source: branches/alilink/UNIT_TESTER/run/TEST_loadsave_ascii.arb

Last change on this file was 18126, checked in by westram, 5 years ago
File size: 3.5 KB
Line 
1/*ARBDB ASCII*/
2species_data                    %% (%
3        species                 :5000   %$ (%
4                name                    :7600   "MetMazei"
5                ali_16s                         %% (%
6                        data                    :7000   ".....................AUUCUGGUU-----GA--U-CC-U-G-CCAG-AG-GU-U-AC-U-GC--U-AU-C--G-GU-GUUC--GC---C-U--AAGCCA-U-GC-G-AGU-CAU-A-UGU---------A---------------.............."
7                        %) /*ali_16s*/
8
9                acc                             "X69874"
10                full_name               :4400   "Methanosarcina mazei"
11                tax                             " [DEW] Archaea|Euryarchaeota|Methanomicrobium group [EBI] Prokaryota; Bacteria; Mendosicutes; Archaeobacteria;|Methanomicrobiales; Methanosarcinaceae."
12                seqcheck                        "ARB_C2C11C55"
13                AL                              "nov97"
14                ARB_color                       %i 2
15                float_test                      %f 3.141592
16                float_test                      %f 3.141592e-02
17                float_test                      %f 314.159210
18                float_test                      %f 3.141592e-05
19                float_test                      %f 3.141592e+05
20                float_test                      %f 3.141592e-10
21                float_test                      %f 3.141592e+10
22                float_test                      %f 3.141592e-35
23                float_test                      %f 3.141592e+35
24                bits_test                       %I      "--------++++-+--+-+----+----+-+-"
25                %) /*species*/
26
27        species                 :5000   %% (%
28                name                    :7600   "MhcBurto"
29                acc                             "X65537"
30                full_name               :4400   "Methano-coccoides burtonii"
31                tax                             " [DEW] Archaea|Euryarchaeota|Methanomicrobium group [EBI] Prokaryota; Bacteria; Mendosicutes; Archaeobacteria;|Methanomicrobiales; Methanosarcinaceae."
32                seqcheck                        "ARB_8F6E27E5"
33                AL                              "nov97"
34                ARB_color                       %i 2
35                %) /*species*/
36
37        %) /*species_data*/
38
39presets                         %% (%
40        key_data                        %% (%
41                key                             %% (%
42                        key_name                        "ali_16s"
43                        key_type                        %i 15
44                        %) /*key*/
45
46                key                             %% (%
47                        key_name                        "ali_16s/data"
48                        key_type                        %i 12
49                        key_hidden                      %i 0
50                        %) /*key*/
51
52                key                             %% (%
53                        key_name                        "name"
54                        key_type                        %i 12
55                        key_hidden                      %i 0
56                        %) /*key*/
57
58                key                             %% (%
59                        key_name                        "full_name"
60                        key_type                        %i 12
61                        key_hidden                      %i 0
62                        %) /*key*/
63
64                %) /*key_data*/
65
66        alignment                       %% (%
67                alignment_name                  "ali_16s"
68                alignment_len                   %i 165
69                aligned                         %i 1
70                alignment_write_security                %i 5
71                alignment_type                  "rna"
72                alignment_rem                   ""
73                auto_format                     %i 0
74                %) /*alignment*/
75
76        use                             "ali_16s"
77        %) /*presets*/
78
79extended_data                   %% (%
80        extended                        %% (%
81                name                    :7000   "ECOLI"
82                errors                          %i 0
83                acc                             "J01695"
84                full_name                       "Escherichia coli"
85                ali_16s                         %% (%
86                        data                            "........A-A--CU---------------C-A-A-A-G-GA-G--AC-U-G-CCA--G-U------------------------------------G-A---UAA-------------------------------------A-C-U-G..............."
87                        %) /*ali_16s*/
88
89                aligned                         "12dec94"
90                %) /*extended*/
91
92        extended                        %$ (%
93                name                            "markerline"
94                ali_16s                         %% (%
95                        bits                            %I      "---------------------+++++++++-----++--+-++-+-+-++++-++-++-+-++-+-++--+-++-+--+-++-++++--++---+-+--++++++-+-++-+-+++-+++-+-+++---------+-----------------------------"
96                        _TYPE                           "FMX: Filter by Maximum Frequency: Start 0; Stop 164; Minhom 60%; Maxhom 100%"
97                        %) /*ali_16s*/
98
99                %) /*extended*/
100
101        %) /*extended_data*/
102
103mixed_types                     %% (%
104        str                             "text"
105        str_percent                     %s      "%text"
106        byte                            %y 255
107        ints                            %N      10000000790:::-::.=::=-.0102==
108        ints_empty                      %N      1:90
109        floats                          %F      10000000590.404B404C.4058.89:0D::A1.5B
110        bytes                           %Y     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
111        %) /*mixed_types*/
112
113description                     "User text"
114genom_db                        %i 0
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.