| 1 | // =========================================================== // |
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| 3 | // File : st_window.hxx // |
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| 4 | // Purpose : // |
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| 6 | // Institute of Microbiology (Technical University Munich) // |
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| 7 | // http://www.arb-home.de/ // |
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| 8 | // // |
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| 9 | // =========================================================== // |
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| 11 | #ifndef ST_WINDOW_HXX |
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| 12 | #define ST_WINDOW_HXX |
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| 13 | |
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| 14 | #ifndef AW_WINDOW_HXX |
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| 15 | #include <aw_window.hxx> |
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| 16 | #endif |
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| 17 | |
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| 18 | class ST_ML; |
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| 19 | class AP_tree; |
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| 20 | |
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| 21 | void STAT_set_postcalc_callback(ST_ML *st_ml, WindowCallbackSimple postcalc_cb, AW_window *cb_win); |
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| 22 | AW_window *STAT_create_main_window(AW_root *aw_root, ST_ML *st_ml); |
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| 23 | |
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| 24 | ST_ML *STAT_create_ST_ML(GBDATA *gb_main); |
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| 25 | void STAT_destroy_ST_ML(ST_ML*& st_ml); |
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| 26 | |
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| 27 | typedef unsigned char ST_ML_Color; |
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| 28 | enum st_report_enum { |
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| 29 | ST_QUALITY_REPORT_NONE, |
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| 30 | ST_QUALITY_REPORT_TEMP, |
|---|
| 31 | ST_QUALITY_REPORT_YES |
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| 32 | }; |
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| 33 | |
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| 34 | AP_tree *STAT_find_node_by_name(ST_ML *st_ml, const char *species_name); |
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| 35 | ST_ML_Color *STAT_get_color_string(ST_ML *st_ml, char *species_name, AP_tree *node, int start_ali_pos, int end_ali_pos); |
|---|
| 36 | bool STAT_update_ml_likelihood(ST_ML *st_ml, char *result[4], int& latest_update, const char *species_name, AP_tree *node); |
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| 37 | AW_window *STAT_create_chimera_check_window(AW_root *aw_root, GBDATA *gb_main); |
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| 38 | |
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| 39 | |
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| 40 | #else |
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| 41 | #error st_window.hxx included twice |
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| 42 | #endif // ST_WINDOW_HXX |
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