Changeset 8288 for branches

Show
Ignore:
Timestamp:
09/12/11 10:48:37 (6 months ago)
Author:
westram
Message:
  • removed some useless virtualization
Location:
branches/e4fix/EDIT4
Files:
2 modified

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • branches/e4fix/EDIT4/ED4_base.cxx

    r8286 r8288  
    312312const char *ED4_base::resolve_pointer_to_char_pntr(int *) const { return NULL; } 
    313313 
    314 GB_ERROR ED4_base::write_sequence(const char * /* seq */, int /* seq_len */) 
    315 { 
    316     e4_assert(0); 
    317     return 0; 
    318 } 
    319  
    320  
    321 ED4_returncode ED4_manager::create_group(ED4_group_manager **group_manager, GB_CSTR group_name)                 // creates group from user menu of AW_Window 
    322 { 
    323     ED4_species_manager         *species_manager        = NULL; 
    324     ED4_species_name_terminal   *species_name_terminal  = NULL; 
    325     ED4_sequence_manager        *sequence_manager       = NULL; 
    326     ED4_sequence_info_terminal  *sequence_info_terminal = NULL; 
    327     ED4_sequence_terminal       *sequence_terminal      = NULL; 
    328     ED4_spacer_terminal         *group_spacer_terminal1 = NULL; 
    329     ED4_spacer_terminal         *group_spacer_terminal2 = NULL; 
    330     ED4_multi_species_manager   *multi_species_manager  = NULL; 
    331     ED4_bracket_terminal        *bracket_terminal       = NULL; 
     314ED4_returncode ED4_manager::create_group(ED4_group_manager **group_manager, GB_CSTR group_name) { 
     315    // creates group from user menu of AW_Window 
     316 
     317    ED4_species_manager        *species_manager        = NULL; 
     318    ED4_species_name_terminal  *species_name_terminal  = NULL; 
     319    ED4_sequence_manager       *sequence_manager       = NULL; 
     320    ED4_sequence_info_terminal *sequence_info_terminal = NULL; 
     321    ED4_sequence_terminal      *sequence_terminal      = NULL; 
     322    ED4_spacer_terminal        *group_spacer_terminal1 = NULL; 
     323    ED4_spacer_terminal        *group_spacer_terminal2 = NULL; 
     324    ED4_multi_species_manager  *multi_species_manager  = NULL; 
     325    ED4_bracket_terminal       *bracket_terminal       = NULL; 
    332326 
    333327    char buffer[35]; 

  • branches/e4fix/EDIT4/ed4_class.hxx

    r8286 r8288  
    10371037    virtual bool calc_bounding_box()                                  = 0; 
    10381038 
    1039     virtual ED4_returncode  clear_background(int color=0); 
     1039    ED4_returncode  clear_background(int color=0); 
    10401040 
    10411041    ED4_returncode clear_whole_background();       // clear AW_MIDDLE_AREA 
    … …  
    10441044 
    10451045    // functions concerned with links in the hierarchy 
    1046     virtual ED4_returncode  set_links(ED4_base *width_link, ED4_base *height_link); 
    1047     virtual ED4_returncode  link_changed(ED4_base *link); 
     1046    ED4_returncode  set_links(ED4_base *width_link, ED4_base *height_link); 
     1047    ED4_returncode  link_changed(ED4_base *link); 
    10481048 
    10491049    // functions concerned with special initialization 
    1050     virtual void set_properties  (ED4_properties prop); 
     1050    void set_properties  (ED4_properties prop); 
    10511051 
    10521052    // functions concerned with coordinate transformation 
    … …  
    10901090 
    10911091    // general purpose functions 
    1092     virtual ED4_base        *search_ID(const char *id) = 0; 
    1093     virtual void  check_all(); 
    1094     virtual short in_border(AW_pos abs_x, AW_pos abs_y, ED4_movemode mode); 
    1095     virtual ED4_returncode      set_width(); 
    1096      
     1092    virtual ED4_base *search_ID(const char *id) = 0; 
     1093 
     1094    void  check_all(); 
     1095    short in_border(AW_pos abs_x, AW_pos abs_y, ED4_movemode mode); 
     1096    ED4_returncode set_width(); 
     1097 
    10971098 
    10981099    ED4_AREA_LEVEL get_area_level(ED4_multi_species_manager **multi_species_manager=0) const; // returns area we belong to and the next multi species manager of the area 
    … …  
    11031104    bool is_child_of(ED4_manager *Parent) { return has_parent(Parent); } 
    11041105 
    1105     ED4_group_manager  *is_in_folded_group() const; 
    11061106    virtual char       *resolve_pointer_to_string_copy(int *str_len = 0) const; 
    11071107    virtual const char *resolve_pointer_to_char_pntr(int *str_len = 0) const; 
    1108     virtual GB_ERROR    write_sequence(const char *seq, int seq_len); 
    1109     char               *get_name_of_species();        // go from terminal to name of species 
     1108 
     1109    ED4_group_manager  *is_in_folded_group() const; 
     1110    char *get_name_of_species();                      // go from terminal to name of species 
    11101111 
    11111112    // functions which refer to the selected object(s), i.e. across the hierarchy 
    … …  
    12211222    virtual ED4_returncode  Resize(); 
    12221223    virtual bool calc_bounding_box(); 
    1223     virtual ED4_returncode  distribute_children(); 
     1224 
     1225    ED4_returncode distribute_children(); 
    12241226 
    12251227    // top-down functions, means travelling down the hierarchy 
    12261228    virtual ED4_returncode  event_sent_by_parent(AW_event *event, AW_window *aww); 
    12271229    virtual ED4_returncode  set_refresh(int clear=1); 
    1228     ED4_returncode      clear_refresh(); 
    1229     virtual ED4_returncode      resize_requested_by_parent(); 
     1230    ED4_returncode          clear_refresh(); 
     1231    virtual ED4_returncode  resize_requested_by_parent(); 
    12301232 
    12311233    virtual void delete_requested_children(); 
    … …  
    12411243    virtual ARB_ERROR route_down_hierarchy(ED4_cb0 cb) { return route_down_hierarchy(ED4_cb(cb), 0, 0); } 
    12421244 
    1243     virtual ED4_base*      find_first_that(ED4_level level, bool (*condition)(ED4_base *to_test, AW_CL arg), AW_CL arg); 
    1244     virtual ED4_base*      find_first_that(ED4_level level, bool (*condition)(ED4_base *to_test)) { 
     1245    ED4_base* find_first_that(ED4_level level, bool (*condition)(ED4_base *to_test, AW_CL arg), AW_CL arg); 
     1246    ED4_base* find_first_that(ED4_level level, bool (*condition)(ED4_base *to_test)) { 
    12451247        return find_first_that(level, (bool(*)(ED4_base*, AW_CL))condition, (AW_CL)0); 
    12461248    } 
    … …  
    12591261 
    12601262    void update_consensus(ED4_manager *old_parent, ED4_manager *new_parent, ED4_base *sequence); 
    1261     virtual ED4_returncode  rebuild_consensi(ED4_base *start_species, ED4_update_flag update_flag); 
    1262  
    1263     virtual ED4_returncode  check_in_bases(ED4_base *added_base); 
    1264     virtual ED4_returncode  check_out_bases(ED4_base *subbed_base); 
    1265     virtual ED4_returncode  update_bases(const ED4_base *old_base, const ED4_base *new_base, PosRange range = PosRange::whole()); 
    1266     virtual ED4_returncode  update_bases(const char *old_seq, int old_len, const char *new_seq, int new_len, PosRange range = PosRange::whole()); 
    1267     virtual ED4_returncode  update_bases(const char *old_seq, int old_len, const ED4_base *new_base, PosRange range = PosRange::whole()); 
    1268     virtual ED4_returncode  update_bases(const ED4_char_table *old_table, const ED4_char_table *new_table, PosRange range = PosRange::whole()); 
    1269  
    1270     virtual ED4_returncode  update_bases_and_rebuild_consensi(const char *old_seq, int old_len, ED4_base *species, ED4_update_flag update_flag, PosRange range = PosRange::whole()); 
     1263    ED4_returncode rebuild_consensi(ED4_base *start_species, ED4_update_flag update_flag); 
     1264 
     1265    ED4_returncode  check_in_bases(ED4_base *added_base); 
     1266    ED4_returncode  check_out_bases(ED4_base *subbed_base); 
     1267 
     1268    ED4_returncode  update_bases(const ED4_base *old_base, const ED4_base *new_base, PosRange range = PosRange::whole()); 
     1269    ED4_returncode  update_bases(const char *old_seq, int old_len, const char *new_seq, int new_len, PosRange range = PosRange::whole()); 
     1270    ED4_returncode  update_bases(const char *old_seq, int old_len, const ED4_base *new_base, PosRange range = PosRange::whole()); 
     1271    ED4_returncode  update_bases(const ED4_char_table *old_table, const ED4_char_table *new_table, PosRange range = PosRange::whole()); 
     1272 
     1273    ED4_returncode  update_bases_and_rebuild_consensi(const char *old_seq, int old_len, ED4_base *species, ED4_update_flag update_flag, PosRange range = PosRange::whole()); 
    12711274 
    12721275    // handle moves across the hierarchy 
    12731276    virtual ED4_returncode  handle_move(ED4_move_info *moveinfo); 
    1274     virtual ED4_base        *get_competent_child(AW_pos x, AW_pos y, ED4_properties relevant_prop); 
    1275     virtual ED4_base        *get_competent_clicked_child(AW_pos x, AW_pos y, ED4_properties relevant_prop); 
    1276     virtual ED4_base        *search_spec_child_rek(ED4_level level);    // recursive search for level 
     1277 
     1278    virtual ED4_base *get_competent_child(AW_pos x, AW_pos y, ED4_properties relevant_prop); 
     1279    virtual ED4_base *get_competent_clicked_child(AW_pos x, AW_pos y, ED4_properties relevant_prop); 
     1280    virtual ED4_base *search_spec_child_rek(ED4_level level);           // recursive search for level 
    12771281 
    12781282    // general purpose functions 
    … …  
    12841288 
    12851289    // general folding functions 
    1286     virtual ED4_returncode  unfold_group(char *bracketID_to_unfold); 
    1287     virtual ED4_returncode  fold_group(char *bracketID_to_fold); 
     1290    ED4_returncode  unfold_group(char *bracketID_to_unfold); 
     1291    ED4_returncode  fold_group(char *bracketID_to_fold); 
    12881292 
    12891293    ED4_returncode hide_children(); 
    … …  
    13211325    virtual ED4_returncode  calc_size_requested_by_parent(); 
    13221326 
    1323     virtual ED4_returncode      draw_drag_box(AW_pos x, AW_pos y, GB_CSTR text = NULL, int cursor_y=-1); 
     1327    ED4_returncode draw_drag_box(AW_pos x, AW_pos y, GB_CSTR text = NULL, int cursor_y=-1); 
    13241328 
    13251329    // functions which concern the object as a child 
    1326     virtual ED4_returncode  set_refresh(int clear=1); 
    1327     virtual ED4_returncode  resize_requested_by_child(); 
    1328     virtual ED4_returncode      resize_requested_by_parent(); 
     1330    virtual ED4_returncode set_refresh(int clear=1); 
     1331    virtual ED4_returncode resize_requested_by_child(); 
     1332    virtual ED4_returncode resize_requested_by_parent(); 
    13291333 
    13301334    virtual void delete_requested_children(); 
    … …  
    13331337    virtual ED4_returncode  move_requested_by_parent(ED4_move_info *mi); 
    13341338    virtual ED4_returncode  event_sent_by_parent(AW_event *event, AW_window *aww); 
    1335     virtual ED4_base        *get_competent_child(AW_pos x, AW_pos y, ED4_properties relevant_prop); 
    1336     virtual ED4_base        *get_competent_clicked_child(AW_pos x, AW_pos y, ED4_properties relevant_prop); 
     1339    virtual ED4_base *get_competent_child(AW_pos x, AW_pos y, ED4_properties relevant_prop); 
     1340    virtual ED4_base *get_competent_clicked_child(AW_pos x, AW_pos y, ED4_properties relevant_prop); 
    13371341    virtual ED4_returncode  move_requested_by_child(ED4_move_info *moveinfo); 
    13381342    virtual ED4_returncode  handle_move(ED4_move_info *moveinfo); 
    1339     virtual ED4_returncode      kill_object(); 
     1343 
     1344    ED4_returncode kill_object(); 
    13401345 
    13411346    // general purpose functions 
    1342     virtual ED4_base      *search_ID(const char *id); 
    1343     virtual char          *resolve_pointer_to_string_copy(int *str_len = 0) const; // concerning terminal and database 
    1344     virtual const char    *resolve_pointer_to_char_pntr(int *str_len = 0) const; // concerning terminal and database 
    1345     virtual GB_ERROR       write_sequence(const char *seq, int seq_len); 
     1347    virtual ED4_base *search_ID(const char *id); 
     1348    virtual char          *resolve_pointer_to_string_copy(int *str_len = 0) const; 
     1349    virtual const char    *resolve_pointer_to_char_pntr(int *str_len = 0) const; 
    13461350    virtual ED4_returncode remove_callbacks(); 
     1351 
     1352    GB_ERROR write_sequence(const char *seq, int seq_len); 
    13471353 
    13481354    void scroll_into_view(AW_window *aww); 
    … …  
    13701376    void init(ED4_sequence_info_terminal *, ED4_sequence_terminal *, ED4_sequence_info_terminal *, ED4_columnStat_terminal *); 
    13711377 
    1372     ED4_sequence_info_terminal *get_ref_sequence_info()     { return ref_sequence_info; } 
    1373     ED4_sequence_terminal *get_ref_sequence()           { return ref_sequence; } 
    1374     ED4_sequence_info_terminal *get_ref_column_stat_info()  { return ref_column_stat_info; } 
    1375     ED4_columnStat_terminal *get_ref_column_stat()      { return ref_column_stat; } 
     1378    ED4_sequence_info_terminal *get_ref_sequence_info()    { return ref_sequence_info; } 
     1379    ED4_sequence_terminal      *get_ref_sequence()         { return ref_sequence; } 
     1380    ED4_sequence_info_terminal *get_ref_column_stat_info() { return ref_column_stat_info; } 
     1381    ED4_columnStat_terminal    *get_ref_column_stat()      { return ref_column_stat; } 
    13761382 
    13771383    ED4_reference_terminals()  { null(); } 
    … …  
    13931399    ED4_WinContext() : ed4w(0), device(0) {} 
    13941400    static ED4_WinContext current_context; 
    1395  
     1401     
    13961402public: 
    13971403    inline ED4_WinContext(AW_window *aww_);