NAME_STRINGS_TEMPLATE AWAR_SEQ_PATH  "strings/elem_%i"
32#define AWAR_SEQ_NAME_TEMPLATE         AWAR_SEQ_PATH  "set_%i/elem_%i"
33#define AWAR_SEQ_NAME_SELECTOR_NA      AWAR_SEQ_PATH   "na/select"
34#define AWAR_SEQ_NAME_SELECTOR_AA      AWAR_SEQ_PATH   "aa/select"
35
36static const char *default_sets[SEQ_COLOR_SETS] = {
37    //A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V W X Y Z * -
38    "=2=0=3=0=0=0=4=0=0=0=0=0=0=6=0=0=0=0=0=5=5=0=0=0=0=0=0=6", // A, C, G, TU and N in 5 colors
39    "R2=0Y3=0=0=0R2=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=2=0Y3Y3=0=0=0=3=0=0=6", // AG and CTU in 2 colors
40    "=6=5=6=5=7=7=6=5=7=7=3=7=3=9=7=7=7=3=3=6=6=5=3=7=3=7=7=6", // ambiguity
41    "=7=0=7=8=2=9=8=9=3=0=2=3=7=8=0=8=2=2=2=2=0=3=9=6=9=0=0=6", // Protein colors
42
43    "=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=6",
44    "o9=0|2=0=0=0o5=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0|8|8=0=0=0=0=0=0=6", // ambiguity (symbols)
45    "=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=6",
46    "=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=0=6",
47};
48
49static bool seq_color_awars_created = false;
50
51// --------------------------------------------------------------------------------
52
53static const char *default_characters(int elem) {
54    static char result[3] = "xX";
55
56    if (elem<26) { //  first 26 elements (0-25) are characters
57        result[0] = 'a'+elem;
58        result[1] = 'A'+elem;
59    }
60    else if (elem == 26) { // stop codon
61        result[0] = '*';
62        result[1] = 0;
63    }
64    else if (elem == 27) { // gaps
65        result[0] = '-';
66        result[1] = '.';
67    }
68
69    return result;
70}
71static const char *default_color(int cset, int elem) {
72    // returns default color numbers for seq-color-set
73    static char result[3] = "=0";
74    const char *pos       = default_sets[cset]+2*elem;
75
76    result[0] = pos[0];
77    result[1] = pos[1];
78
79    if (result[0] == '=' && result[1] == '0') result[0] = 0;
80
81    return result;
82}
83
84static void color_awar_changed_cb(AW_root *, ED4_seq_colors *sc) {
85    sc->reload();
86}
87
88static void create_seq_color_awars(AW_root *awr, ED4_seq_colors *sc) {
89    e4_assert(!seq_color_awars_created);
90
91    RootCallback update_cb = makeRootCallback(color_awar_changed_cb, sc);
92    awr->awar_int(AWAR_SEQ_NAME_SELECTOR_NA, default_NUC_set, AW_ROOT_DEFAULT)->add_callback(update_cb);
93    awr->awar_int(AWAR_SEQ_NAME_SELECTOR_AA, default_AMI_set, AW_ROOT_DEFAULT)->add_callback(update_cb);
94
95    for (int elem = 0; elem<SEQ_COLOR_SET_ELEMS; ++elem) {
96        const char *awar_name = GBS_global_string(AWAR_SEQ_NAME_STRINGS_TEMPLATE, elem);
97        awr->awar_string(awar_name, default_characters(elem))->add_callback(update_cb);
98
99        for (int cset = 0; cset<SEQ_COLOR_SETS; ++cset) {
100            awar_name         = GBS_global_string(AWAR_SEQ_NAME_TEMPLATE, cset, elem);
101            AW_awar *awar_col = awr->awar_string(awar_name, default_color(cset, elem));
102
103            if (strcmp(awar_col->read_char_pntr(), "=0") == 0) { // translate old->new default
104                awar_col->write_string("");
105            }
106
107            // add callback AFTER writing to awar above to avoid recursion
108            // (the CB calls this function again, and seq_color_awars_created is set
109            // to true at the very end...
110            awar_col->add_callback(update_cb);
111        }
112    }
113
114    seq_color_awars_created = true;
115}
116
117AW_window *ED4_create_seq_colors_window(AW_root *awr, ED4_seq_colors *sc) {
118    char                     buf[256];
119    static AW_window_simple *aws = NULp;
120    if (aws) return aws;
121
122    if (!seq_color_awars_created) create_seq_color_awars(awr, sc);
123
124    aws = new AW_window_simple;
125    aws->init(awr, "SEQUENCE_MAPPING", "Sequence color mapping");
126
127    aws->at(10, 10);
128    aws->auto_space(0, 3);
129
130    aws->callback(AW_POPDOWN);
131    aws->create_button("CLOSE", "CLOSE", "C");
132
133    aws->callback(makeHelpCallback("sequence_colors.hlp"));
134    aws->create_button("HELP", "HELP");
135   
136    aws->at_newline();
137
138    for (int seqType=0; seqType<2; seqType++) {
139        if (seqType==0) {
140            aws->label("Select color-set for Nucleotides (NA):");
141            aws->create_toggle_field(AWAR_SEQ_NAME_SELECTOR_NA, 1);
142        }
143        else {
144            aws->label("Select color-set for Amino Acids (AA):");
145            aws->create_toggle_field(AWAR_SEQ_NAME_SELECTOR_AA, 1);
146        }
147
148        for (int cset = 0; cset < SEQ_COLOR_SETS; cset++) {
149            sprintf(buf, "%i", cset+1);
150            aws->insert_toggle(buf, " ", cset);
151        }
152        aws->update_toggle_field();
153        aws->at_newline();
154    }
155
156    const int BIG_COLUMNS    = 2;
157    const int CHAR_COL_WIDTH = 4;
158    const int SET_COL_WIDTH  = 2;
159
160    int col_x_off[BIG_COLUMNS][SEQ_COLOR_SETS+1];
161
162    aws->auto_space(3, 2);
163
164    for (int bcol = 0; bcol<BIG_COLUMNS; ++bcol) {
165        col_x_off[bcol][0] = aws->get_at_xposition();
166        aws->button_length(CHAR_COL_WIDTH);
167        aws->create_button(NULp, "Chars");
168       
169        aws->button_length(SET_COL_WIDTH);
170        for (int cset = 0; cset < SEQ_COLOR_SETS; cset++) {
171            sprintf(buf, "  %i", cset+1);
172            col_x_off[bcol][cset+1] = aws->get_at_xposition();
173            aws->create_button(NULp, buf);
174        }
175
176        if (!bcol) {
177            int set_col_pixel_width = col_x_off[0][1]-col_x_off[0][0];
178            aws->at_x(aws->get_at_xposition()+set_col_pixel_width);
179        }
180    }
181
182    aws->at_newline();
183
184    const int ROWS = SEQ_COLOR_SET_ELEMS/2;
185    for (int r = 0; r<ROWS; r++) {
186        for (int bcol = 0; bcol<BIG_COLUMNS; ++bcol) {
187            int elem = bcol*ROWS+r;
188
189            sprintf(buf, AWAR_SEQ_NAME_STRINGS_TEMPLATE, elem);
190            aws->at_x(col_x_off[bcol][0]);
191            aws->create_input_field(buf, CHAR_COL_WIDTH);
192
193            for (int cset = 0; cset < SEQ_COLOR_SETS; cset++) {
194                sprintf(buf, AWAR_SEQ_NAME_TEMPLATE, cset, elem);
195                aws->at_x(col_x_off[bcol][cset+1]);
196                aws->create_input_field(buf, SET_COL_WIDTH);
197            }
198        }
199        aws->at_newline();
200    }
201
202    aws->window_fit();
203
204    return aws;
205}
206
207// GC order needed for sequence coloring
208STATIC_ASSERT((ED4_G_SEQUENCES+1) == ED4_G_HELIX);
209STATIC_ASSERT((ED4_G_HELIX+1)     == ED4_G_COLOR_2);
210
211void ED4_seq_colors::reload() {
212    for (int i=0; i<256; i++) {
213        char_2_gc[i]   = char_2_gc_aa[i]   = base_gc;
214        char_2_char[i] = char_2_char_aa[i] = i;
215    }
216
217    AW_root *aw_root = AW_root::SINGLETON;
218
219    if (!seq_color_awars_created) create_seq_color_awars(aw_root, this);
220
221    const char *selector_awar[2] = { AWAR_SEQ_NAME_SELECTOR_NA, AWAR_SEQ_NAME_SELECTOR_AA };
222
223    for (int selector = 0; selector<2; selector++) {
224        long def_set = selector == 0 ? default_NUC_set : default_AMI_set;
225        long cset    = aw_root->awar(selector_awar[selector])->read_int();
226
227        if (cset < 0 || cset >= SEQ_COLOR_SETS) {
228            cset = def_set;
229        }
230
231        for (int elem = 0; elem < SEQ_COLOR_SET_ELEMS; elem++) {
232            char awar_name[256];
233
234            sprintf(awar_name, AWAR_SEQ_NAME_STRINGS_TEMPLATE, elem);
235            unsigned char *sc = (unsigned char *)aw_root->awar(awar_name)->read_string();
236
237            sprintf(awar_name, AWAR_SEQ_NAME_TEMPLATE, (int)cset, elem);
238            char *val = aw_root->awar(awar_name)->read_string();
239            if (!val[0]) freedup(val, "=0"); // interpret '' as '  = 0'
240
241            if (strlen(val) != 2 || val[1] >'9' || val[1] < '0') {
242                aw_message(GB_export_errorf("Error in Color Lookup Table: '%s' is not of type X#", val));
243            }
244            else {
245                if (selector == 0) { // Nucleotide colors
246                    for (int i=0; sc[i]; i++) {
247                        char_2_gc[sc[i]] = val[1]-'0' + base_gc;
248                        if (val[0] != '=') char_2_char[sc[i]] = val[0];
249                    }
250                }
251                else {
252                    for (int i=0; sc[i]; i++) {
253                        char_2_gc_aa[sc[i]] = val[1]-'0' + base_gc;
254                        if (val[0] != '=') char_2_char_aa[sc[i]] = val[0];
255                    }
256                }
257            }
258            free(val);
259            free(sc);
260        }
261    }
262
263    run_cb();
264}
265
266ED4_seq_colors::ED4_seq_colors(int baseGC, void (*changed_cb)()) {
267    cb      = changed_cb;
268    base_gc = baseGC;
269
270    this->reload();
271}
272
273// -----------------------
274//      ED4_reference
275
276ED4_reference::ED4_reference(GBDATA *_gb_main)
277    : gb_main(_gb_main),
278      nodiff('#'), // notused; overwritten by user default later
279      mindcase(true),
280      ref_len(0),
281      reference(NULp),
282      ref_term(NULp)
283{
284    reset_gap_table();
285}
286
287ED4_reference::~ED4_reference() {
288    clear();
289}
290
291void ED4_reference::reset_gap_table() {
292    for (int i = 0; i<256; ++i) is_gap[i] = false;
293}
294
295void ED4_reference::set_gap_handling(bool mindgaptype, const char *gaptypes) {
296    reset_gap_table();
297    if (!mindgaptype) { // treat all gaps as "equal"
298        for (int i = 0; gaptypes[i]; ++i) {
299            is_gap[safeCharIndex(gaptypes[i])] = true;
300        }
301    }
302}
303
304void ED4_reference::expand_to_length(int len) {
305    if (len>ref_len && is_set()) {
306        char *ref2 = ARB_calloc<char>(len+1);
307
308        if (reference) {
309            strcpy(ref2, reference);
310            free(reference);
311        }
312        reference = ref2;
313        ref_len   = len;
314    }
315}
316
317void ED4_reference::update_data() {
318    freeset(reference, ref_term->get_sequence_copy(&ref_len));
319}
320
321void ED4_reference::data_changed_cb(ED4_species_manager *IF_ASSERTION_USED(calledFrom)) {
322    e4_assert(ref_term);
323    if (ref_term) {
324#if defined(ASSERTION_USED)
325        if (calledFrom) e4_assert(ref_term->get_parent(LEV_SPECIES)->to_species_manager() == calledFrom);
326#endif
327        update_data();
328    }
329}
330static void refdata_changed_cb(ED4_species_manager *sman, ED4_reference *ref) {
331    ref->data_changed_cb(sman);
332    ED4_ROOT->request_refresh_for_specific_terminals(LEV_SEQUENCE_STRING); // refresh all sequences
333}
334static void refdata_deleted_cb() {
335    ED4_viewDifferences_disable();
336}
337
338void ED4_reference::clear() {
339    // remove change cb
340    if (ref_term) {
341        ED4_species_manager *sman = ref_term->get_parent(LEV_SPECIES)->to_species_manager();
342        sman->remove_sequence_changed_cb(makeED4_species_managerCallback(refdata_changed_cb, this));
343        sman->remove_delete_callback(makeED4_managerCallback(refdata_deleted_cb));
344    }
345
346    freenull(reference);
347    ref_len  = 0;
348    ref_term = NULp;
349}
350
351void ED4_reference::define(const ED4_sequence_terminal *rterm) {
352    clear();
353    ref_term = rterm;
354    update_data();
355
356    // add change cb
357    ED4_species_manager *sman = ref_term->get_parent(LEV_SPECIES)->to_species_manager();
358    sman->add_sequence_changed_cb(makeED4_species_managerCallback(refdata_changed_cb, this));
359    sman->add_delete_callback(makeED4_managerCallback(refdata_deleted_cb));
360}
361
362bool ED4_reference::reference_is_a_consensus() const {
363    return is_set() && ref_term->is_consensus_sequence_terminal();
364}
365
366// --------------------------------------------------------------------------------
367
368#define APREFIX_DIFF_SAVE "edit4/diff/"
369#define APREFIX_DIFF_TEMP "tmp/" APREFIX_DIFF_SAVE
370
371#define AWAR_DIFF_TYPE        APREFIX_DIFF_TEMP "type"
372#define AWAR_DIFF_NAME        APREFIX_DIFF_TEMP "name"
373#define AWAR_NODIFF_INDICATOR APREFIX_DIFF_SAVE "indicator"
374#define AWAR_DIFF_MINDCASE    APREFIX_DIFF_SAVE "mindcase"
375#define AWAR_DIFF_MINDGAPTYPE APREFIX_DIFF_SAVE "mindgaptype"
376#define AWAR_DIFF_GAPTYPES    APREFIX_DIFF_SAVE "gaptypes"
377
378enum ViewDiffType {
379    VD_DISABLED,
380    VD_SELECTED,
381    VD_FOLLOW,
382};
383
384static ED4_terminal *detect_current_ref_terminal()  {
385    ED4_cursor   *cursor  = &current_cursor();
386    ED4_terminal *refTerm = cursor->owner_of_cursor;
387
388    if (refTerm) {
389        if (!(refTerm->is_consensus_terminal() ||
390              refTerm->is_SAI_terminal() ||
391              refTerm->is_species_seq_terminal()))
392        {
393            refTerm = NULp;
394        }
395    }
396
397    if (!refTerm) {
398        aw_message("Please set the cursor to a species, SAI or group consensus.");
399    }
400
401    return refTerm;
402}
403
404static void set_diff_reference(ED4_terminal *refTerm) {
405    ED4_reference *ref = ED4_ROOT->reference;
406    if (!refTerm) {
407        ref->clear();
408    }
409    else {
410        ED4_sequence_terminal *refSeqTerm = dynamic_cast<ED4_sequence_terminal*>(refTerm);
411        if (refSeqTerm) {
412            AW_awar                   *awar_refName = AW_root::SINGLETON->awar(AWAR_DIFF_NAME);
413            ED4_species_name_terminal *nameTerm     = refSeqTerm->corresponding_species_name_terminal();
414
415            ref->define(refSeqTerm);
416            if (refTerm->is_consensus_terminal()) {
417                awar_refName->write_string(GBS_global_string("consensus %s", nameTerm->get_displayed_text()));
418            }
419            else {
420                e4_assert(refTerm->is_species_seq_terminal() || refTerm->is_SAI_terminal());
421                awar_refName->write_string(nameTerm->get_displayed_text());
422            }
423        }
424        else {
425            aw_message("Not supported for this terminal type");
426        }
427    }
428
429    ED4_ROOT->request_refresh_for_specific_terminals(LEV_SEQUENCE_STRING);
430}
431
432static SmartCharPtr last_used_ref_term_name;
433
434static void set_current_as_diffRef(bool enable) {
435    ED4_MostRecentWinContext context;
436
437    ED4_terminal *refTerm = enable ? detect_current_ref_terminal() : NULp;
438    if (!enable || refTerm) { // do not disable, if current terminal has wrong type
439        set_diff_reference(refTerm);
440        if (refTerm) last_used_ref_term_name = ARB_strdup(refTerm->id);
441    }
442}
443
444static void change_reference_cb(AW_window *aww) {
445    set_current_as_diffRef(true);
446
447    AW_awar *awar_refType = aww->get_root()->awar(AWAR_DIFF_TYPE);
448    if (awar_refType->read_int() == VD_DISABLED) {
449        awar_refType->write_int(VD_SELECTED);
450    }
451}
452
453static void diff_type_changed_cb(AW_root *awr) {
454    AW_awar      *awar_refType = awr->awar(AWAR_DIFF_TYPE);
455    ViewDiffType  type         = ViewDiffType(awar_refType->read_int());
456
457    switch (type) {
458        case VD_DISABLED:
459            set_current_as_diffRef(false);
460            break;
461
462        case VD_FOLLOW:
463        case VD_SELECTED: {
464            ED4_terminal *last_used_ref_term = NULp;
465            if (last_used_ref_term_name.isSet()) {
466                ED4_base *found = ED4_ROOT->main_manager->search_ID(&*last_used_ref_term_name);
467                if (found && found->is_terminal()) {
468                    last_used_ref_term = found->to_terminal();
469                }
470            }
471            if (last_used_ref_term) {
472                set_diff_reference(last_used_ref_term);
473                if (type == VD_FOLLOW) set_current_as_diffRef(true);
474            }
475            else {
476                set_current_as_diffRef(true);
477            }
478            if (!ED4_ROOT->reference->is_set()) {
479                awar_refType->write_int(VD_DISABLED);
480            }
481            break;
482        }
483    }
484}
485
486static void update_reference_settings(AW_root *awr) {
487    ED4_reference *ref = ED4_ROOT->reference;
488    ref->set_nodiff_indicator(awr->awar(AWAR_NODIFF_INDICATOR)->read_char_pntr()[0]);
489    ref->set_case_sensitive(awr->awar(AWAR_DIFF_MINDCASE)->read_int());
490    ref->set_gap_handling(awr->awar(AWAR_DIFF_MINDGAPTYPE)->read_int(), awr->awar(AWAR_DIFF_GAPTYPES)->read_char_pntr());
491}
492static void diff_setting_changed_cb(AW_root *awr) {
493    update_reference_settings(awr);
494    ED4_ROOT->request_refresh_for_specific_terminals(LEV_SEQUENCE_STRING);
495}
496
497static void nodiff_indicator_changed_cb(AW_root *awr) {
498    AW_awar    *awar_indicator = awr->awar(AWAR_NODIFF_INDICATOR);
499    const char *indicator      = awar_indicator->read_char_pntr();
500
501    if (!indicator[0]) {
502        awar_indicator->write_string(" ");
503    }
504    else {
505        diff_setting_changed_cb(awr);
506    }
507}
508
509static bool viewDifferences_awars_initialized = false;
510
511static void create_viewDifferences_awars(AW_root *awr) {
512    if (!viewDifferences_awars_initialized) {
513        awr->awar_int(AWAR_DIFF_TYPE, VD_DISABLED)->add_callback(diff_type_changed_cb);
514        awr->awar_string(AWAR_DIFF_NAME, "<none selected>");
515        awr->awar_string(AWAR_NODIFF_INDICATOR, " ")->add_callback(nodiff_indicator_changed_cb)->set_srt(" ?=?:? =?:?*=?");
516        awr->awar_int(AWAR_DIFF_MINDCASE, 1)->add_callback(diff_setting_changed_cb);
517        awr->awar_int(AWAR_DIFF_MINDGAPTYPE, 1)->add_callback(diff_setting_changed_cb);
518        awr->awar_string(AWAR_DIFF_GAPTYPES, "-=.?")->add_callback(diff_setting_changed_cb);
519
520        viewDifferences_awars_initialized = true;
521    }
522}
523
524void ED4_toggle_viewDifferences(AW_root *awr) {
525    static ViewDiffType lastActiveType = VD_SELECTED;
526
527    create_viewDifferences_awars(awr);
528    update_reference_settings(awr);
529
530    AW_awar      *awar_difftype = awr->awar(AWAR_DIFF_TYPE);
531    ViewDiffType  currType      = ViewDiffType(awar_difftype->read_int());
532
533    if (currType == VD_DISABLED || !ED4_ROOT->reference->is_set()) {
534        currType = lastActiveType;
535    }
536    else {
537        lastActiveType = currType;
538        currType       = VD_DISABLED;
539    }
540
541    awar_difftype->rewrite_int(currType); // rewrite to allow activation after automatic deactivation in ED4_reference (e.g. by killing ref-term)
542}
543void ED4_viewDifferences_setNewReference() {
544    set_current_as_diffRef(true);
545}
546void ED4_viewDifferences_announceTerminalChange() {
547    if (ED4_ROOT->reference->is_set() &&
548        ED4_ROOT->aw_root->awar(AWAR_DIFF_TYPE)->read_int() == VD_FOLLOW)
549    {
550        ED4_viewDifferences_setNewReference();
551    }
552}
553void ED4_viewDifferences_disable() {
554    set_current_as_diffRef(false);
555}
556
557AW_window *ED4_create_viewDifferences_window(AW_root *awr) {
558    static AW_window_simple *aws = NULp;
559    if (!aws) {
560        if (!ED4_ROOT->reference->is_set()) ED4_toggle_viewDifferences(awr); // automatically activate if off
561
562        aws = new AW_window_simple;
563        aws->init(awr, "VIEW_DIFF", "View sequence differences");
564        aws->load_xfig("edit4/viewdiff.fig");
565
566        aws->at("close");
567        aws->callback(AW_POPDOWN);
568        aws->create_button("CLOSE", "CLOSE", "C");
569
570        aws->at("help");
571        aws->callback(makeHelpCallback("viewdiff.hlp"));
572        aws->create_button("HELP", "HELP");
573
574        aws->at("show");
575        aws->create_toggle_field(AWAR_DIFF_TYPE);
576        aws->insert_toggle("None (=disable)", "N", VD_DISABLED);
577        aws->insert_toggle("Selected:",       "S", VD_SELECTED);
578        aws->insert_toggle("Follow cursor",   "F", VD_FOLLOW);
579        aws->update_toggle_field();
580
581        aws->at("ref");
582        aws->button_length(20);
583        aws->create_button(NULp, AWAR_DIFF_NAME, NULp, "+");
584
585        aws->at("set");
586        aws->button_length(4);
587        aws->callback(change_reference_cb);
588        aws->create_button("SET", "SET");
589
590        aws->at("nodiff");
591        aws->create_input_field(AWAR_NODIFF_INDICATOR);
592
593        aws->at("case");
594        aws->create_toggle(AWAR_DIFF_MINDCASE);
595
596        aws->at("gap");
597        aws->create_toggle(AWAR_DIFF_MINDGAPTYPE);
598        aws->at("gapchars");
599        aws->create_input_field(AWAR_DIFF_GAPTYPES, 8);
600    }
601    return aws;
602}
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.