source: branches/alilink/SL/ALILINK/LinkAlignments.h

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  • added a protein test DB with short alignments
  • tdd code to link, unlink and test for linkage
  • added broken tests showing no automatic realignment/translation happens yet
File size: 1.1 KB
Line 
1// ============================================================== //
2//                                                                //
3//   File      : LinkAlignments.h                                 //
4//   Purpose   :                                                  //
5//                                                                //
6//   Coded by Ralf Westram (coder@reallysoft.de) in August 2014   //
7//   http://www.arb-home.de/                                      //
8//                                                                //
9// ============================================================== //
10
11#ifndef LINKALIGNMENTS_H
12#define LINKALIGNMENTS_H
13
14#ifndef ARBDB_BASE_H
15#include <arbdb_base.h>
16#endif
17
18const char *ALI_is_linked(GBDATA *gb_main, const char *ali);
19bool        ALI_are_linked(GBDATA *gb_main, const char *ali1, const char *ali2);
20
21GB_ERROR ALI_link(GBDATA *gb_main, const char *ali1, const char *ali2);
22GB_ERROR ALI_unlink(GBDATA *gb_main, const char *ali1, const char *ali2);
23
24#else
25#error LinkAlignments.h included twice
26#endif // LINKALIGNMENTS_H
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.