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Author Date Id Revision
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| 1 | // ================================================================ // |
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| 2 | // // |
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| 3 | // File : GDE_extglob.h // |
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| 4 | // // |
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| 5 | // Institute of Microbiology (Technical University Munich) // |
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| 6 | // http://www.arb-home.de/ // |
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| 7 | // // |
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| 8 | // ================================================================ // |
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| 10 | #ifndef GDE_EXTGLOB_H |
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| 11 | #define GDE_EXTGLOB_H |
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| 13 | enum GapCompression { |
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| 14 | COMPRESS_NONE = 0, |
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| 15 | COMPRESS_VERTICAL_GAPS = 1, |
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| 16 | COMPRESS_ALL = 2, |
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| 17 | COMPRESS_NONINFO_COLUMNS = 3, |
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| 18 | }; |
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| 19 | |
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| 20 | #define GDEMAXMENU 100 |
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| 21 | |
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| 22 | class AP_filter; |
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| 23 | |
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| 24 | #ifndef GDE_PROTO_H |
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| 25 | #include "GDE_proto.h" |
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| 26 | #endif |
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| 27 | |
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| 28 | extern Gmenu menu[GDEMAXMENU]; |
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| 29 | extern int num_menus; |
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| 30 | extern int DataType; |
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| 31 | extern int FileFormat; |
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| 32 | extern int OVERWRITE; |
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| 33 | extern int BlockInput; |
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| 34 | extern char FileName[80]; |
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| 35 | |
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| 36 | #ifdef SeeAlloc |
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| 37 | int TotalCalloc = 0; |
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| 38 | int TotalRealloc = 0; |
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| 39 | #endif |
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| 40 | |
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| 41 | |
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| 42 | // Months of the year |
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| 43 | extern const char *GDEmonth[12]; |
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| 44 | |
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| 45 | // Tables for DNA/RNA <--> ASCII translation |
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| 46 | extern int Default_RNA_Trans[]; |
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| 47 | extern int Default_DNA_Trans[]; |
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| 48 | extern int Default_NA_RTrans[]; |
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| 49 | |
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| 50 | // Character->color lookup table |
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| 51 | extern int Default_NAColor_LKUP[]; |
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| 52 | extern int Default_PROColor_LKUP[]; |
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| 53 | |
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| 54 | #else |
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| 55 | #error GDE_extglob.h included twice |
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| 56 | #endif // GDE_EXTGLOB_H |
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