source: branches/help/UNIT_TESTER/run/TEST_opti_ascii_in.arb

Last change on this file was 17953, checked in by westram, 5 years ago
  • fix number of tabs between key and data (ASCII DB format)
    • auto-updated all databases.
File size: 111.7 KB
Line 
1/*ARBDB ASCII*/
2species_data                    %% (%
3        species                 :5000   %% (%
4                name                    :7600   "MetMazei"
5                acc                             "X69874"
6                full_name               :4400   "Methanosarcina mazei"
7                warning                         "rdp sequence, differs in dew"
8                title                           " [RDP] Methanogenic bacterium GO1: an acetoclastic methanogen that is closely related to Methanosarcina frisius [EBI,DEW] METHANOGENIC BACTERIUM GO1: AN ACETOCLASTIC METHANOGEN THAT IS CLOSELY RELATED TO METHANOSARCINA FRISIUS"
9                journal                         " [DEW] Syst. Appl. Microbiol. date 1993 vol 15 pgs 582-586 [EBI] Syst. Appl. Microbiol. 807:0-0(1993). Submitted (28-DEC-1992) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. R. Eggen, Wageningen Agricultural University, H. Van Suchtelenweg 4, Wageningen 6703 CT, THE NETHERLANDS [RDP] Syst. Appl. Microbiol. 807, 0-0 (1993)"
10                author                          " [EBI] Eggen R.I.L., GEERLING A.C.M., GROOT P.W.J., Ludwig W., Vos W.M.; Eggen R.; [RDP,DEW] Eggen,R.I.L., GEERLING,A.C.M., GROOT,P.W.J., Ludwig,W. and Vos,W.M."
11                file                            " [EBI] mftrnaala.em_ba [DEW] Metfr0.AEU"
12                date                            " [RDP] 15-JAN-1993 [EBI] 15-JAN-1993 (Rel. 34, Created)|15-JAN-1993 (Rel. 34, Last updated, Version 2)"
13                gene                            " [DEW] SSU [EBI_KW] 16S ribosomal RNA 23S ribosomal RNA transfer RNA-Ala. [EBI_DE] M.frisius transfer RNA-Ala gene, and 16S and 23S ribosomal RNA|genes."
14                db_name                         " [DEW,RDP] Methanosarcina frisius [EBI] Methanosarcina frisia [RDP] Methanosarcina mazei"
15                id                              " [RDP] Msr.frisi2 [EBI] MFTRNAALA"
16                tax                             " [DEW] Archaea|Euryarchaeota|Methanomicrobium group [EBI] Prokaryota; Bacteria; Mendosicutes; Archaeobacteria;|Methanomicrobiales; Methanosarcinaceae."
17                seqcheck                        "ARB_C2C11C55"
18                %) /*species*/
19
20        species                 :5000   %% (%
21                name                    :7600   "MthBurto"
22                acc                             "X65537"
23                full_name               :4400   "Methano-coccoides burtonii"
24                title                           " [EBI,DEW] A methanogenic bacterium from ACE lake, antarctica: Methanococcoides burtonii sp. nov. [RDP] A methanogenic bacterium from ACE lake, antarctica: Methanococcoides burtonii sp. nov"
25                journal                         " [EBI] Submitted (13-APR-1992) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. W. Ludwig, Lehrst f Mikrobiologie TU Muenchen, Arcisstr 21, 8000 Muenchen 2, FRG"
26                author                          " [RDP,DEW] Franzmann,P.D., Springer,N., Ludwig,W., Conway de Macario,E. and Rohde,M. [EBI] Ludwig W.; Franzmann P.D., Springer N., Ludwig W., Conway de Macario E., Rohde M.;"
27                file                            " [EBI] mb16srnag.em_ba [DEW] Metbur.AEU"
28                date                            " [RDP] 09-DEC-1993 [EBI] 09-DEC-1993 (Rel. 38, Created)|09-DEC-1993 (Rel. 38, Last updated, Version 2)"
29                gene                            " [DEW] SSU [EBI_KW] 16S ribosomal RNA ribosomal RNA. [EBI_DE] M.burtonii gene for 16S rRNA"
30                db_name                         " [DEW] Methanococcoides burtonii (P.) [RDP,EBI] Methanococcoides burtonii"
31                id                              " [RDP] Mcc.burton [EBI] MB16SRNAG"
32                tax                             " [DEW] Archaea|Euryarchaeota|Methanomicrobium group [EBI] Prokaryota; Bacteria; Mendosicutes; Archaeobacteria;|Methanomicrobiales; Methanosarcinaceae."
33                seqcheck                        "ARB_8F6E27E5"
34                remark2                         "seqcheck acc"
35                %) /*species*/
36
37        species                 :5000   %% (%
38                name                    :7600   "MtsHunga"
39                acc                             "M60880"
40                full_name               :4400   "Methanospirillum h_ungatei"
41                title                           " [RDP,EBI,DEW] The phylogeny of archaebacteria"
42                journal                         " [EBI] Syst. Appl. Microbiol. 6:251-256(1985). [RDP] Syst. Appl. Microbiol. 6, 251-256 (1985) [DEW] Syst. Appl. Microbiol. date 1985 vol 6 pgs 251-256"
43                author                          " [EBI] Yang D., Kaine B.P., Woese C.R.; [RDP,DEW] Yang,D., Kaine,B.P. and Woese,C.R."
44                file                            " [DEW] Methun.AEU [EBI] mhrgdx.em_ba"
45                date                            " [RDP] 22-MAR-1991 [EBI] 24-MAR-1991 (Rel. 27, Created)|28-FEB-1992 (Rel. 31, Last updated, Version 3)"
46                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA ribosomal RNA small subunit ribosomal RNA. [DEW] SSU [EBI_DE] M.hungatei 16S ribosomal RNA."
47                db_name                         " [RDP,EBI,DEW] Methanospirillum hungatei"
48                id                              " [RDP] Msp.hungat [EBI] MHRGDX"
49                tax                             " [DEW] Archaea|Euryarchaeota|Methanomicrobium group [EBI] Prokaryota; Bacteria; Mendosicutes; Archaeobacteria;|Methanobacteriales; Methanobacteriaceae."
50                seqcheck                        "ARB_70CBDADA"
51                %) /*species*/
52
53        species                 :5000   %% (%
54                name                    :7600   "NatMagad"
55                full_name               :4400   "N_atronobacterium magadii"
56                acc                             "X72495"
57                warning                         "rdp sequence, differences in ebi"
58                title                           " [RDP] Nucleotide Sequence of the 16S Ribosomal RNA Gene from the magadii, and the Phylogeny of Halobacteria Haloaliphatic Archaeon (Archaebacterium) [DEW] Nucleotide Sequence of the 16S Ribosomal RNA Gene from the  Haloalkaliphilic Archaeon (Archaebacterium) Natrobacterium  magadii, and the Phylogeny of Halobacteria [EBI] Nucleotide Sequence of the 16S Ribosomal RNA Gene from the Haloalkaliphilic Archaeon (Archaebacterium) Natrobacterium magadii, and the Phylogeny of Halobacteria The phylogenetic position of the haloalkaliphilic archaeon Natronobacterium magadii, determined from its 23S ribosomal RNA sequence."
59                journal                         " [DEW] Syst. Appl. Microbiol. date 1991 vol 14 pgs 352-357 [RDP] Syst. Appl. Microbiol. 14, 352-357 (1991) [EBI] Syst. Appl. Microbiol. 14:352-357(1991). Submitted (29-APR-1993) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. D. Lodwick, University of Leicester, Dept of Medicine Clinical Sc Bldg, Leicester Royal Infirmary, P O Box 65, Leicester LE2 7LX, UK Syst. Appl. Microbiol. 17:402-404(1994)."
60                author                          " [EBI] Lodwick D., Ross H.N.M., Walker J.A., Almond J.W., Grant W.D.; Lodwick D.; Lodwick D., McGenity T.J., Grant W.D.; [RDP] Lodwick,D., Ross,H.N.M., Walker,J.A. and Almond,J.W. [DEW] Lodwick D., Ross H.N.M., Walker J.A., Almond J.W. and Grant W.D."
61                file                            " [DEW] Natmag.AEU [EBI] nmrrna.em_ba"
62                date                            " [RDP] 11-MAY-1993 [EBI] 11-MAY-1993 (Rel. 35, Created)|10-FEB-1995 (Rel. 42, Last updated, Version 9)"
63                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA 16S rRNA gene. [DEW] SSU [EBI_DE] N.magadii rRNA operon"
64                db_name                         " [RDP,EBI,DEW] Natronobacterium magadii"
65                id                              " [EBI] NMRRNA [RDP] Ntr.magadi"
66                tax                             " [DEW] Archaea|Euryarchaeota|Halobacteria [EBI] Prokaryota; Bacteria; Mendosicutes; Archaeobacteria;|Halobacteriales; Halobacteriaceae."
67                seqcheck                        "ARB_579E9867"
68                %) /*species*/
69
70        species                 :5000   %% (%
71                name                    :7600   "DicTherm"
72                acc                             "X69194"
73                full_name               :4400   "Dictyoglomus thermophilum"
74                title                           " [RDP,EBI,DEW] The phylogenetic position of Dictyoglomus based on 16S rRNA sequence analysis"
75                journal                         " [EBI] Submitted (13-NOV-1992) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. W. Ludwig, Lehrst. f. Mikrobiologie TU Muenchen, Arcisstr. 21, 8000 Muenchen 2, FRG FEMS Microbiol. Lett. 107:317-320(1993). [RDP] FEMS Microbiol. Lett. 107, 317-320 (1993) [DEW] FEMS Microbiol. Lett. date 1993 vol 17 pgs 317-320"
76                author                          " [RDP,DEW] Love,C.A., Patel,B.K.C., Stackebrandt,E. and Ludwig,W. [EBI] Ludwig W.; Love C.A., Patel B.K.C., Stackebrandt E., Ludwig W.;"
77                file                            " [DEW] Dicthe.EFU [DEW] DictheMi.MFU [EBI] dt16srna.em_fun"
78                date                            " [RDP] 29-APR-1993 [EBI] 28-APR-1993 (Rel. 35, Created)|29-APR-1993 (Rel. 35, Last updated, Version 3)"
79                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA. [EBI_DE] D.thermophilum gene for 16S rRNA [DEW] SSU"
80                db_name                         " [RDP,EBI,DEW] Dictyoglomus thermophilum"
81                id                              " [EBI] DT16SRNA [RDP] Dgl.thmoph"
82                tax                             " [DEW] Eukarya|Fungi|Eumycota|Zygomycotina|Zygomycetes [DEW] Mitochondria Fungi Eumycota Zygomycotina Zygomycetes [EBI] Eukaryota; Plantae; Thallobionta; Eumycota; Zygomycotina;|Zygomycetes; Endogonales; Endogonaceae."
83                seqcheck                        "ARB_56D1CA2D"
84                %) /*species*/
85
86        species                 :5000   %% (%
87                name                    :7600   "CalSacch"
88                acc                             "L09178"
89                full_name               :4400   "\"Caldocellum saccharolyticum\""
90                title                           " [RDP,EBI,DEW] Phylogenetic analysis of anaerobic thermophilic bacteria: Aid for their classification"
91                journal                         " [RDP] J. Bacteriol. 175, 4772-4779 (1993) [EBI] J. Bacteriol. 175:4772-4779(1993). [DEW] J. Bacteriol. date 1993 vol 175 pgs 4772-4779"
92                author                          " [RDP,DEW] Rainey,F.A., Ward,N.L., Morgan,H.W. and Stackebrandt,E. [EBI] Rainey F.A., Ward N.L., Morgan H.W., Stackebrandt E.;"
93                file                            " [DEW] UnkL09.BGL [EBI] gpqrg16s.em_ba"
94                date                            " [RDP] 13-MAY-1991 [EBI] 04-JAN-1994 (Rel. 38, Created)|07-FEB-1994 (Rel. 38, Last updated, Version 5)"
95                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA. [DEW] SSU [EBI_DE] Gram-positive bacterial sp. (strain Tp8T.6331) 16S ribosomal RNA|(16S rRNA) gene."
96                db_name                         " [EBI] Unknown [RDP] \"Caldocellum saccharolyticum\" [DEW] Unknown L09178"
97                id                              " [EBI] GPQRG16S [RDP] Cal.saccha"
98                tax                             " [EBI] Prokaryota; Gram-positive anaerobic thermophilic bacteria. [DEW] Bacteria|Gram Positives and relatives, Low G+C"
99                seqcheck                        "ARB_4D8A3140"
100                %) /*species*/
101
102        species                 :5000   %% (%
103                name                    :7600   "ThnCellu"
104                acc                             "L09183"
105                full_name               :4400   "\"Thermoanaerobacter cellulolyticus\""
106                title                           " [RDP,EBI,DEW] Phylogenetic analysis of anaerobic thermophilic bacteria: Aid for their classification"
107                journal                         " [RDP] J. Bacteriol. 175, 4772-4779 (1993) [EBI] J. Bacteriol. 175:4772-4779(1993). [DEW] J. Bacteriol. date 1993 vol 175 pgs 4772-4779"
108                author                          " [RDP,DEW] Rainey,F.A., Ward,N.L., Morgan,H.W. and Stackebrandt,E. [EBI] Rainey F.A., Ward N.L., Morgan H.W., Stackebrandt E.;"
109                file                            " [EBI] tcrg16sj.em_ba [DEW] Thecel.BGL"
110                date                            " [RDP] 11-AUG-1993 [EBI] 07-JAN-1994 (Rel. 38, Created)|07-FEB-1994 (Rel. 38, Last updated, Version 6)"
111                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA. [DEW] SSU [EBI_DE] Thermoanaerobacter cellulolyticus (IFO 14436) 16S ribosomal RNA|(16S rRNA) gene."
112                db_name                         " [EBI,DEW] Thermoanaerobacter cellulolyticus [RDP] \"Thermoanaerobacter cellulolyticus\""
113                id                              " [EBI] TCRG16SJ [RDP] Tab.cellu2"
114                tax                             " [EBI] Prokaryota; Bacteria; Firmicutes;|Irregular, nonsporing, gram-positive rods. [DEW] Bacteria|Gram Positives and relatives, Low G+C"
115                seqcheck                        "ARB_DAAEB14"
116                remark2                         " acc"
117                %) /*species*/
118
119        species                 :5000   %% (%
120                name                    :7600   "LacPonti"
121                acc                             "X76329"
122                full_name               :4400   "Lactobacillus pontis"
123                title                           " [DEW] Identification of lactobacilli from sourdough and description of  Lactibacillus pontis sp. nov. [EBI] Identification of lactobacilli from sourdough and description of Lactibacillus pontis sp. nov."
124                journal                         " [EBI] Int. J. Syst. Bacteriol. 44:223-229(1994). Submitted (23-NOV-1993) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. W. Ludwig, Lehrst. f. Mikrobiologie TU Muenchen, 80290 Muenchen, FRG [DEW] Int. J. Syst. Bacteriol. date 1994 vol 44 pgs 223-229"
125                author                          " [EBI] Vogel R.F., Boecker G., Stolz P., Ehrmann M., Fanta D., Ludwig W., Pot B., Kersters K., Schleifer K.; Ludwig W.; [DEW] Vogel R.F., Boecker G., Stolz P., Ehrmann M., Fanta D., Ludwig W.,  Pot B., Kersters K. and Schleifer K."
126                file                            " [EBI] lp16srr.em_ba [DEW] Lacpon.BGL"
127                date                            " [EBI] 02-SEP-1994 (Rel. 40, Created)|02-SEP-1994 (Rel. 40, Last updated, Version 2)"
128                gene                            " [EBI_DE] L.pontis (LTH 2587) 16S rRNA gene. [EBI_KW] 16S ribosomal RNA. [DEW] SSU"
129                db_name                         " [EBI,DEW] Lactobacillus pontis"
130                id                              " [EBI] LP16SRR"
131                tax                             " [DEW] Bacteria|Gram Positives and relatives, Low G+C [EBI] Prokaryota; Bacteria; Firmicutes; Regular asporogenous rods;|Lactobacillaceae; Lactobacillus."
132                seqcheck                        "ARB_C4D8A14A"
133                remark2                         "seqcheck acc"
134                %) /*species*/
135
136        species                 :5000   %% (%
137                name                    :7600   "LacReute"
138                acc                             "X76328"
139                full_name               :4400   "Lactobacillus reuteri"
140                title                           " [DEW] Identification of lactobacilli from sourdough and description of  Lactibacillus pontis sp. nov. [EBI] Identification of lactobacilli from sourdough and description of Lactibacillus pontis sp. nov."
141                journal                         " [EBI] Int. J. Syst. Bacteriol. 44:223-229(1994). Submitted (23-NOV-1993) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. W. Ludwig, Lehrst. f. Mikrobiologie TU Muenchen, 80290 Muenchen, FRG [DEW] Int. J. Syst. Bacteriol. date 1994 vol 44 pgs 223-229"
142                author                          " [EBI] Vogel R.F., Boecker G., Stolz P., Ehrmann M., Fanta D., Ludwig W., Pot B., Kersters K., Schleifer K.; Ludwig W.; [DEW] Vogel R.F., Boecker G., Stolz P., Ehrmann M., Fanta D., Ludwig W.,  Pot B., Kersters K. and Schleifer K."
143                file                            " [DEW] Lacreu2.BGL [EBI] lr16srri.em_ba"
144                date                            " [EBI] 02-SEP-1994 (Rel. 40, Created)|02-SEP-1994 (Rel. 40, Last updated, Version 2)"
145                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA. [DEW] SSU [EBI_DE] L.reuteri (DSM 20016 T) 16S rRNA gene. (i)"
146                db_name                         " [DEW] Lactobacillus reuteri 2 [EBI] Lactobacillus reuteri"
147                id                              " [EBI] LR16SRRI"
148                tax                             " [DEW] Bacteria|Gram Positives and relatives, Low G+C [EBI] Prokaryota; Bacteria; Firmicutes; Regular asporogenous rods;|Lactobacillaceae; Lactobacillus."
149                seqcheck                        "ARB_6A4EF5D"
150                remark2                         "seqcheck acc"
151                %) /*species*/
152
153        species                 :5000   %% (%
154                name                    :7600   "LacSanfr"
155                acc                             "X76327"
156                full_name               :4400   "Lactobacillus sanfranciscensis"
157                title                           " [DEW] Identification of lactobacilli from sourdough and description of  Lactibacillus pontis sp. nov. [EBI] Identification of lactobacilli from sourdough and description of Lactibacillus pontis sp. nov."
158                journal                         " [EBI] Int. J. Syst. Bacteriol. 44:223-229(1994). Submitted (23-NOV-1993) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. W. Ludwig, Lehrst. f. Mikrobiologie TU Muenchen, 80290 Muenchen, FRG [DEW] Int. J. Syst. Bacteriol. date 1994 vol 44 pgs 223-229"
159                author                          " [EBI] Vogel R.F., Boecker G., Stolz P., Ehrmann M., Fanta D., Ludwig W., Pot B., Kersters K., Schleifer K.; Ludwig W.; [DEW] Vogel R.F., Boecker G., Stolz P., Ehrmann M., Fanta D., Ludwig W.,  Pot B., Kersters K. and Schleifer K."
160                file                            " [DEW] Lacsan3.BGL [EBI] ls16srr.em_ba"
161                date                            " [EBI] 02-SEP-1994 (Rel. 40, Created)|02-SEP-1994 (Rel. 40, Last updated, Version 2)"
162                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA. [DEW] SSU [EBI_DE] L.sanfrancisco (ATCC 27651 T) 16S rRNA gene."
163                db_name                         " [DEW] Lactobacillus sanfrancisco 3 [EBI] Lactobacillus sanfrancisco"
164                id                              " [EBI] LS16SRR"
165                tax                             " [DEW] Bacteria|Gram Positives and relatives, Low G+C [EBI] Prokaryota; Bacteria; Firmicutes; Regular asporogenous rods;|Lactobacillaceae; Lactobacillus."
166                seqcheck                        "ARB_E4B9E60D"
167                remark2                         "seqcheck acc"
168                %) /*species*/
169
170        species                 :5000   %% (%
171                name                    :7600   "LacFruct"
172                acc                             "X76330"
173                full_name               :4400   "Lactobacillus fructivorans"
174                title                           " [DEW] Identification of lactobacilli from sourdough and description of  Lactibacillus pontis sp. nov. [EBI] Identification of lactobacilli from sourdough and description of Lactibacillus pontis sp. nov."
175                journal                         " [EBI] Int. J. Syst. Bacteriol. 44:223-229(1994). Submitted (23-NOV-1993) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. W. Ludwig, Lehrst. f. Mikrobiologie TU Muenchen, 80290 Muenchen, FRG [DEW] Int. J. Syst. Bacteriol. date 1994 vol 44 pgs 223-229"
176                author                          " [EBI] Vogel R.F., Boecker G., Stolz P., Ehrmann M., Fanta D., Ludwig W., Pot B., Kersters K., Schleifer K.; Ludwig W.; [DEW] Vogel R.F., Boecker G., Stolz P., Ehrmann M., Fanta D., Ludwig W.,  Pot B., Kersters K. and Schleifer K."
177                file                            " [DEW] Lacfru2.BGL [EBI] lf16srr.em_ba"
178                date                            " [EBI] 02-SEP-1994 (Rel. 40, Created)|02-SEP-1994 (Rel. 40, Last updated, Version 2)"
179                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA. [EBI_DE] L.fructivorans (DSM 20203 T) 16S rRNA gene. [DEW] SSU"
180                db_name                         " [DEW] Lactobacillus fructivorans 2 [EBI] Lactobacillus fructivorans"
181                id                              " [EBI] LF16SRR"
182                tax                             " [DEW] Bacteria|Gram Positives and relatives, Low G+C [EBI] Prokaryota; Bacteria; Firmicutes; Regular asporogenous rods;|Lactobacillaceae; Lactobacillus."
183                seqcheck                        "ARB_9F4C1FF1"
184                remark2                         "seqcheck acc"
185                %) /*species*/
186
187        species                 :5000   %% (%
188                name                    :7600   "LacAcido"
189                acc                             "M99704"
190                full_name               :4400   "Lactobacillus acidophilus "
191                title                           " [RDP] Identification and classification of Lactobacillus oligonucleotide probe hybridization by SDS-PAGE and rRNA-targeted acidophilus, L. johnsonii and L.gasseri strains [EBI,DEW] Identification and classification of Lactobacillus acidophilus, L. johnsonii and L.gasseri strains by SDS-PAGE and rRNA-targeted oligonucleotide probe hybridization"
192                journal                         ""
193                author                          " [EBI] Pot B., Hertel C., Ludwig W., Descheemaeker P., Kersters K., Scleifer K.H.; [RDP,DEW] Pot,B., Hertel,C., Ludwig,W., Descheemaeker,P., Kersters,K. and Scleifer,K.H."
194                file                            " [EBI] larr16saz.em_ba [DEW] Lacaci3.BGL"
195                date                            " [RDP] 07-SEP-1993 [EBI] 08-SEP-1993 (Rel. 36, Created)|08-SEP-1993 (Rel. 36, Last updated, Version 1)"
196                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA. [EBI_DE] Lactobacillus acidophilus johnsonii 16S ribosomal RNA (16S rRNA). [DEW] SSU"
197                db_name                         " [EBI] Lactobacillus acidophilus [DEW] Lactobacillus acidophilus 3 [RDP] Lactobacillus acidophilus subsp johnsonii"
198                id                              " [RDP] L.acidoph2 [EBI] LARR16SAZ"
199                tax                             " [DEW] Bacteria|Gram Positives and relatives, Low G+C [EBI] Prokaryota; Bacteria; Firmicutes; Regular asporogenous rods;|Lactobacillaceae; Lactobacillus."
200                seqcheck                        "ARB_F810780"
201                remark2                         "seqcheck"
202                %) /*species*/
203
204        species                 :5000   %% (%
205                name                    :7600   "CarAlter"
206                full_name               :4400   "Carnobacterium alterfunditum"
207                acc                             "L08623"
208                warning                         "rdp sequence, differs in dew and ebi"
209                title                           " [RDP] Phylogeny of the Antarctic bacterium, Carnobacterium alterfunditum [EBI,DEW] Phylogeny of the Antarctic bacterium Carnobacterium alterfunditum"
210                journal                         " [RDP] Polar Biol. 13, 501-503 (1993)"
211                author                          " [DEW] Spielmeyer,W.K., McMeekin,T.A., Miller,J.M. and Franzmann,P.D. [EBI] Spielmeyer W.K., McMeekin T.A., Miller J.M., Franzmann P.D.; [RDP] Spielmeyer,W.K., McMeekin,T.A., Miller,J.M. and Franzmann,P .D."
212                file                            " [DEW] Caralt.BGL [EBI] cabrr16s.em_ba"
213                date                            " [RDP] 06-JUL-1993 [EBI] 04-JAN-1994 (Rel. 38, Created)|04-JAN-1994 (Rel. 38, Last updated, Version 1)"
214                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA. [DEW] SSU [EBI_DE] Carnobacterium alterfunditum 16S ribosomal RNA (16S rRNA)."
215                db_name                         " [RDP,EBI,DEW] Carnobacterium alterfunditum"
216                id                              " [RDP] Crn.altfun [EBI] CABRR16S"
217                tax                             " [EBI] Prokaryota; Bacteria. [DEW] Bacteria|Gram Positives and relatives, Low G+C"
218                seqcheck                        "ARB_422EAE25"
219                %) /*species*/
220
221        species                 :5000   %% (%
222                name                    :7600   "StrSaliv"
223                acc                             "X68418"
224                full_name               :4400   "Streptococcus salivarius "
225                title                           " [RDP,EBI,DEW] Complete 23S ribosomal RNA sequences of Gram-positive Bacteria with a low DNA G+C content"
226                journal                         " [RDP] Syst. Appl. Microbiol. 15, 487-501 (1992) [EBI] Submitted (08-SEP-1992) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. W. Ludwig, Lehrst. fuer Mikrobiologie TU Muenchen, Arcisstr. 21, 8000 Muenchen 2, FRG Syst. Appl. Microbiol. 15:487-501(1992). [DEW] Syst. Appl. Microbiol. date 1992 vol 15 pgs 487-501"
227                author                          " [EBI] Ludwig W.; Ludwig W., Kirchof G., Klugbauer N., Weizenegger M., Betzl D., Ehrmann M., Hertel C., Jilg S., Tatzel R., Zitzelsberger H., Liebl S., Hochberger M., Shah J., Lane D., Wallnoef P.R.; [RDP] Ludwig,W., Kirchof,G., Klugbauer,N., Weizenegger,M., D. and Wallnoef,P.R. Zitzelsberger,H., Liebl,S., Hochberger,M., Shah,J., Betzl,D., Ehrmann,M., Hertel,C., Jilg,S., Tatzel,R., [DEW] Ludwig,W., Kirchof,G., Klugbauer,N., Weizenegger,M., Betzl,D., Ehrmann,M., Hertel,C., Jilg,S., Tatzel,R., Zitzelsberger,H., Liebl,S., Hochberger,M., Shah,J., Lane,D. and Wallnoef,P.R."
228                file                            " [DEW] Strthe2.BGL [EBI] st16srrn.em_ba"
229                date                            " [EBI] 15-JUN-1993 (Rel. 36, Created)|15-JUN-1993 (Rel. 36, Last updated, Version 2) [RDP] 15-JUN-1993"
230                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA. [EBI_DE] S.thermophilus gene for 16S rRNA [DEW] SSU"
231                db_name                         " [DEW] Streptococcus thermophilus 2 [EBI,RDP] Streptococcus thermophilus [RDP] Streptococcus salivarius subsp thermophilus"
232                id                              " [RDP] Stc.saliv3 [EBI] ST16SRRN"
233                tax                             " [DEW] Bacteria|Gram Positives and relatives, Low G+C [EBI] Prokaryota; Bacteria; Firmicutes; Gram-positive cocci;|Streptococcaceae."
234                seqcheck                        "ARB_22BD8250"
235                %) /*species*/
236
237        species                 :5000   %% (%
238                name                    :7600   "StaAureu"
239                acc                             "X68417"
240                full_name               :4400   "Staphylococcus aureus"
241                title                           " [RDP,EBI,DEW] Complete 23S ribosomal RNA sequences of Gram-positive Bacteria with a low DNA G+C content"
242                journal                         " [RDP] Syst. Appl. Microbiol. 15, 487-501 (1992) [EBI] Submitted (08-SEP-1992) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. W. Ludwig, Lehrst. fuer Mikrobiologie TU Muenchen, Arcisstr. 21, 8000 Muenchen 2, FRG Syst. Appl. Microbiol. 15:487-501(1992). [DEW] Syst. Appl. Microbiol. date 1992 vol 15 pgs 487-501"
243                author                          " [EBI] Ludwig W.; Ludwig W., Kirchof G., Klugbauer N., Weizenegger M., Betzl D., Ehrmann M., Hertel C., Jilg S., Tatzel R., Zitzelsberger H., Liebl S., Hochberger M., Shah J., Lane D., Wallnoef P.R.; [RDP] Ludwig,W., Kirchof,G., Klugbauer,N., Weizenegger,M., D. and Wallnoef,P.R. Zitzelsberger,H., Liebl,S., Hochberger,M., Shah,J., Betzl,D., Ehrmann,M., Hertel,C., Jilg,S., Tatzel,R., [DEW] Ludwig,W., Kirchof,G., Klugbauer,N., Weizenegger,M., Betzl,D., Ehrmann,M., Hertel,C., Jilg,S., Tatzel,R., Zitzelsberger,H., Liebl,S., Hochberger,M., Shah,J., Lane,D. and Wallnoef,P.R."
244                file                            " [EBI] sa16srrn.em_ba [DEW] Staaur.BGL"
245                date                            " [EBI] 15-JUN-1993 (Rel. 36, Created)|15-JUN-1993 (Rel. 36, Last updated, Version 2) [RDP] 15-JUN-1993"
246                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA. [DEW] SSU [EBI_DE] S.aureus gene for 16S rRNA"
247                db_name                         " [RDP,EBI,DEW] Staphylococcus aureus"
248                id                              " [RDP] Stp.aureus [EBI] SA16SRRN"
249                tax                             " [DEW] Bacteria|Gram Positives and relatives, Low G+C [EBI] Prokaryota; Bacteria; Firmicutes; Gram-positive cocci;|Micrococcaceae; Staphylococcus."
250                seqcheck                        "ARB_76F7D642"
251                %) /*species*/
252
253        species                 :5000   %% (%
254                name                    :7600   "StaHaemo"
255                acc                             "X66100"
256                full_name               :4400   "Staphylococcus haemolyticus"
257                title                           " [RDP] Construction of an oligonucleotide probe to differentiate warneri and Staphylococcus hominis Staphylococcus haemolyticus from Staphylococcus [EBI,DEW] Construction of an oligonucleotide probe to differentiate Staphylococcus haemolyticus from Staphylococcus warneri and Staphylococcus hominis"
258                journal                         " [RDP] Syst. Appl. Microbiol. In press [EBI] Submitted (20-MAY-1992) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. W. Ludwig, Lehrst f Mikrobiology TU Muenchen, Arcisstr 21, 8000 Muenchen 2, FRG Syst. Appl. Microbiol. 0:0-0(0). [DEW] Syst. Appl. Microbiol. date 0 pgs 0-0"
259                author                          " [EBI] Ludwig W.; Druel B., Ludwig W., Wiezenegger M., Scleifer K.H., Freney J., Fleurette N.; [RDP,DEW] Druel,B., Ludwig,W., Wiezenegger,M., Scleifer,K.H., Freney,J. and Fleurette,N."
260                file                            " [DEW] Stahae.BGL [EBI] sh16srrnb.em_ba"
261                date                            " [RDP] 09-DEC-1993 [EBI] 09-DEC-1993 (Rel. 38, Created)|09-DEC-1993 (Rel. 38, Last updated, Version 2)"
262                gene                            " [DEW] SSU [EBI_DE] S.haemolyticus gene for 16S ribosomal RNA [EBI_KW] 16S ribosomal RNA ribosomal RNA."
263                db_name                         " [RDP,EBI,DEW] Staphylococcus haemolyticus"
264                id                              " [EBI] SH16SRRNB [RDP] Stp.haemo2"
265                tax                             " [DEW] Bacteria|Gram Positives and relatives, Low G+C [EBI] Prokaryota; Bacteria; Firmicutes; Gram-positive cocci;|Micrococcaceae; Staphylococcus."
266                seqcheck                        "ARB_63D03890"
267                remark2                         "seqcheck acc"
268                %) /*species*/
269
270        species                 :5000   %% (%
271                name                    :7600   "StaHomin"
272                acc                             "X66101"
273                full_name               :4400   "Staphylococcus hominis"
274                title                           " [RDP] Construction of an oligonucleotide probe to differentiate warneri and Staphylococcus hominis Staphylococcus haemolyticus from Staphylococcus [EBI,DEW] Construction of an oligonucleotide probe to differentiate Staphylococcus haemolyticus from Staphylococcus warneri and Staphylococcus hominis"
275                journal                         " [RDP] Syst. Appl. Microbiol. In press [EBI] Submitted (20-MAY-1992) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. W. Ludwig, Lehrst f Mikrobiology TU Muenchen, Arcisstr 21, 8000 Muenchen 2, FRG Syst. Appl. Microbiol. 0:0-0(0). [DEW] Syst. Appl. Microbiol. date 0 pgs 0-0"
276                author                          " [EBI] Ludwig W.; Druel B., Ludwig W., Wiezenegger M., Scleifer K.H., Freney J., Fleurette N.; [RDP,DEW] Druel,B., Ludwig,W., Wiezenegger,M., Scleifer,K.H., Freney,J. and Fleurette,N."
277                file                            " [DEW] Stahom.BGL [EBI] sh16srrnc.em_ba"
278                date                            " [RDP] 09-DEC-1993 [EBI] 09-DEC-1993 (Rel. 38, Created)|09-DEC-1993 (Rel. 38, Last updated, Version 2)"
279                gene                            " [DEW] SSU [EBI_KW] 16S ribosomal RNA ribosomal RNA. [EBI_DE] S.hominis gene for 16S ribosomal RNA"
280                db_name                         " [RDP,EBI,DEW] Staphylococcus hominis"
281                id                              " [EBI] SH16SRRNC [RDP] Stp.homin2"
282                tax                             " [DEW] Bacteria|Gram Positives and relatives, Low G+C [EBI] Prokaryota; Bacteria; Firmicutes; Gram-positive cocci;|Micrococcaceae; Staphylococcus."
283                seqcheck                        "ARB_BE1296B"
284                remark2                         "seqcheck acc"
285                %) /*species*/
286
287        species                 :5000   %% (%
288                name                    :7600   "BacLiche"
289                acc                             "X68416"
290                full_name               :4400   "Bacillus licheniformis "
291                warning                         "rdp sequence, differences in ebi"
292                title                           " [RDP,EBI,DEW] Complete 23S ribosomal RNA sequences of Gram-positive Bacteria with a low DNA G+C content"
293                journal                         " [RDP] Syst. Appl. Microbiol. 15, 487-501 (1992) [EBI] Submitted (08-SEP-1992) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. W. Ludwig, Lehrst. fuer Mikrobiologie TU Muenchen, Arcisstr. 21, 8000 Muenchen 2, FRG Syst. Appl. Microbiol. 15:487-501(1992). [DEW] Syst. Appl. Microbiol. date 1992 vol 15 pgs 487-501"
294                author                          " [EBI] Ludwig W.; Ludwig W., Kirchof G., Klugbauer N., Weizenegger M., Betzl D., Ehrmann M., Hertel C., Jilg S., Tatzel R., Zitzelsberger H., Liebl S., Hochberger M., Shah J., Lane D., Wallnoef P.R.; [RDP] Ludwig,W., Kirchof,G., Klugbauer,N., Weizenegger,M., D. and Wallnoef,P.R. Zitzelsberger,H., Liebl,S., Hochberger,M., Shah,J., Betzl,D., Ehrmann,M., Hertel,C., Jilg,S., Tatzel,R., [DEW] Ludwig,W., Kirchof,G., Klugbauer,N., Weizenegger,M., Betzl,D., Ehrmann,M., Hertel,C., Jilg,S., Tatzel,R., Zitzelsberger,H., Liebl,S., Hochberger,M., Shah,J., Lane,D. and Wallnoef,P.R."
295                file                            " [EBI] bl16srrn.em_ba [DEW] Baclic2.BGL"
296                date                            " [EBI] 15-JUN-1993 (Rel. 36, Created)|15-JUN-1993 (Rel. 36, Last updated, Version 2) [RDP] 15-JUN-1993"
297                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA. [DEW] SSU [EBI_DE] B.licheniformis gene for 16S rRNA"
298                db_name                         " [RDP,EBI] Bacillus licheniformis [DEW] Bacillus licheniformis 2"
299                id                              " [EBI] BL16SRRN [RDP] B.licheni2"
300                tax                             " [DEW] Bacteria|Gram Positives and relatives, Low G+C [EBI] Prokaryota; Bacteria; Firmicutes; Endospore-forming rods and cocci;|Bacillaceae; Bacillus."
301                seqcheck                        "ARB_E9B88356"
302                %) /*species*/
303
304        species                 :5000   %% (%
305                name                    :7600   "BacStear"
306                full_name               :4400   "Bacillus stearothermophilus"
307                acc                             "X57309"
308                warning                         "rdp sequence, differences in ebi"
309                title                           " [RDP,EBI,DEW] Phylogenetic Diversity in the genus Bacillus as seen by 16SRNA sequencing studies"
310                journal                         " [RDP] Syst. Appl. Microbiol. 14, 266-269 (1991) [EBI] Submitted (14-JAN-1991) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. G.E. Fox, UNIVRSITY OF HOUSTON, DEPT OF BIOCHEM. & BIOPHYS. SCIENCES, HOUSTON, TEXAS 77204-5500, USA Syst. Appl. Microbiol. 14:266-269(1991). [DEW] Syst. Appl. Microbiol. date 1991 vol 14 pgs 266-269"
311                author                          " [EBI] Fox G.E.; Fox G.E., Rossler D.; [DEW] Roessler,D., Ludwig,W., Schleifer,K.H., Lin,C., McGill,T.J., Wisotzkey,J.D., Jurtshuk Jr.,P. and Fox,G.E. [RDP] Fox,G.E. and Rossler,D."
312                file                            " [EBI] bs16srna.em_ba [DEW] Bacste.BGL"
313                date                            " [RDP] 03-DEC-1991 [EBI] 29-OCT-1991 (Rel. 30, Created)|29-OCT-1991 (Rel. 30, Last updated, Version 2)"
314                gene                            " [EBI_DE] B.stearothermophilus 16S rRNA [DEW] SSU [EBI_KW] 16S ribosomal RNA ribosomal RNA."
315                db_name                         " [RDP,EBI,DEW] Bacillus stearothermophilus"
316                id                              " [EBI] BS16SRNA [RDP] B.stearT10"
317                tax                             " [DEW] Bacteria|Gram Positives and relatives, Low G+C [EBI] Prokaryota; Bacteria; Firmicutes; Endospore-forming rods and cocci;|Bacillaceae; Bacillus."
318                seqcheck                        "ARB_6D892279"
319                %) /*species*/
320
321        species                 :5000   %% (%
322                name                    :7600   "BacMetha"
323                acc                             "S42879 X64465"
324                full_name               :4400   "Bacillus methanolicus"
325                title                           " [DEW] Bacillus methanolicus sp. nov., a new species of thermotolerant,  methanol-utilizing, endospore-forming bacteria. [EBI] Bacillus methanolicus sp. nov., a new species of thermotolerant, methanol-utilizing, endospore-forming bacteria."
326                journal                         " [EBI] Submitted (18-FEB-1992) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. W. Ludwig, Lehrst f Mikrobiologie TU Muenchen, Arcisstr 21, 8000 Muenchen 2, FRG Int. J. Syst. Bacteriol. 42:439-445(1992)."
327                author                          " [DEW] Arfman N., Dijkhuizen L., Kirchhof G., Ludwig W., Schleifer K.H.,  Bulygina E.S., Chumakov K.M., Govorukhina N.I., Trotsenko Y.A.,  White D. and Sharp R.J. [EBI] Ludwig W.; Arfman N., Dijkhuizen L., Kirchhof G., Ludwig W., Schleifer K.H., Bulygina E.S., Chumakov K.M., Govorukhina N.I., Trotsenko Y.A., White D., Sharp R.J.;"
328                file                            " [DEW] Bacmet.BGL [EBI] bm16srrn.em_ba"
329                date                            " [EBI] 03-MAY-1993 (Rel. 35, Created)|29-JUN-1995 (Rel. 44, Last updated, Version 5) [RDP] 26-OCT-1992"
330                gene                            " [DEW] SSU [EBI_DE] B.methanolicus 16S ribosomal RNA [EBI_KW] 16S ribosomal RNA."
331                db_name                         " [DEW,EBI,RDP] Bacillus methanolicus"
332                id                              " [EBI] BM16SRRN"
333                tax                             " [DEW] Bacteria Gram Positives and relatives, Low G+C [EBI] Prokaryota; Bacteria; Firmicutes; Endospore-forming rods and cocci;|Bacillaceae; Bacillus."
334                seqcheck                        "ARB_328C74A5"
335                remark2                         " acc"
336                %) /*species*/
337
338        species                 :5000   %% (%
339                name                    :7600   "BacGlobi"
340                acc                             "X68415"
341                full_name               :4400   "Bacillus globisporus"
342                warning                         "rdp sequence, differences in ebi"
343                title                           " [RDP,EBI,DEW] Complete 23S ribosomal RNA sequences of Gram-positive Bacteria with a low DNA G+C content"
344                journal                         " [RDP] Syst. Appl. Microbiol. 15, 487-501 (1992) [EBI] Submitted (08-SEP-1992) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. W. Ludwig, Lehrst. fuer Mikrobiologie TU Muenchen, Arcisstr. 21, 8000 Muenchen 2, FRG Syst. Appl. Microbiol. 15:487-501(1992). [DEW] Syst. Appl. Microbiol. date 1992 vol 15 pgs 487-501"
345                author                          " [EBI] Ludwig W.; Ludwig W., Kirchof G., Klugbauer N., Weizenegger M., Betzl D., Ehrmann M., Hertel C., Jilg S., Tatzel R., Zitzelsberger H., Liebl S., Hochberger M., Shah J., Lane D., Wallnoef P.R.; [RDP] Ludwig,W., Kirchof,G., Klugbauer,N., Weizenegger,M., D. and Wallnoef,P.R. Zitzelsberger,H., Liebl,S., Hochberger,M., Shah,J., Betzl,D., Ehrmann,M., Hertel,C., Jilg,S., Tatzel,R., [DEW] Ludwig,W., Kirchof,G., Klugbauer,N., Weizenegger,M., Betzl,D., Ehrmann,M., Hertel,C., Jilg,S., Tatzel,R., Zitzelsberger,H., Liebl,S., Hochberger,M., Shah,J., Lane,D. and Wallnoef,P.R."
346                file                            " [EBI] bg16srrn.em_ba [DEW] Bacglo3.BGL"
347                date                            " [EBI] 15-JUN-1993 (Rel. 36, Created)|15-JUN-1993 (Rel. 36, Last updated, Version 2) [RDP] 15-JUN-1993"
348                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA. [DEW] SSU [EBI_DE] B.globisporus gene for 16S rRNA"
349                db_name                         " [RDP,EBI] Bacillus globisporus [DEW] Bacillus globisporus 3"
350                id                              " [RDP] B.globisp3 [EBI] BG16SRRN"
351                tax                             " [DEW] Bacteria|Gram Positives and relatives, Low G+C [EBI] Prokaryota; Bacteria; Firmicutes; Endospore-forming rods and cocci;|Bacillaceae; Bacillus."
352                seqcheck                        "ARB_E54C774F"
353                %) /*species*/
354
355        species                 :5000   %% (%
356                name                    :7600   "MooTherm"
357                acc                             "L09168"
358                full_name               :4400   "Moorella thermoautotrophica"
359                title                           " [RDP,EBI,DEW] Phylogenetic analysis of anaerobic thermophilic bacteria: Aid for their classification"
360                journal                         " [RDP] J. Bacteriol. 175, 4772-4779 (1993) [EBI] J. Bacteriol. 175:4772-4779(1993). [DEW] J. Bacteriol. date 1993 vol 175 pgs 4772-4779"
361                author                          " [RDP,DEW] Rainey,F.A., Ward,N.L., Morgan,H.W. and Stackebrandt,E. [EBI] Rainey F.A., Ward N.L., Morgan H.W., Stackebrandt E.;"
362                file                            " [DEW] Clothe2.BGL [DEW] Clothe3.BGL [EBI] ctrg16sab.em_ba"
363                date                            " [EBI] 07-FEB-1994 (Rel. 38, Created)|07-FEB-1994 (Rel. 38, Last updated, Version 1) [RDP] 10-AUG-1993 [RDP] 15-JAN-1992"
364                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA. [DEW] SSU [EBI_DE] Clostridium thermoautotrophicum (DSM 1974) 16S ribosomal RNA (16S|rRNA) gene."
365                db_name                         " [DEW] Clostridium thermoautotrophicum 3 [EBI,RDP] Clostridium thermoautotrophicum [RDP] Moorella thermoautotrophica"
366                id                              " [RDP] C.tauto3_3 [EBI] CTRG16SAB"
367                tax                             " [DEW] Bacteria Gram Positives and relatives, Low G+C [DEW] Bacteria|Gram Positives and relatives, Low G+C [EBI] Prokaryota; Bacteria; Firmicutes; Endospore-forming rods and cocci;|Bacillaceae; Clostridium."
368                seqcheck                        "ARB_479CB83C"
369                remark2                         "seqcheck acc"
370                %) /*species*/
371
372        species                 :5000   %% (%
373                name                    :7600   "FusNecro"
374                acc                             "X74408"
375                full_name               :4400   "Fusobacterium necrophorum"
376                warning                         "rdp sequence, differs in dew"
377                title                           " [DEW] Phylogenetic relationship of Fusobacterium necrophorum A, AB, and  B biotypes based upon 16S rRNA gene sequence analysis. [EBI] Phylogenetic relationship of Fusobacterium necrophorum A, AB, and B biotypes based upon 16S rRNA gene sequence analysis. [RDP] Phylogenetic relationship of Fusobacterium necrophorum A, sequence analysis AB and B biotypes based upon 16S ribosomal RNA gene"
378                journal                         " [DEW] Int. J. Syst. Bacteriol. date 1994 vol 44 pgs 315-319 [EBI] Int. J. Syst. Bacteriol. 44:315-319(1994). Submitted (02-AUG-1993) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. L.A. Nicholson, CSIRO Division of Animal Health, Private Mail Bag No. 1, Cnr. Park Drive and Flemmington Rd., Parkville, 3052, AUSTRALIA"
379                author                          " [EBI] Nicholson L.A., Morrow C.J., Corner L.A., Hodgson A.L.M.; Nicholson L.A.; [RDP] Nicholson,L.A., Morrow,C.J., Corner,L.A. and Hodgson,A.L.M. [DEW] Nicholson L.A., Morrow C.J., Corner L.A. and Hodgson A.L.M."
380                file                            " [DEW] Fusnec3.BFU [EBI] fn16srnab.em_ba"
381                date                            " [EBI] 04-AUG-1993 (Rel. 36, Created)|14-SEP-1995 (Rel. 45, Last updated, Version 5) [RDP] 04-AUG-1993"
382                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA 16S rRNA gene protein synthesis. [EBI_DE] F.necrophorum (FnS-40) gene for 16S rRNA [DEW] SSU"
383                db_name                         " [RDP,EBI] Fusobacterium necrophorum [DEW] Fusobacterium necrophorum 3"
384                id                              " [RDP] Fus.necph3 [EBI] FN16SRNAB"
385                tax                             " [DEW] Bacteria|Fusobacterium and relatives [EBI] Prokaryota; Bacteria; Gracilicutes; Scotobacteria;|Anaerobic gram-negative straight, curved and helical rods;|Bacteroidaceae."
386                seqcheck                        "ARB_CB007EF5"
387                %) /*species*/
388
389        species                 :5000   %% (%
390                name                    :7600   "ProModes"
391                full_name               :4400   "Propionigenium modestum"
392                acc                             "X54275"
393                warning                         "rdp sequence, differs in dew and ebi"
394                title                           " [RDP] Propiogenium modestum: a separate line of descent within the eubacteria [EBI,DEW] Propionigenium modestum: a separate line of descent within the eubacteria"
395                journal                         " [DEW] FEMS Microbiol. Lett. date 1991 vol 78 pgs 53-58 [RDP] FEMS Microbiol. Lett. 78, 53-58 (1991) [EBI] Submitted (17-JUL-1990) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. Wolters J.; Institut fuer Allgemeine Mikrobiologie der Universitaet, Biologiezentrum, Am Botanischen Garten 1-9, 2800 Kiel 1. FEMS Microbiol. Lett. 78:53-58(1991). Submitted (05-DEC-1990) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases."
396                author                          " [EBI] Wolters J.; Both B., Kaim G., Wolters J., Schleifer K.H., Stackebrandt E., Ludwig W.; Wolters J.; [DEW] Both,B., Kaim,G., Wolters,J., Schleifer,K.H., Stackebrandt,E. and Ludwig,W. [RDP] Both,B., Kaim,G., Wolters,J., Schleifer,K.H.,. Stackebrandt,E. and Ludwig,W."
397                file                            " [EBI] pmo16s.em_ba [DEW] Promod.BFU"
398                date                            " [RDP] 06-AUG-1992 [EBI] 18-APR-1991 (Rel. 28, Created)|06-AUG-1992 (Rel. 33, Last updated, Version 12)"
399                gene                            " [EBI_DE] Propionigenium modestum 16S rRNA [EBI_KW] 16S ribosomal RNA homologue ribosomal RNA. [DEW] SSU"
400                db_name                         " [RDP,EBI,DEW] Propionigenium modestum"
401                id                              " [EBI] PMO16S [RDP] Prg.modest"
402                tax                             " [DEW] Bacteria|Fusobacterium and relatives [EBI] Prokaryota; Bacteria; Gracilicutes; Scotobacteria;|Anaerobic gram-negative straight, curved and helical rods;|Bacteroidaceae."
403                seqcheck                        "ARB_9E2FA324"
404                %) /*species*/
405
406        species                 :5000   %% (%
407                name                    :7600   "CloGhoni"
408                acc                             "X73451"
409                full_name               :4400   "Clostridium ghoni"
410                warning                         "rdp sequence, differs in dew"
411                title                           " [RDP,EBI,DEW] Towards a Phylogeny of the Clostridia"
412                journal                         " [EBI] Submitted (18-JUN-1993) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. P.A. Lawson, AFRC Institute of Food Research, Reading Laboratory, Microbiology Dept., Earley Gate, Whiteknights Road, Reading, RG6 2EF, UK Submitted (26-NOV-1993) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. P.A. Lawson, AFRC Institute of Food Research, Reading Laboratory, Microbiology Dept., Earley Gate, Whiteknights Road, Reading, RG6 2EF, UK"
413                author                          " [RDP,DEW] Lawson,P.A., Llop,P., Hutson,R.A., Hippe,H. and Collins,M.D. [EBI] Lawson P.A., Llop P., Hutson R.A., Hippe H., Collins M.D.; Lawson P.A.; Lawson P.A.;"
414                file                            " [DEW] Clogho.BGL [EBI] cg16srna.em_ba"
415                date                            " [RDP] 31-DEC-1993 [EBI] 31-DEC-1993 (Rel. 38, Created)|31-DEC-1993 (Rel. 38, Last updated, Version 2)"
416                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA. [DEW] SSU [EBI_DE] C.ghoni 16S rRNA"
417                db_name                         " [RDP,EBI,DEW] Clostridium ghoni"
418                id                              " [RDP] C.ghoni [EBI] CG16SRNA"
419                tax                             " [DEW] Bacteria|Gram Positives and relatives, Low G+C [EBI] Prokaryota; Bacteria; Firmicutes; Endospore-forming rods and cocci;|Bacillaceae; Clostridium."
420                seqcheck                        "ARB_8072879B"
421                %) /*species*/
422
423        species                 :5000   %% (%
424                name                    :7600   "CloBifer"
425                acc                             "X73437"
426                full_name               :4400   "Clostridium bifermentans"
427                warning                         "rdp sequence, differs in dew"
428                title                           " [RDP,EBI,DEW] Towards a Phylogeny of the Clostridia"
429                journal                         " [EBI] Submitted (18-JUN-1993) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. P.A. Lawson, AFRC Institute of Food Research, Reading Laboratory, Microbiology Dept., Earley Gate, Whiteknights Road, Reading, RG6 2EF, UK"
430                author                          " [EBI] Lawson P.A., Llop P., Hutson R.A., Hippe H., Collins M.D.; Lawson P.A.; [RDP,DEW] Lawson,P.A., Llop,P., Hutson,R.A., Hippe,H. and Collins,M.D."
431                file                            " [DEW] Clobif.BGL [EBI] cb16srna.em_ba"
432                date                            " [RDP] 31-DEC-1993 [EBI] 31-DEC-1993 (Rel. 38, Created)|31-DEC-1993 (Rel. 38, Last updated, Version 2)"
433                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA. [DEW] SSU [EBI_DE] C.bifermentans 16S rRNA"
434                db_name                         " [RDP,EBI,DEW] Clostridium bifermentans"
435                id                              " [RDP] C.bifermen [EBI] CB16SRNA"
436                tax                             " [DEW] Bacteria|Gram Positives and relatives, Low G+C [EBI] Prokaryota; Bacteria; Firmicutes; Endospore-forming rods and cocci;|Bacillaceae; Clostridium."
437                seqcheck                        "ARB_6E3AD370"
438                %) /*species*/
439
440        species                 :5000   %% (%
441                name                    :7600   "CloCorin"
442                acc                             "X76742"
443                full_name               :4400   "\"Clostridium corinoforum\""
444                title                           " [DEW] The Phylogeny of the genus Clostridium: Proposal of five new  genera and eleven new species combinations [EBI] The Phylogeny of the genus Clostridium: Proposal of five new genera and eleven new species combinations"
445                journal                         " [EBI] Submitted (15-DEC-1993) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. J.A.E. Farrow, AFRC Inst. of Food Research, Reading Laboratory, Microbiology Dept., Earley Gate, Whiteknights Road, Reading RG6 2EF, UK Int. J. Syst. Bacteriol. 44:812-826(1994). [DEW] Int. J. Syst. Bacteriol. date 1994 vol 44 pgs 812-826"
446                author                          " [DEW] Collins M.D., Lawson P.A., Willems A., Cordoba J.J.,  Fernandez-Garayzabal J., Garcia P., Cai J., Kippe H. and  Farrow J.A.E. [EBI] Farrow J.A.E.; Collins M.D., Lawson P.A., Willems A., Cordoba J.J., Fernandez-Garayzabal J., Garcia P., Cai J., Kippe H., Farrow J.A.E.;"
447                file                            " [EBI] csdsm16sr.em_ba [DEW] Clocor.BGL"
448                date                            " [EBI] 10-NOV-1994 (Rel. 41, Created)|22-NOV-1994 (Rel. 41, Last updated, Version 4)"
449                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA 16S rRNA gene. [DEW] SSU [EBI_DE] Clostridium sp. (C.corinoforum) DSM 5906 16S rRNA gene."
450                db_name                         " [EBI,DEW] Clostridium corinoforum"
451                id                              " [EBI] CSDSM16SR"
452                tax                             " [DEW] Bacteria|Gram Positives and relatives, Low G+C [EBI] Prokaryota; Bacteria; Firmicutes; Endospore-forming rods and cocci;|Bacillaceae; Clostridium."
453                seqcheck                        "ARB_99CFE4B5"
454                remark2                         "seqcheck acc"
455                %) /*species*/
456
457        species                 :5000   %% (%
458                name                    :7600   "CloParap"
459                acc                             "X73445"
460                full_name               :4400   "Clostridium paraputrificum"
461                warning                         "rdp sequence, differs in dew"
462                title                           " [RDP] Towards a phylogeny of the clostridia based on 16S rRNA sequences [EBI,DEW] Towards a Phylogeny of the Clostridia"
463                journal                         " [EBI] Submitted (18-JUN-1993) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. P.A. Lawson, AFRC Institute of Food Research, Reading Laboratory, Microbiology Dept., Earley Gate, Whiteknights Road, Reading, RG6 2EF, UK [RDP] FEMS Microbiol. Lett. 113, 87-92 (1993)"
464                author                          " [DEW] Lawson,P.A., Llop,P., Hutson,R.A., Hippe,H. and Collins,M.D. [EBI] Lawson P.A., Llop P., Hutson R.A., Hippe H., Collins M.D.; Lawson P.A.; [RDP] Lawson,P.A., Llop-Perez,P., Hutson,R.A., Hippe,H. and Collins,M.D."
465                file                            " [EBI] cp16srnc.em_ba [DEW] Clopa1.BGL"
466                date                            " [RDP] 31-DEC-1993 [EBI] 31-DEC-1993 (Rel. 38, Created)|31-DEC-1993 (Rel. 38, Last updated, Version 2)"
467                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA. [DEW] SSU [EBI_DE] C.paraputrificum 16S rRNA"
468                db_name                         " [RDP,EBI,DEW] Clostridium paraputrificum"
469                id                              " [EBI] CP16SRNC [RDP] C.pputrifi"
470                tax                             " [DEW] Bacteria|Gram Positives and relatives, Low G+C [EBI] Prokaryota; Bacteria; Firmicutes; Endospore-forming rods and cocci;|Bacillaceae; Clostridium."
471                seqcheck                        "ARB_FDC0E598"
472                remark2                         "seqcheck acc"
473                %) /*species*/
474
475        species                 :5000   %% (%
476                name                    :7600   "CloPerfr"
477                full_name               :4400   "Clostridium perfringens"
478                acc                             "M69264"
479                warning                         "rdp sequence, differs in dew"
480                title                           " [RDP] Cloning, mapping, and molecular characterization of the rRNA operons of Clostridium perfringens [DEW] Cloning, mapping and molecular characterization of the ribosomal RNA operons of Clostridium perfringens"
481                journal                         " [DEW] J. Bacteriol. date 1991 vol 173 pgs 5431-5438 [RDP] J. Bacteriol. 173, 5431-5438 (1991)"
482                author                          " [RDP,DEW] Garnier,T., Canard,B. and Cole,S.T."
483                file                            " [DEW] Cloper.BGL"
484                date                            " [RDP] 25-AUG-1992"
485                gene                            " [DEW] SSU"
486                db_name                         " [RDP,DEW] Clostridium perfringens"
487                id                              " [RDP] C.perfri50"
488                tax                             " [DEW] Bacteria|Gram Positives and relatives, Low G+C"
489                seqcheck                        "ARB_2BCEC337"
490                remark2                         "seqcheck acc"
491                %) /*species*/
492
493        species                 :5000   %% (%
494                name                    :7600   "CloProte"
495                acc                             "X73448"
496                full_name               :4400   "Clostridium proteolyticum"
497                warning                         "rdp sequence, differs in dew"
498                title                           " [RDP] Towards a phylogeny of the clostridia based on 16S rRNA sequences [EBI,DEW] Towards a Phylogeny of the Clostridia"
499                journal                         " [EBI] Submitted (18-JUN-1993) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. P.A. Lawson, AFRC Institute of Food Research, Reading Laboratory, Microbiology Dept., Earley Gate, Whiteknights Road, Reading, RG6 2EF, UK [RDP] FEMS Microbiol. Lett. 113, 87-92 (1993)"
500                author                          " [DEW] Lawson,P.A., Llop,P., Hutson,R.A., Hippe,H. and Collins,M.D. [EBI] Lawson P.A., Llop P., Hutson R.A., Hippe H., Collins M.D.; Lawson P.A.; [RDP] Lawson,P.A., Llop-Perez,P., Hutson,R.A., Hippe,H. and Collins,M.D."
501                file                            " [DEW] Clopr0.BGL [DEW] Clopr1.BGL [EBI] cp16srnd.em_ba"
502                date                            " [RDP] 31-DEC-1993 [EBI] 31-DEC-1993 (Rel. 38, Created)|31-DEC-1993 (Rel. 38, Last updated, Version 2)"
503                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA. [EBI_DE] C.proteolyticum 16S rRNA [DEW] SSU"
504                db_name                         " [RDP,EBI,DEW] Clostridium proteolyticum"
505                id                              " [EBI] CP16SRND [RDP] C.proteoly"
506                tax                             " [DEW] Bacteria Gram Positives and relatives, Low G+C [DEW] Bacteria|Gram Positives and relatives, Low G+C [EBI] Prokaryota; Bacteria; Firmicutes; Endospore-forming rods and cocci;|Bacillaceae; Clostridium."
507                seqcheck                        "ARB_430654A"
508                remark2                         "seqcheck acc"
509                %) /*species*/
510
511        species                 :5000   %% (%
512                name                    :7600   "CloSardi"
513                acc                             "X73446"
514                full_name               :4400   "Clostridium sardiniensis"
515                warning                         "rdp sequence, differences in ebi"
516                title                           " [RDP] Towards a phylogeny of the clostridia based on 16S rRNA sequences [EBI,DEW] Towards a Phylogeny of the Clostridia"
517                journal                         " [EBI] Submitted (18-JUN-1993) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. P.A. Lawson, AFRC Institute of Food Research, Reading Laboratory, Microbiology Dept., Earley Gate, Whiteknights Road, Reading, RG6 2EF, UK [RDP] FEMS Microbiol. Lett. 113, 87-92 (1993)"
518                author                          " [DEW] Lawson,P.A., Llop,P., Hutson,R.A., Hippe,H. and Collins,M.D. [EBI] Lawson P.A., Llop P., Hutson R.A., Hippe H., Collins M.D.; Lawson P.A.; [RDP] Lawson,P.A., Llop-Perez,P., Hutson,R.A., Hippe,H. and Collins,M.D."
519                file                            " [DEW] Closar.BGL [EBI] cs16srnc.em_ba"
520                date                            " [RDP] 31-DEC-1993 [EBI] 31-DEC-1993 (Rel. 38, Created)|31-DEC-1993 (Rel. 38, Last updated, Version 2)"
521                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA. [EBI_DE] C.sardiniensis 16S rRNA [DEW] SSU"
522                db_name                         " [RDP,EBI,DEW] Clostridium sardiniensis"
523                id                              " [RDP] C.sardinie [EBI] CS16SRNC"
524                tax                             " [DEW] Bacteria|Gram Positives and relatives, Low G+C [EBI] Prokaryota; Bacteria; Firmicutes; Endospore-forming rods and cocci;|Bacillaceae; Clostridium."
525                seqcheck                        "ARB_FAEBAF85"
526                remark2                         "seqcheck acc"
527                %) /*species*/
528
529        species                 :5000   %% (%
530                name                    :7600   "CloColla"
531                acc                             "X73439"
532                full_name               :4400   "Clostridium collagenovorans"
533                warning                         "rdp sequence, differs in dew"
534                title                           " [RDP,EBI,DEW] Towards a Phylogeny of the Clostridia"
535                journal                         " [EBI] Submitted (18-JUN-1993) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. P.A. Lawson, AFRC Institute of Food Research, Reading Laboratory, Microbiology Dept., Earley Gate, Whiteknights Road, Reading, RG6 2EF, UK"
536                author                          " [EBI] Lawson P.A., Llop P., Hutson R.A., Hippe H., Collins M.D.; Lawson P.A.; [RDP,DEW] Lawson,P.A., Llop,P., Hutson,R.A., Hippe,H. and Collins,M.D."
537                file                            " [EBI] cc16srnc.em_ba [DEW] Cloco1.BGL"
538                date                            " [RDP] 31-DEC-1993 [EBI] 31-DEC-1993 (Rel. 38, Created)|31-DEC-1993 (Rel. 38, Last updated, Version 2)"
539                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA. [DEW] SSU [EBI_DE] C.collagenovorans 16S rRNA"
540                db_name                         " [RDP,EBI,DEW] Clostridium collagenovorans"
541                id                              " [RDP] C.colgenvo [EBI] CC16SRNC"
542                tax                             " [DEW] Bacteria|Gram Positives and relatives, Low G+C [EBI] Prokaryota; Bacteria; Firmicutes; Endospore-forming rods and cocci;|Bacillaceae; Clostridium."
543                seqcheck                        "ARB_95F308E8"
544                %) /*species*/
545
546        species                 :5000   %% (%
547                name                    :7600   "CloTyrob"
548                acc                             "L08062"
549                full_name               :4400   "Clostridium tyrobutyricum"
550                warning                         " ebi_seq_truncated"
551                title                           " [EBI,DEW] Characterization of a ribosomal RNA gene cluster from Clostridium tyrobutyricum: phylogenetic positioning based on the 16S and 23S nucleotide sequences [RDP] Characterization of a ribosomal RNA gene cluster from based on the 16S and 23S nucleotide sequences Clostridium tyrobutyricum: phylogenetic positioning"
552                journal                         " [RDP] Syst Appl. Microbiol. 16, 201-207 (1993)"
553                author                          " [RDP] van der Meer,J.R., Ludwig,W. and de Vos,W.M. [DEW] der Meer,J.R., Ludwig,W. and de Vos,W.M. [EBI] der Meer J.R., Ludwig W., De Vos W.M.;"
554                file                            " [EBI] ctrgadg.em_ba [DEW] Clotyr.BGL"
555                date                            " [EBI] 24-DEC-1992 (Rel. 34, Created)|24-DEC-1992 (Rel. 34, Last updated, Version 1) [RDP] 18-DEC-1992"
556                gene                            " [DEW] SSU [EBI_KW] 16S ribosomal RNA 23S ribosomal RNA 5S ribosomal RNA. [EBI_DE] Clostridium tyrobutyricum 5S, 16S and 23S ribosomal RNA (rRNA)|complete genes."
557                db_name                         " [RDP,EBI,DEW] Clostridium tyrobutyricum"
558                id                              " [RDP] C.tyrobu51 [EBI] CTRGADG"
559                tax                             " [DEW] Bacteria|Gram Positives and relatives, Low G+C [EBI] Prokaryota; Bacteria; Firmicutes; Endospore-forming rods and cocci;|Bacillaceae; Clostridium."
560                seqcheck                        "ARB_E1DC5772"
561                %) /*species*/
562
563        species                 :5000   %% (%
564                name                    :7600   "ClrFervi"
565                full_name               :4400   "Caloramator fervidus"
566                acc                             "L09187"
567                title                           " [RDP,EBI,DEW] Phylogenetic analysis of anaerobic thermophilic bacteria: Aid for their classification"
568                journal                         " [RDP] J. Bacteriol. 175, 4772-4779 (1993) [EBI] J. Bacteriol. 175:4772-4779(1993). [DEW] J. Bacteriol. date 1993 vol 175 pgs 4772-4779"
569                author                          " [RDP,DEW] Rainey,F.A., Ward,N.L., Morgan,H.W. and Stackebrandt,E. [EBI] Rainey F.A., Ward N.L., Morgan H.W., Stackebrandt E.;"
570                file                            " [EBI] clorg16sa.em_ba [DEW] Clofer.BGL"
571                date                            " [RDP] 06-MAR-1992 [EBI] 04-JAN-1994 (Rel. 38, Created)|07-FEB-1994 (Rel. 38, Last updated, Version 5)"
572                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA. [EBI_DE] Clostridium fervidus (ATCC 43204) 16S ribosomal RNA (16S rRNA)|gene. [DEW] SSU"
573                db_name                         " [DEW,EBI,RDP] Clostridium fervidus [RDP] Caloramator fervidus"
574                id                              " [RDP] C.fervidus [EBI] CLORG16SA"
575                tax                             " [DEW] Bacteria|Gram Positives and relatives, Low G+C [EBI] Prokaryota; Bacteria; Firmicutes; Endospore-forming rods and cocci;|Bacillaceae; Clostridium."
576                seqcheck                        "ARB_44DC804A"
577                %) /*species*/
578
579        species                 :5000   %% (%
580                name                    :7600   "CloTherm"
581                acc                             "X72870"
582                full_name               :4400   "Clostridium thermolacticum"
583                title                           " [EBI] Phylogenetic analysis of anaerobic thermophilic bacteria: Aid for their classification [DEW] Phylogenetic analysis of anaerobic thermophilic bacteria: Aid for  their classification"
584                journal                         " [EBI] Submitted (24-MAR-1993) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. E. Stackebrandt, University of Queensland, Dept of Microbiology, St. Lucia, 4072, AUSTRALIA J. Bacteriol. 175:4772-4779(1993). [DEW] J. Bacteriol. date 1993 vol 175 pgs 4772-4779"
585                author                          " [EBI] Stackebrandt E.; Rainey F.A., Ward N.L., Morgan H.W., Stackebrandt E.; [DEW] Rainey F.A., Ward N.L., Morgan H.W. and Stackebrandt E."
586                file                            " [DEW] Cloth02.BGL [DEW] Clothe2.BGL [EBI] ct16srrna.em_ba"
587                date                            " [EBI] 23-AUG-1994 (Rel. 40, Created)|23-AUG-1994 (Rel. 40, Last updated, Version 4)"
588                gene                            " [DEW] SSU [EBI_KW] 16S ribosomal RNA ribosomal RNA. [EBI_DE] C.thermolacticum gene for 16S rRNA"
589                db_name                         " [EBI] Clostridium thermolacticum [DEW] Clostridium thermolacticum 2"
590                id                              " [EBI] CT16SRRNA"
591                tax                             " [DEW] Bacteria Gram Positives and relatives, Low G+C [DEW] Bacteria|Gram Positives and relatives, Low G+C [EBI] Prokaryota; Bacteria; Firmicutes; Endospore-forming rods and cocci;|Bacillaceae; Clostridium."
592                seqcheck                        "ARB_505317B8"
593                remark2                         "seqcheck acc"
594                %) /*species*/
595
596        species                 :5000   %% (%
597                name                    :7600   "MycChlor"
598                acc                             "X79094"
599                full_name               :4400   "Mycobacterium chlorophenolicus"
600                title                           " [RDP] Phylogenetic evidence for transfer of chlorophenolicus PCP-1 to the genus Mycobacterium pentachlorophenol-mineralizing Rhodococcus [EBI] Phylogenetic evidence for transfer of pentachlorophenol-mineralizing Rhodococcus chlorophenolicus PCP-I(T) to the genus Mycobacterium. [DEW] Phylogenetic evidence for transfer of  pentachlorophenol-mineralizing Rhodococcus chlorophenolicus  PCP-I(T) to the genus Mycobacterium."
601                journal                         " [EBI] Int. J. Syst. Bacteriol. 44:494-498(1994). Submitted (06-MAY-1994) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. M. Briglia, Wageningen Agricutural University, Dept of Microbiology, Hesselink van Suchtelenweg 4, 6703 CT Wageningen, NETHERLANDS [RDP] Int. J. Syst. Bacteriol. 44, 494-498 (1994) [DEW] Int. J. Syst. Bacteriol. date 1994 vol 44 pgs 494-498"
602                author                          " [DEW] Briglia M., Eggen R.I., Van Elsas D.J. and de Vos W.M. [EBI] Briglia M., Eggen R.I., Van Elsas D.J., De Vos W.M.; Briglia M.; [RDP] Briglia,M., Eggen,R.I., Van Elsas,D.J. and De Vos,W.M."
603                file                            " [DEW] Mycch1.BGH [EBI] mcpcp116.em_ba"
604                date                            " [RDP] 25-MAY-1994 [EBI] 10-MAY-1994 (Rel. 39, Created)|10-OCT-1994 (Rel. 41, Last updated, Version 6)"
605                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA. [DEW] SSU [EBI_DE] M.chlorophenolicus (PCP-1) 16S rRNA gene."
606                db_name                         " [DEW,EBI,RDP] Mycobacterium chlorophenolicus [RDP] Mycobacterium chlorophenolicum"
607                id                              " [RDP] Myb.chlphe [EBI] MCPCP116"
608                tax                             " [DEW] Bacteria|Gram Positives and relatives, High G+C [EBI] Prokaryota; Bacteria; Firmicutes; Irregular asporogenous rods;|Actinomycetes and related organisms; Mycobacteriaceae;|Mycobacterium."
609                seqcheck                        "ARB_EC439D7A"
610                %) /*species*/
611
612        species                 :5000   %% (%
613                name                    :7600   "BifBifid"
614                acc                             "S83624"
615                full_name               :4400   "Bifidobacterium bifidum "
616                warning                         "dew sequence, differs in ebi"
617                title                           " [EBI,DEW] Phylogenetic evidence for the transfer of Eubacterium suis to the genus Actinomyces as Actinomyces suis comb. nov"
618                journal                         " [EBI] Int. J. Syst. Bacteriol. 42:161-165(1992). [DEW] Int. J. Syst. Bacteriol. date 1992 vol 42 pgs 161-165"
619                author                          " [DEW] Ludwig,W., Kirchhof,G., Weizenegger,M. and Weiss,N. [EBI] Ludwig W., Kirchhof G., Weizenegger M., Weiss N.;"
620                file                            " [DEW] Bifbif2.BGH [EBI] s83624.em_ba"
621                date                            " [EBI] 16-FEB-1993 (Rel. 34, Created)|28-DEC-1993 (Rel. 38, Last updated, Version 3) [RDP] 11-MAY-1992"
622                gene                            " [DEW] SSU [EBI_KW] ."
623                db_name                         " [DEW] Bifidobacterium bifidum 2 [EBI,RDP] Bifidobacterium bifidum"
624                id                              " [EBI] S83624"
625                tax                             " [DEW] Bacteria|Gram Positives and relatives, High G+C [EBI] Prokaryota; Bacteria; Firmicutes; Irregular asporogenous rods;|Actinomycetes and related organisms."
626                seqcheck                        "ARB_C4E4AD3B"
627                %) /*species*/
628
629        species                 :5000   %% (%
630                name                    :7600   "BctFragi"
631                acc                             "M61006"
632                full_name               :4400   "Bacteroides fragilis"
633                title                           " [RDP] Natural relationship between Bacteroides and Flavobacteria"
634                journal                         " [RDP] J. Bacteriol. 164, 230-236 (1985)"
635                author                          " [EBI] Woese C.R.; [DEW] Woese,C.R. [RDP] Weisburg,W.G., Oyaizu,Y., Oyaizu,H. and Woese,C.R."
636                file                            " [EBI] bfrraa.em_ba [DEW] Bacfra2.BFL"
637                date                            " [RDP] 02-MAR-1993 [EBI] 24-MAR-1991 (Rel. 27, Created)|03-MAR-1993 (Rel. 35, Last updated, Version 2)"
638                gene                            " [EBI_KW] ribosomal RNA small subunit. [EBI_DE] B.fragilis ribosomal RNA small subunit. [DEW] SSU"
639                db_name                         " [DEW] Bacteroides fragilis 2 [RDP,EBI] Bacteroides fragilis"
640                id                              " [EBI] BFRRAA [RDP] Bac.fragil"
641                tax                             " [DEW] Bacteria|Flavobacteria and relatives [EBI] Prokaryota; Bacteria; Gracilicutes; Scotobacteria;|Anaerobic gram-negative straight, curved and helical rods;|Bacteroidaceae."
642                seqcheck                        "ARB_C27980AD"
643                %) /*species*/
644
645        species                 :5000   %% (%
646                name                    :7600   "RhoMarin"
647                full_name               :4400   "Rhodothermus marinus"
648                acc                             "X77140"
649                warning                         "rdp sequence, differences in ebi ebi_seq_truncated"
650                title                           " [DEW] The sequence of the single 16S rRNA gene of the thermophilic  Eubacterium rhodothermus marinus reveals a distant relationship to  the group containing Flexibacter, Bacteroides, and Cytophaga  species. [RDP] The thermophila Rhodothermus marinus is a member of the Proteobacteria and has a single rRNA operon [EBI] The sequence of the single 16S rRNA gene of the thermophilic Eubacterium rhodothermus marinus reveals a distant relationship to the group containing Flexibacter, Bacteroides, and Cytophaga species."
651                journal                         " [DEW] J. Bacteriol. date 1994 vol 176 pgs 6165-6169 [EBI] Submitted (14-JAN-1994) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. O.S. Andresson, Institute for Experimental Pathology, University of Iceland, Keldur, 112 Reykjavik, ICELAND J. Bacteriol. 176:6165-6169(1994)."
652                author                          " [RDP] Andersson,O.S. and Fridjonssen,O.H. [DEW] Andresson O.S. and Friojonsson O.H. [EBI] Andresson O.S.; Andresson O.S., Friojonsson O.H.;"
653                file                            " [EBI] rm16sile.em_ba [DEW] Rhomar.BFL"
654                date                            " [EBI] 24-JAN-1994 (Rel. 38, Created)|14-JUL-1995 (Rel. 44, Last updated, Version 4) [RDP] 24-JAN-1994"
655                gene                            " [DEW] SSU [EBI_DE] R.marinus 16S rRNA and Ile-tRNA genes. [EBI_KW] 16S ribosomal RNA 16S rRNA gene transfer RNA-Ile tRNA-Ile gene|trnI gene."
656                db_name                         " [RDP,EBI,DEW] Rhodothermus marinus"
657                id                              " [RDP] Rht.marinu [EBI] RM16SILE"
658                tax                             " [DEW] Bacteria|Flavobacteria and relatives [EBI] Prokaryota; Bacteria; Eubacteriomycetes; Eubacteriales."
659                seqcheck                        "ARB_B977C3D7"
660                remark2                         "seqcheck acc"
661                %) /*species*/
662
663        species                 :5000   %% (%
664                name                    :7600   "DslToluo"
665                acc                             "X70953"
666                full_name               :4400   "\"Desulfobacula toluolica\""
667                title                           " [EBI,DEW] Complete oxidation of toluene under strictly anoxic conditions by a new sulfate-reducing bacterium"
668                journal                         " [DEW] Appl. Environ. Microbiol. date 0 vol 59 pgs 1444-1451 [EBI] Appl. Environ. Microbiol. 59:1444-1451(0). Submitted (18-FEB-1993) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. W. Ludwig, Lehrst. f. Mikrobiologie TU Muenchen, Arcisstr.21, 8000 Muenchen 2, FRG"
669                author                          " [DEW] Rabus,R., Nordhaus,R., Ludwig,W. and Widdel,F. [RDP] Ludwig,W. [EBI] Rabus R., Nordhaus R., Ludwig W., Widdel F.; Ludwig W.;"
670                file                            " [EBI] dt16srrna.em_ba [DEW] Destol.BPD"
671                date                            " [RDP] 25-MAY-1993 [EBI] 25-MAY-1993 (Rel. 36, Created)|25-MAY-1993 (Rel. 36, Last updated, Version 2)"
672                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA. [EBI_DE] D.toluolica 16S rRNA [DEW] SSU"
673                db_name                         " [RDP,EBI,DEW] Desulfobacula toluolica"
674                id                              " [EBI] DT16SRRNA [RDP] Dbu.toluol"
675                tax                             " [DEW] Bacteria|Proteobacteria Delta [EBI] Prokaryota; Bacteria; Eubacteriomycetes; Eubacteriales;|Proteobacteria; delta subdivision;|Sulfate- or sulfur-reducing dissimilatory bacteria."
676                seqcheck                        "ARB_B7011E8F"
677                %) /*species*/
678
679        species                 :5000   %% (%
680                name                    :7600   "PelAcety"
681                acc                             "X70955"
682                full_name               :4400   "Pelobacter acetylenicus"
683                title                           " [DEW] The phylogenetic positions of Pelobacter acetylenicus and  Pelobacter propionicus [EBI] The phylogenetic positions of Pelobacter acetylenicus and Pelobacter propionicus Phylogenetic analysis of five strains of Gram-negative, obligately anaerobic, sulfur-reducing bacteria: Description of Desulfuromuea gen. nov., including the species D. kysingli sp. nov., D. bakii sp. nov. and D. succinoxidans sp. nov. [RDP] The phylogenetic positions of Pelobacter acetylenicus and Pelobacter propionicus"
684                journal                         " [DEW] Syst. Appl. Microbiol. date 1993 vol 16 pgs 216-218 [EBI] Syst. Appl. Microbiol. 16:216-218(1993). Submitted (18-FEB-1993) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. W. Ludwig, Lehrst. f. Mikrobiologie TU Muenchen, Arcisstr.21, 8000 Muenchen 2, FRG Int. J. Syst. Bacteriol. 44:753-758(1994). [RDP] Syst. Appl. Microbiol. 16, 216-218 (1993)"
685                author                          " [EBI] Evers S., Weizenegger M., Ludwig W., Schink B., Schleifer K.H.; Ludwig W.; Liesack W., Finster K.; [DEW] Evers S., Weizenegger M., Ludwig W., Schink B. and Schleifer K.H. [RDP] Evers,S., Weizenegger,M., Ludwig,W., Schink,B. and Schleifer ,K.H."
686                file                            " [DEW] Pelace.BPD [EBI] pac16srna.em_ba"
687                date                            " [RDP] 30-AUG-1993 [EBI] 30-AUG-1993 (Rel. 36, Created)|13-DEC-1994 (Rel. 42, Last updated, Version 4)"
688                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA. [DEW] SSU [EBI_DE] P.acetylenicus 16S rRNA"
689                db_name                         " [RDP,EBI,DEW] Pelobacter acetylenicus"
690                id                              " [EBI] PAC16SRNA [RDP] Peb.aceten"
691                tax                             " [DEW] Bacteria|Proteobacteria Delta [EBI] Prokaryota; Bacteria; Eubacteriomycetes; Eubacteriales;|Proteobacteria; delta subdivision."
692                seqcheck                        "ARB_BC13194C"
693                %) /*species*/
694
695        species                 :5000   %% (%
696                name                    :7600   "PelPropi"
697                acc                             "X70954"
698                full_name               :4400   "Pelobacter propionicus"
699                title                           " [RDP,EBI,DEW] The phylogenetic positions of Pelobacter acetylenicus and Pelobacter propionicus"
700                journal                         " [EBI] Syst. Appl. Microbiol. 16:216-218(1993). Submitted (18-FEB-1993) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. W. Ludwig, Lehrst. f. Mikrobiologie TU Muenchen, Arcisstr.21, 8000 Muenchen 2, FRG [DEW] Syst. Appl. Microbiol. date 1993 vol 16 pgs 216-218 [RDP] Syst. Appl. Microbiol. 16, 216-218 (1993)"
701                author                          " [DEW] Evers,S., Weizenegger,M., Ludwig,W., Schink,B. and Schleifer,K.H. [EBI] Evers S., Weizenegger M., Ludwig W., Schink B., Schleifer K.H.; Ludwig W.; [RDP] Evers,S., Weizenegger,M., Ludwig,W., Schink,B. and Schleifer ,K.H."
702                file                            " [DEW] Pelpro.BPD [EBI] pp16srna.em_ba"
703                date                            " [RDP] 30-AUG-1993 [EBI] 30-AUG-1993 (Rel. 36, Created)|30-AUG-1993 (Rel. 36, Last updated, Version 2)"
704                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA. [DEW] SSU [EBI_DE] P.propionicus 16S rRNA"
705                db_name                         " [RDP,EBI,DEW] Pelobacter propionicus"
706                id                              " [RDP] Peb.propio [EBI] PP16SRNA"
707                tax                             " [DEW] Bacteria|Proteobacteria Delta [EBI] Prokaryota; Bacteria; Eubacteriomycetes; Eubacteriales;|Proteobacteria; delta subdivision."
708                seqcheck                        "ARB_85C20BE4"
709                %) /*species*/
710
711        species                 :5000   %% (%
712                name                    :7600   "St0Isola"
713                acc                             "L15739"
714                full_name               :4400   "str isolate 1482/89"
715                rdp_biovar                      "symbiont of Sus scrofus (sp?)"
716                title                           " [RDP] Ileal symbiont, 'IS-intracellularis': An obligate showing a relationship to Desulfovibrio species intracellular bacterium of porcine intestines [EBI,DEW] Ileal symbiont, 'IS-intracellularis': An obligate intracellular bacterium of porcine intestines showing a relationship to Desulfovibrio species"
717                journal                         " [EBI] Int. J. Syst. Bacteriol. 43:533-538(1993). [RDP] Int. J. Syst. Bacteriol. 43, 533-538 (1993) [DEW] Int. J. Syst. Bacteriol. date 1993 vol 43 pgs 533-538"
718                author                          " [RDP] Gebhart,C.J., Barns,S.M., McOrist,S., Lin,G.-F. and Lawson,G .H. [EBI] Gebhart C.J., Barns S.M., McOrist S., Lin G.F., Lawson G.H.; [DEW] Gebhart,C.J., Barns,S.M., McOrist,S., Lin,G.F. and Lawson,G.H."
719                file                            " [DEW] Ilesymin.BPD [EBI] ispclo28a.em_ba"
720                date                            " [EBI] 04-JAN-1994 (Rel. 38, Created)|04-JAN-1994 (Rel. 38, Last updated, Version 1) [RDP] 27-AUG-1993"
721                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA. [EBI_DE] Ileal symbiont intracellularis (from Sus scrofa) 16S ribosomal RNA|gene. [DEW] SSU"
722                db_name                         " [RDP] str isolate 1482/89 [EBI,DEW] Ileal symbiont intracellularis"
723                id                              " [RDP] sym.Sus_sc [EBI] ISPCLO28A"
724                tax                             " [DEW] Bacteria|Proteobacteria Delta [EBI] Prokaryota; Bacteria; Eubacteriomycetes; Eubacteriales;|Proteobacteria; delta subdivision;|Sulfate- or sulfur-reducing dissimilatory bacteria."
725                seqcheck                        "ARB_D0E9BCA1"
726                %) /*species*/
727
728        species                 :5000   %% (%
729                name                    :7600   "DsfDesul"
730                full_name               :4400   "Desulfovibrio desulfuricans"
731                acc                             "M37312"
732                warning                         "rdp sequence, differs in dew and ebi"
733                title                           " [RDP,EBI,DEW] Diversity and origin of Desulfovibrio species: Phylogenetic definition of a family"
734                journal                         " [RDP] J. Bacteriol. 172, 3609-3619 (1990) [EBI] J. Bacteriol. 172:3609-3619(1990). [DEW] J. Bacteriol. date 1990 vol 172 pgs 3609-3619"
735                author                          " [RDP] Devereux,R., He,S.-H., Doyle,C.L., Orkland,S., Stahl,D.A., LeGall,J. and Whitman,W.B. [EBI] Devereux R., He S.H., Doyle C.L., Orkland S., Stahl D.A., LeGall J., Whitman W.B.; [DEW] Devereux,R., He,S.H., Doyle,C.L., Orkland,S., Stahl,D.A., LeGall,J. and Whitman,W.B."
736                file                            " [EBI] dddaaa.em_ba [DEW] Desdes3.BPD"
737                date                            " [EBI] 07-NOV-1990 (Rel. 25, Created)|06-JUN-1996 (Rel. 47, Last updated, Version 7) [RDP] 10-OCT-1991"
738                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA. [DEW] SSU [EBI_DE] D.desulfuricans 16S ribosomal rRNA."
739                db_name                         " [RDP,EBI] Desulfovibrio desulfuricans [DEW] Desulfovibrio desulfuricans 3"
740                id                              " [EBI] DDDAAA [RDP] Dsv.desuN4"
741                tax                             " [DEW] Bacteria|Proteobacteria Delta [EBI] Prokaryota; Bacteria; Eubacteriomycetes; Eubacteriales;|Proteobacteria; delta subdivision;|Sulfate- or sulfur-reducing dissimilatory bacteria; Desulfovibrio."
742                seqcheck                        "ARB_FD4A8AE"
743                %) /*species*/
744
745        species                 :5000   %% (%
746                name                    :7600   "ChlTrach"
747                acc                             "M59178"
748                full_name               :4400   "Chlamydia trachomatis"
749                title                           " [RDP] Eubacterial Origin of Chlamydiae"
750                journal                         " [RDP] J. Bacteriol. 167, 570-574 (1986)"
751                author                          " [DEW] Weisburg,W., Hatch,T. and Woese,C.R. [RDP] Weisburg,W.G., Hatch,T. and Woese,C.R. [EBI] Weisburg W., Hatch T., Woese C.R.;"
752                file                            " [EBI] ctdaa.em_ba [DEW] Chltra.BCH"
753                date                            " [EBI] 28-FEB-1991 (Rel. 27, Created)|04-SEP-1991 (Rel. 29, Last updated, Version 2) [RDP] 27-FEB-1991"
754                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA small subunit ribosomal RNA. [DEW] SSU [EBI_DE] C.trachomatis 16S ribosomal RNA gene."
755                db_name                         " [RDP,EBI,DEW] Chlamydia trachomatis"
756                id                              " [RDP] Clm.tracho [EBI] CTDAA"
757                tax                             " [EBI] Prokaryota; Bacteria; Gracilicutes; Scotobacteria;|Rickettsias and Chlamydias; Chlamydiales; Chlamydiaceae. [DEW] Bacteria|Chlamydiae"
758                seqcheck                        "ARB_A0813AEB"
759                %) /*species*/
760
761        species                 :5000   %% (%
762                name                    :7600   "ChlPneum"
763                acc                             "L06108"
764                full_name               :4400   "Chlamydia pneumoniae"
765                title                           " [EBI,DEW] Phylogenetic relationship of Chlamydia pneumoniae to Chlamydia psittaci and Chlamydia trachomatis as determined by analysis of 16S ribosomal DNA sequences [RDP] C. pneumoniae 16S rRNA sequence"
766                journal                         " [RDP] Int. J. Syst. Bacteriol. 43, 610-612 (1993) [DEW] Int. J. Syst. Bacteriol. date 1993 vol 43 pgs 610-612 [EBI] Int. J. Syst. Bacteriol. 43:610-612(1993)."
767                author                          " [RDP,DEW] Gaydos,C.A., Palmer,L., Quinn,T.C., Falkow,S., Brooks,G.F. and Eiden,J.J. [EBI] Gaydos C.A., Palmer L., Quinn T.C., Falkow S., Brooks G.F., Eiden J.J.;"
768                file                            " [EBI] cp16sr.em_ba [DEW] Chlpne.BCH"
769                date                            " [RDP] 13-NOV-1992 [EBI] 15-NOV-1992 (Rel. 34, Created)|22-SEP-1993 (Rel. 37, Last updated, Version 2)"
770                gene                            " [EBI_DE] Chlamydia pneumoniae 16S ribosomal RNA sequence. [EBI_KW] 16S ribosomal RNA. [DEW] SSU"
771                db_name                         " [RDP,EBI,DEW] Chlamydia pneumoniae"
772                id                              " [RDP] Clm.pneumo [EBI] CP16SR"
773                tax                             " [EBI] Prokaryota; Bacteria; Gracilicutes; Scotobacteria;|Rickettsias and Chlamydias; Chlamydiales; Chlamydiaceae. [DEW] Bacteria|Chlamydiae"
774                seqcheck                        "ARB_C1576604"
775                %) /*species*/
776
777        species                 :5000   %% (%
778                name                    :7600   "PlaLimno"
779                acc                             "X62911"
780                full_name               :4400   "Planctomyces limnophilus"
781                title                           " [DEW] Occurrence of novel groups of the domain Bacteria as revealed by analysis of genetic material isolated from an Australian terrestrial environment."
782                journal                         " [DEW] J. Bacteriol. date 1992 vol 174 pgs 5072-5078"
783                author                          " [RDP] RDP: Liesack,W., Sller,R., Haas,H., Stewart,T. and Stackebrandt,E. [DEW] Liesack,W. and Stackebrandt,E."
784                file                            " [DEW] Plalim.BPL"
785                date                            " [RDP] deleted from rdp"
786                gene                            " [DEW] SSU"
787                db_name                         " [RDP,DEW] Planctomyces limnophilus"
788                id                              " [RDP] Pln.limnop"
789                tax                             " [DEW] Bacteria|Planctomyces and relatives"
790                seqcheck                        "ARB_A735D4DB"
791                remark2                         "seqcheck acc"
792                %) /*species*/
793
794        species                 :5000   %% (%
795                name                    :7600   "AnaMargi"
796                full_name                       "Anaplasma marginale"
797                acc                             "M60313"
798                warning                         "rdp sequence, differs in dew and ebi"
799                title                           " [RDP,EBI,DEW] 16S ribosomal DNA amplification for phylogenetic study"
800                journal                         " [DEW] J. Bacteriol. date 1991 vol 173 pgs 697-703 [RDP] J. Bacteriol. 173, 697-703 (1991) [EBI] J. Bacteriol. 173:697-703(1991)."
801                author                          " [EBI] Weisburg W.G., Barns S.M., Pelletier D.A., Lane D.J.; [RDP,DEW] Weisburg,W.G., Barns,S.M., Pelletier,D.A. and Lane,D.J."
802                file                            " [DEW] Anamar.BPA [EBI] amrr16sa.em_ba"
803                date                            " [EBI] 12-FEB-1991 (Rel. 27, Created)|04-SEP-1991 (Rel. 29, Last updated, Version 2) [RDP] 07-FEB-1991"
804                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA. [DEW] SSU [EBI_DE] Anaplasma marginale 16S ribosomal RNA."
805                db_name                         " [RDP,EBI,DEW] Anaplasma marginale"
806                id                              " [EBI] AMRR16SA [RDP] Ana.margin"
807                tax                             " [DEW] Bacteria|Proteobacteria Alpha [EBI] Prokaryota; Bacteria; Gracilicutes; Scotobacteria;|Rickettsias and Chlamydias; Anaplasmaceae."
808                seqcheck                        "ARB_574D1ABA"
809                %) /*species*/
810
811        species                 :5000   %% (%
812                name                    :7600   "CowRumin"
813                full_name               :4400   "Cowdria ruminantium"
814                acc                             "X61659"
815                warning                         "rdp sequence, differs in dew"
816                title                           " [RDP] Phylogenetic relationship of Cowdria ruminantium, rickettsiales determined from 16S rRNA sequence agent of heartwater to anaplasma marginale and other [EBI,DEW] Phylogenetic relationship of Cowdria ruminantium, agent of heartwater to anaplasma marginale and other rickettsiales determined from 16S rRNA sequence"
817                journal                         " [RDP] Int. J. Syst. Bacteriol. 42, 270-274 (1992) [EBI] Int. J. Syst. Bacteriol. 42:270-274(1992). Submitted (23-AUG-1991) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. J.B. Dame, University of Florida, Dept of Infectious Diseases, Bldg 471 Mowry Rd, Gainesville, Florida 32611-0633, USA [DEW] Int. J. Syst. Bacteriol. date 1992 vol 42 pgs 270-274"
818                author                          " [RDP,DEW] Dame,J.B., Mahan,S.M. and Yowell,C.A. [EBI] Dame J.B., Mahan S.M., Yowell C.A.; Dame J.B.;"
819                file                            " [DEW] Cowrum.BPA [EBI] crdna.em_ba"
820                date                            " [EBI] 16-MAR-1992 (Rel. 31, Created)|04-FEB-1993 (Rel. 34, Last updated, Version 4) [RDP] 25-MAR-1992"
821                gene                            " [EBI_DE] Cowdria ruminantium gene for 16S ribosomal RNA [DEW] SSU [EBI_KW] 16S ribosomal RNA ribosomal RNA."
822                db_name                         " [RDP,EBI,DEW] Cowdria ruminantium"
823                id                              " [EBI] CRDNA [RDP] Cow.rumina"
824                tax                             " [DEW] Bacteria|Proteobacteria Alpha [EBI] Prokaryota; Bacteria; Gracilicutes; Scotobacteria;|Rickettsias and Chlamydias; Rickettsiales; Rickettsiaceae;|Ehrlichieae."
825                seqcheck                        "ARB_51F705F0"
826                %) /*species*/
827
828        species                 :5000   %% (%
829                name                    :7600   "BraJapon"
830                acc                             "D11345"
831                full_name               :4400   "Bradyrhizobium japonicum "
832                title                           " [EBI] Proposal for rejection of Agrobacterium tumefaciens and revised descriptions for the genus Agrobacterium and for Agrobacterium radiobacter and Agrobacterium rhizogenes Distribution of Rhizobia in leguminous plants surveyed by phylogenetic identification [DEW] Proposal for rejection of Agrobacterium tumefaciens and revised  descriptions for the genus Agrobacterium and for Agrobacterium  radiobacter and Agrobacterium rhizogenes"
833                journal                         " [EBI] Int. J. Syst. Bacteriol. 43:694-702(1993). J. Gen. Appl. Microbiol. 39:339-354(1993). [DEW] Int. J. Syst. Bacteriol. date 1993 vol 43 pgs 694-702"
834                author                          " [DEW] Sawada H., Ieki H., Oyaizu H. and Matsumoto S. [EBI] Sawada H., Ieki H., Oyaizu H., Matsumoto S.; Oyaizu H., Matsumoto S., Minamisawa K., Gamou T.;"
835                file                            " [EBI] bj16srdn1.em_ba [DEW] Brajap5.BPA"
836                date                            " [EBI] 25-MAR-1994 (Rel. 39, Created)|11-MAR-1995 (Rel. 43, Last updated, Version 9)"
837                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA protein synthesis. [EBI_DE] Bradyrhizobium japonicum gene for 16S ribosomal RNA. [DEW] SSU"
838                db_name                         " [DEW] Bradyrhizobium japonicum 5 [EBI] Bradyrhizobium japonicum"
839                id                              " [EBI] BJ16SRDN1"
840                tax                             " [DEW] Bacteria|Proteobacteria Alpha [EBI] Prokaryota; Bacteria; Gracilicutes; Scotobacteria;|Aerobic rods and cocci; Rhizobiaceae."
841                seqcheck                        "ARB_B04415A"
842                remark2                         "seqcheck acc"
843                %) /*species*/
844
845        species                 :5000   %% (%
846                name                    :7600   "AzoCauli"
847                acc                             "D11342"
848                full_name                       "Azorhizobium caulinodans "
849                warning                         "rdp sequence, differs in dew"
850                title                           " [EBI] Proposal for rejection of Agrobacterium tumefaciens and revised descriptions for the genus Agrobacterium and for Agrobacterium radiobacter and Agrobacterium rhizogenes Distribution of Rhizobia in leguminous plants surveyed by phylogenetic identification [RDP] Proposal for rejection of Agrobacterium tumefaciens and Agrobacterium rhizogenes and for Agrobacterium rhizobacter and revised descriptions for the genus Agrobacterium [DEW] Proposal for rejection of Agrobacterium tumefaciens and revised  descriptions for the genus Agrobacterium and for Agrobacterium  radiobacter and Agrobacterium rhizogenes"
851                journal                         " [EBI] Int. J. Syst. Bacteriol. 43:694-702(1993). J. Gen. Appl. Microbiol. 39:339-354(1993). [DEW] Int. J. Syst. Bacteriol. date 1993 vol 43 pgs 694-702 [RDP] Int. J. Syst. Bacteriol. 43, 694-702 (1993)"
852                author                          " [DEW] Sawada H., Ieki H., Oyaizu H. and Matsumoto S. [RDP] Sawada,H., Ieki,H., Oyaizu,H. and Matsumoto,S. [EBI] Sawada H., Ieki H., Oyaizu H., Matsumoto S.; Oyaizu H., Matsumoto S., Minamisawa K., Gamou T.;"
853                file                            " [DEW] Azocau.BPA [EBI] ac16srdn1.em_ba"
854                date                            " [EBI] 25-MAR-1994 (Rel. 39, Created)|11-MAR-1995 (Rel. 43, Last updated, Version 9) [RDP] 25-MAR-1994"
855                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA protein synthesis. [DEW] SSU [EBI_DE] Azorhizobium caulinodans gene for 16S ribosomal RNA."
856                db_name                         " [RDP,EBI,DEW] Azorhizobium caulinodans"
857                id                              " [EBI] AC16SRDN1 [RDP] Azr.cauli3"
858                tax                             " [DEW] Bacteria|Proteobacteria Alpha [EBI] Prokaryota; Bacteria; Gracilicutes; Scotobacteria;|Aerobic rods and cocci; Rhizobiaceae; Azorhizobium."
859                seqcheck                        "ARB_CE27F3E9"
860                remark2                         "seqcheck acc"
861                %) /*species*/
862
863        species                 :5000   %% (%
864                name                    :7600   "LegLytic"
865                acc                             "X66835"
866                full_name               :4400   "Legionella lytica"
867                warning                         "rdp sequence, differs in dew and ebi"
868                title                           " [EBI,DEW] The phylogenetic status of sarcobium lyticum, an obligate intracellular bacterial parasite of small amoebae [RDP] The phylogenetic status of Sarcobium lyticum, an obligate intracellular bacterial parasite of small amoebae"
869                journal                         " [RDP] FEMS Microbiol. Lett. 96:199-202 (1992) [DEW] . [EBI] Submitted (12-JUN-1992) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. W. Ludwig, Lehrst f Mikrobiologie TU Muenchen, Arcistr 21, 8000 Muenchen 2, FRG"
870                author                          " [EBI] Ludwig W.; Springer N., Ludwig W., Drozanski W., Amann R., Schleifer K.H.; [DEW] Springer N., Ludwig W., Drozanski W., Amann R. and Schleifer K.H. [RDP] Springer,N., Ludwig,W., Drozanski,W., Amman,R., and Schleifer,K.-H."
871                file                            " [EBI] sl16rna.em_ba [DEW] Sarlyt.BPG"
872                date                            " [RDP] 14-JUN-1993 [EBI] 09-DEC-1993 (Rel. 38, Created)|09-DEC-1993 (Rel. 38, Last updated, Version 2)"
873                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA homologue rRNA. [DEW] NoData [EBI_DE] S.lyticum gene for 16S rRNA"
874                db_name                         " [DEW,EBI,RDP] Sarcobium lyticum [RDP] Legionella lytica"
875                id                              " [EBI] SL16RNA [RDP] Sar.lyticu"
876                tax                             " [EBI] Prokaryota; Bacteria; Eubacteriomycetes; Eubacteriales;|Proteobacteria. [DEW] Bacteria|Proteobacteria Gamma"
877                seqcheck                        "ARB_84F2CEB0"
878                %) /*species*/
879
880        species                 :5000   %% (%
881                name                    :7600   "DchNodos"
882                acc                             "M35016"
883                full_name               :4400   "Dichelobacter nodosus"
884                title                           " [EBI] Transfer of Kingella indologenes (Snell and Lapage 1976) to the genus Suttonella gen. nov. as Suttonella indologenes comb. nov. transfer of Bacteroides nodosus (Beveridge 1941) to the genus Dichelobacter gen. nov. as Dichelobacter nodosus comb. nov. and [RDP] Transfer of Kingella indologenes (Snell and Lapage 1976) to (Beveridge 1941) to the genus Dichelobacter gen. indologenes comb. nov.; transfer of Bacteroides the genus Suttonella gen. nov. as Suttonella [DEW] Transfer of Kingella indologenes (Snell and Lapage 1976) to the  genus Suttonella gen. nov. as Suttonella indologenes comb. nov.  transfer of Bacteroides nodosus (Beveridge 1941) to the genus  Dichelobacter gen. nov. as Dichelobacter nodosus comb. nov.; and"
885                journal                         " [DEW] Int. J. Syst. Bacteriol. date 1990 vol 4 pgs 426-433 [EBI] Int. J. Syst. Bacteriol. 40:426-433(1990). Submitted (05-JUN-1990) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. F.E. Dewhirst, Forsyth Dental Center, 140 Fenway, Boston, MA 02115, USA [RDP] Int. J. Syst. Bacteriol. 40, 426-443 (1990)"
886                author                          " [EBI] Dewhirst F.E., Paster B.J., La Fontaine S., Rood J.I.; Dewhirst F.E.; [RDP] Dewhirst,F.E., Paster,B.J., La Fontaine,S. and Rood,J.I. [DEW] Dewhirst F.E., Paster B.J., La Fontaine S. and Rood J.I."
887                file                            " [DEW] Dicnod.BPG [EBI] bnrrda.em_ba"
888                date                            " [RDP] 15-SEP-1990 [EBI] 08-MAY-1991 (Rel. 28, Created)|19-JUL-1995 (Rel. 44, Last updated, Version 4)"
889                gene                            " [DEW] SSU [EBI_KW] 16S ribosomal RNA ribosomal RNA. [EBI_DE] Dichelobacter nodosus 16S ribosomal RNA."
890                db_name                         " [RDP,EBI,DEW] Dichelobacter nodosus"
891                id                              " [EBI] BNRRDA [RDP] Dch.nodosu"
892                tax                             " [EBI] Prokaryota; Bacteria; Gracilicutes; Scotobacteria;|Anaerobic gram-negative straight, curved and helical rods;|Cardiobacteriaceae. [DEW] Bacteria|Proteobacteria Gamma"
893                seqcheck                        "ARB_C2288038"
894                %) /*species*/
895
896        species                 :5000   %% (%
897                name                    :7600   "FrnPhilo"
898                acc                             "Z21933"
899                full_name               :4400   "Francisella philomiragia"
900                title                           " [DEW] Analysis of 16S rDNA sequences of Francisella; their use for  determination of the phylogeny of the genus and for identification  of strains by the polymerase chain reaction [EBI] Analysis of 16S rDNA sequences of Francisella their use for determination of the phylogeny of the genus and for identification of strains by the polymerase chain reaction [RDP] Analysis of 16S rDNA sequences of Francisella; their use identification of strains by the polymerase chain for determination of the phylogeny of the genus and"
901                journal                         " [EBI] Submitted (04-MAR-1993) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. Forsman M., Microbiology Cementvagen 20 Umea Sweden 901 82 Int. J. Syst. Bacteriol. 44:38-46(1994). [DEW] Int. J. Syst. Bacteriol. date 1994 vol 44 pgs 38-46 [RDP] Int. J. Syst. Bacteriol. 44, 38-46 (1994)"
902                author                          " [EBI] Forsman M.; Forsman M., Sandstrom G., Sjostedt A.; [RDP] Forsman,M., Sandstrom,G. and Sjostedt,A. [DEW] Forsman M., Sandstrom G. and Sjostedt A."
903                file                            " [EBI] fp16srnaa.em_ba [DEW] Fraphi.BPG"
904                date                            " [EBI] 09-MAR-1993 (Rel. 35, Created)|11-AUG-1994 (Rel. 40, Last updated, Version 6) [RDP] 12-MAR-1993"
905                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA 16S rRNA gene. [DEW] SSU [EBI_DE] F.philomiragia 16S rRNA"
906                db_name                         " [RDP,EBI,DEW] Francisella philomiragia"
907                id                              " [EBI] FP16SRNAA [RDP] Fnc.phmira"
908                tax                             " [EBI] Prokaryota; Bacteria; Gracilicutes; Scotobacteria. [DEW] Bacteria|Proteobacteria Gamma"
909                seqcheck                        "ARB_F90B8C2B"
910                %) /*species*/
911
912        species                 :5000   %% (%
913                name                    :7600   "PseAerug"
914                full_name               :4400   "Pseudomonas aeruginosa"
915                acc                             "M34133"
916                warning                         "rdp sequence, differences in ebi"
917                title                           ""
918                journal                         " [DEW] Int. J. syst. Bacteriol. date 1990 vol 4 pgs 426-433"
919                author                          " [DEW] Dewhirst,F.E., Paster,B.J., La Fontaine,S. and Rood,J.I. [EBI] Woese C.R.; [RDP] Woese,C.R."
920                file                            " [DEW] Pseaer2.BPG [EBI] parrsaa.em_ba"
921                date                            " [RDP] 15-SEP-1990 [EBI] 10-JUL-1990 (Rel. 24, Created)|04-SEP-1991 (Rel. 29, Last updated, Version 2)"
922                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA ribosomal RNA small subunit ribosomal RNA. [EBI_DE] P.aeruginosa 16S ribosomal RNA. [DEW] SSU"
923                db_name                         " [RDP,EBI] Pseudomonas aeruginosa [DEW] Pseudomonas aeruginosa 2"
924                id                              " [EBI] PARRSAA [RDP] Ps.aerugin"
925                tax                             " [DEW] Bacteria|Proteobacteria Gamma [EBI] Prokaryota; Bacteria; Gracilicutes; Scotobacteria;|Aerobic rods and cocci; Pseudomonadaceae; Pseudomonas."
926                seqcheck                        "ARB_BFC83A3D"
927                %) /*species*/
928
929        species                 :5000   %% (%
930                name                    :7600   "PseFlave"
931                full_name               :4400   "Pseudomonas flavescens"
932                acc                             "U01916"
933                title                           " [DEW] Pseudomonas flavescens sp. nov., isolated from walnut blight  cankers [RDP,EBI] Pseudomonas flavescens sp. nov., isolated from walnut blight cankers"
934                journal                         " [RDP] Int. J. Syst. Bacteriol. 44, 410-415 (1994) [DEW] Int. J. Syst. Bacteriol. date 1994 vol 44 pgs 410-415 [EBI] Int. J. Syst. Bacteriol. 44:410-415(1994). Submitted (20-SEP-1993) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. John L. Johnson, Biochemistry and Anaerobic Microbiology, Virginia Tech, Blacksburg, VA 24061-0305, USA"
935                author                          " [DEW] Hildebrand D.C., Palleroni N.J., Henderson M., Toth J. and  Johnson J.L. [EBI] Hildebrand D.C., Palleroni N.J., Henderson M., Toth J., Johnson J.L.; Johnson J.L.; [RDP] Hildebrand,D.C., Palleroni,N.J., Hendson,M., Toth,J. and Johnson,J.L."
936                file                            " [EBI] b6216s.em_ba [DEW] Psefla.BPG"
937                date                            " [EBI] 04-JAN-1994 (Rel. 38, Created)|17-FEB-1995 (Rel. 42, Last updated, Version 4) [RDP] 28-SEP-1993"
938                gene                            " [DEW] SSU [EBI_KW] . [EBI_DE] Pseudomonas flavescens B62 16S ribosomal RNA."
939                db_name                         " [RDP,EBI,DEW] Pseudomonas flavescens"
940                id                              " [RDP] Ps.flavesc [EBI] B6216S"
941                tax                             " [DEW] Bacteria|Proteobacteria Gamma [EBI] Prokaryota; Bacteria; Gracilicutes; Scotobacteria;|Aerobic rods and cocci; Pseudomonadaceae; Pseudomonas."
942                seqcheck                        "ARB_AE303735"
943                %) /*species*/
944
945        species                 :5000   %% (%
946                name                    :7600   "HlmHalod"
947                full_name               :4400   "Halomonas halodenitrificans"
948                acc                             "L04942"
949                warning                         "rdp sequence, differs in dew and ebi"
950                title                           " [RDP] Re-evaluating the Classification of Paracoccus of 16S ribosomal DNA halodenitrificans with Sequence Comparisons [DEW] Re-evaluating the Classification of Paracoccus halodenitrificans  with Sequence Comparisons of 16S Ribosomal DNA [EBI] Re-evaluating the Classification of Paracoccus halodenitrificans with Sequence Comparisons of 16S Ribosomal DNA"
951                journal                         " [RDP] Int. J. Syst. Bacteriol. 44, 360-361 (1994) [EBI] Int. J. Syst. Bacteriol. 44:360-361(1994). [DEW] Int. J. Syst. Bacteriol. date 1994 vol 44 pgs 360-361"
952                author                          " [RDP] Miller,J.M., Dobson,S.J., Franzmann,P.D. and McMeekin,T.A. [DEW] Miller J.J., Dobson S.J., Franzmann P.D. and McMeekin T.A. [EBI] Miller J.J., Dobson S.J., Franzmann P.D., McMeekin T.A.;"
953                file                            " [EBI] hlmrrna.em_ba [DEW] Parhal.BPG"
954                date                            " [EBI] 28-NOV-1993 (Rel. 37, Created)|14-JUL-1994 (Rel. 40, Last updated, Version 3) [RDP] 23-MAY-1994"
955                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA. [DEW] SSU [EBI_DE] Paracoccus halodenitrificans 16S ribosomal RNA sequence."
956                db_name                         " [DEW,EBI,RDP] Paracoccus halodenitrificans [RDP] Halomonas halodenitrificans"
957                id                              " [RDP] Par.halden [EBI] HLMRRNA"
958                tax                             " [EBI] Prokaryota; Bacteria; Gracilicutes; Scotobacteria;|Aerobic rods and cocci; Paracoccus. [DEW] Bacteria|Proteobacteria Gamma"
959                seqcheck                        "ARB_4A9FDEA5"
960                %) /*species*/
961
962        species                 :5000   %% (%
963                name                    :7600   "VibFurni"
964                acc                             "X76336"
965                full_name               :4400   "Vibrio furnissii"
966                title                           " [DEW] Sequence determination of rRNA genes of pathogenic Vibrio species  and whole-cell identification of Vibrio vulnificus with  rRNA-targeted oligonucleotide probes [EBI] Sequence determination of rRNA genes of pathogenic Vibrio species and whole-cell identification of Vibrio vulnificus with rRNA-targeted oligonucleotide probes"
967                journal                         " [EBI] Int. J. Syst. Bacteriol. 44:330-337(1994). Submitted (23-NOV-1993) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. W. Ludwig, Lehrst. f. Mikrobiologie TU Muenchen, 80290 Muenchen, FRG [DEW] Int. J. Syst. Bacteriol. date 1994 vol 44 pgs 330-337"
968                author                          " [EBI] Aznar R., Ludwig W., Amann R., Schleifer K.H.; Ludwig W.; [DEW] Aznar R., Ludwig W., Amann R. and Schleifer K.H."
969                file                            " [EBI] vf16srr2.em_ba [DEW] Vibfur.BPG"
970                date                            " [EBI] 17-AUG-1994 (Rel. 40, Created)|17-AUG-1994 (Rel. 40, Last updated, Version 2)"
971                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA. [EBI_DE] V.furnissii (ATCC 35016 T) 16S rRNA gene. [DEW] SSU"
972                db_name                         " [EBI,DEW] Vibrio furnisii"
973                id                              " [EBI] VF16SRR2"
974                tax                             " [DEW] Bacteria|Proteobacteria Gamma [EBI] Prokaryota; Bacteria; Gracilicutes; Scotobacteria;|Facultatively anaerobic rods; Vibrionaceae; Vibrio."
975                seqcheck                        "ARB_F6BE0C94"
976                remark2                         "seqcheck acc"
977                %) /*species*/
978
979        species                 :5000   %% (%
980                name                    :7600   "VibVulni"
981                acc                             "X76333"
982                full_name               :4400   "Vibrio vulnificus"
983                title                           " [DEW] Sequence determination of rRNA genes of pathogenic Vibrio species  and whole-cell identification of Vibrio vulnificus with  rRNA-targeted oligonucleotide probes [EBI] Sequence determination of rRNA genes of pathogenic Vibrio species and whole-cell identification of Vibrio vulnificus with rRNA-targeted oligonucleotide probes"
984                journal                         " [EBI] Int. J. Syst. Bacteriol. 44:330-337(1994). Submitted (23-NOV-1993) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. W. Ludwig, Lehrst. f. Mikrobiologie TU Muenchen, 80290 Muenchen, FRG [DEW] Int. J. Syst. Bacteriol. date 1994 vol 44 pgs 330-337"
985                author                          " [EBI] Aznar R., Ludwig W., Amann R., Schleifer K.H.; Ludwig W.; [DEW] Aznar R., Ludwig W., Amann R. and Schleifer K.H."
986                file                            " [DEW] Vibvul.BPG [EBI] vv16srr.em_ba"
987                date                            " [EBI] 17-AUG-1994 (Rel. 40, Created)|17-AUG-1994 (Rel. 40, Last updated, Version 2)"
988                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA. [EBI_DE] V.vulnificus (ATCC 27562 T) 16S rRNA gene. [DEW] SSU"
989                db_name                         " [EBI,DEW] Vibrio vulnificus"
990                id                              " [EBI] VV16SRR"
991                tax                             " [DEW] Bacteria|Proteobacteria Gamma [EBI] Prokaryota; Bacteria; Gracilicutes; Scotobacteria;|Facultatively anaerobic rods; Vibrionaceae; Vibrio."
992                seqcheck                        "ARB_2A1D7435"
993                remark2                         "seqcheck acc"
994                %) /*species*/
995
996        species                 :5000   %% (%
997                name                    :7600   "VibChole"
998                acc                             "X76337"
999                full_name               :4400   "Vibrio cholerae"
1000                title                           " [DEW] Sequence determination of rRNA genes of pathogenic Vibrio species  and whole-cell identification of Vibrio vulnificus with  rRNA-targeted oligonucleotide probes [EBI] Sequence determination of rRNA genes of pathogenic Vibrio species and whole-cell identification of Vibrio vulnificus with rRNA-targeted oligonucleotide probes"
1001                journal                         " [EBI] Int. J. Syst. Bacteriol. 44:330-337(1994). Submitted (23-NOV-1993) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. W. Ludwig, Lehrst. f. Mikrobiologie TU Muenchen, 80290 Muenchen, FRG [DEW] Int. J. Syst. Bacteriol. date 1994 vol 44 pgs 330-337"
1002                author                          " [EBI] Aznar R., Ludwig W., Amann R., Schleifer K.H.; Ludwig W.; [DEW] Aznar R., Ludwig W., Amann R. and Schleifer K.H."
1003                file                            " [EBI] vc16srrna.em_ba [DEW] Vibcho.BPG"
1004                date                            " [EBI] 17-AUG-1994 (Rel. 40, Created)|17-AUG-1994 (Rel. 40, Last updated, Version 2)"
1005                gene                            " [EBI_KW] 16S ribosomal RNA. [EBI_DE] V.cholerae (CECT 514 T) 16S rRNA gene. [DEW] SSU"
1006                db_name                         " [EBI,DEW] Vibrio cholerae"
1007                id                              " [EBI] VC16SRRNA"
1008                tax                             " [DEW] Bacteria|Proteobacteria Gamma [EBI] Prokaryota; Bacteria; Gracilicutes; Scotobacteria;|Facultatively anaerobic rods; Vibrionaceae; Vibrio."
1009                seqcheck                        "ARB_1F7AE5C4"
1010                remark2                         " acc"
1011                %) /*species*/
1012
1013        %) /*species_data*/
1014
1015merge                           %% (%
1016        remap_species_list              ""
1017        remap_enable                    %i 0
1018        %) /*merge*/
1019
1020presets                         %% (%
1021        key_data                        %% (%
1022                key                             %% (%
1023                        key_name                        "name"
1024                        key_type                        %i 12
1025                        key_hidden                      %i 0
1026                        %) /*key*/
1027
1028                key                             %% (%
1029                        key_name                        "full_name"
1030                        key_type                        %i 12
1031                        key_hidden                      %i 0
1032                        %) /*key*/
1033
1034                key                             %% (%
1035                        key_name                        "db_name"
1036                        key_type                        %i 12
1037                        key_hidden                      %i 0
1038                        %) /*key*/
1039
1040                key                             %% (%
1041                        key_name                        "tax"
1042                        key_type                        %i 12
1043                        key_hidden                      %i 0
1044                        %) /*key*/
1045
1046                key                             %% (%
1047                        key_name                        "acc"
1048                        key_type                        %i 12
1049                        key_hidden                      %i 0
1050                        %) /*key*/
1051
1052                key                             %% (%
1053                        key_name                        "id"
1054                        key_type                        %i 12
1055                        key_hidden                      %i 0
1056                        %) /*key*/
1057
1058                key                             %% (%
1059                        key_name                        "author"
1060                        key_type                        %i 12
1061                        key_hidden                      %i 0
1062                        %) /*key*/
1063
1064                key                             %% (%
1065                        key_name                        "title"
1066                        key_type                        %i 12
1067                        key_hidden                      %i 0
1068                        %) /*key*/
1069
1070                key                             %% (%
1071                        key_name                        "journal"
1072                        key_type                        %i 12
1073                        key_hidden                      %i 0
1074                        %) /*key*/
1075
1076                key                             %% (%
1077                        key_name                        "date"
1078                        key_type                        %i 12
1079                        key_hidden                      %i 0
1080                        %) /*key*/
1081
1082                key                             %% (%
1083                        key_name                        "file"
1084                        key_type                        %i 12
1085                        key_hidden                      %i 0
1086                        %) /*key*/
1087
1088                key                             %% (%
1089                        key_name                        "gene"
1090                        key_type                        %i 12
1091                        key_hidden                      %i 0
1092                        %) /*key*/
1093
1094                key                             %% (%
1095                        key_name                        "warning"
1096                        key_type                        %i 12
1097                        key_hidden                      %i 0
1098                        %) /*key*/
1099
1100                key                             %% (%
1101                        key_name                        "rdp_biovar"
1102                        key_type                        %i 12
1103                        key_hidden                      %i 0
1104                        %) /*key*/
1105
1106                key                             %% (%
1107                        key_name                        "seqcheck"
1108                        key_type                        %i 12
1109                        key_hidden                      %i 0
1110                        %) /*key*/
1111
1112                key                             %% (%
1113                        key_name                        "remark2"
1114                        key_type                        %i 12
1115                        key_hidden                      %i 0
1116                        %) /*key*/
1117
1118                key                             %% (%
1119                        key_name                        "tmp"
1120                        key_type                        %i 12
1121                        key_hidden                      %i 0
1122                        %) /*key*/
1123
1124                %) /*key_data*/
1125
1126        use                             "ali_16s"
1127        %) /*presets*/
1128
1129extended_data                   %% (%
1130        extended                        %% (%
1131                name                    :7000   "HELIX_NR"
1132                showsec                         %i 0
1133                %) /*extended*/
1134
1135        extended                        %% (%
1136                name                    :7000   "HELIX"
1137                showsec                         %i 0
1138                %) /*extended*/
1139
1140        extended                        %% (%
1141                name                    :7000   "forcecompress_01"
1142                showsec                         %i 0
1143                %) /*extended*/
1144
1145        extended                        %% (%
1146                name                    :7000   "forcecompress_2"
1147                showsec                         %i 0
1148                %) /*extended*/
1149
1150        extended                        %% (%
1151                name                    :7000   "forcecompress_3"
1152                showsec                         %i 0
1153                %) /*extended*/
1154
1155        extended                        %% (%
1156                name                    :7000   "forcecompress_4"
1157                showsec                         %i 0
1158                %) /*extended*/
1159
1160        extended                        %% (%
1161                name                    :7000   "forcecompress_5"
1162                showsec                         %i 0
1163                %) /*extended*/
1164
1165        extended                        %% (%
1166                name                    :7000   "forcecompress_6"
1167                showsec                         %i 0
1168                %) /*extended*/
1169
1170        extended                        %% (%
1171                name                    :7000   "forcecompress_7"
1172                showsec                         %i 0
1173                %) /*extended*/
1174
1175        extended                        %% (%
1176                name                    :7000   "forcecompress_8"
1177                showsec                         %i 0
1178                %) /*extended*/
1179
1180        extended                        %% (%
1181                name                    :7000   "forcecompress_9"
1182                showsec                         %i 0
1183                %) /*extended*/
1184
1185        extended                        %% (%
1186                name                    :7000   "forcecompress_10"
1187                showsec                         %i 0
1188                %) /*extended*/
1189
1190        extended                        %% (%
1191                name                    :7000   "ECOLI"
1192                errors                          %i 0
1193                acc                             "J01695"
1194                full_name                       "Escherichia coli"
1195                aligned                         "12dec94"
1196                showsec                         %i 1
1197                %) /*extended*/
1198
1199        extended                        %% (%
1200                name                    :7000   "POS_VAR_BY_PARSIMONY"
1201                sai_group                       "default_group"
1202                showsec                         %i 0
1203                %) /*extended*/
1204
1205        extended                        %% (%
1206                name                    :7000   "posvar_full_all"
1207                showsec                         %i 0
1208                %) /*extended*/
1209
1210        extended                        %% (%
1211                name                    :7000   "primer_3"
1212                showsec                         %i 0
1213                %) /*extended*/
1214
1215        extended                        %$ (%
1216                name                    :7000   "markerline"
1217                showsec                         %i 0
1218                %) /*extended*/
1219
1220        extended                        %% (%
1221                name                    :7000   "Aaaa"
1222                showsec                         %i 0
1223                %) /*extended*/
1224
1225        %) /*extended_data*/
1226
1227tree_data                       %% (%
1228        tree_fml_16142                  %% (%
1229                tree                            "N0.12766,0.034188;LNatMagad\AN0.0440714,0.163286;N0.0697446,0.070936;LMetMazei\ALMthBurto\ALMtsHunga\A"
1230                nnodes                          %i 3
1231                remark                          "PRG=FASTDNAML FILTER=none PKG=olsen/felsenstein RATE=\n&&fastDNAml: version = '1.2.1', likelihood = -13725.51803488, ntaxa = 19, opt_level = 1, smoothed = 1"
1232                ruler                           %% (%
1233                        size                            %f 0.1
1234                        LIST                            %% (%
1235                                ruler_y                         %f 0.0161977
1236                                ruler_x                         %f 0.000797317
1237                                text_x                          %f -0.00137682
1238                                text_y                          %f -0.0113036
1239                                %) /*LIST*/
1240
1241                        text_x                          %f 0
1242                        text_y                          %f 0
1243                        ruler_width                     %i 0
1244                        %) /*ruler*/
1245
1246                security                        %i 0
1247                order                           %i 1
1248                %) /*tree_fml_16142*/
1249
1250        tree_pars                       %% (%
1251                tree                            "N0.0108548,0.0108548;N0.1058,0.0155251;N0.00387222,0.121562;N0.0191113,0.0246548;N0.0350195,0.0201923;N0.0097229,0.109537;N0.0184466,0.0203149;N0.0158025,0.0787234;N0.0439771,0.0291819;N0.0690648,0.0356139;N0.0151229,0.14145;N0.0186829,0.01998;N0.0192864,0.0422406;N0.0717614,0.123989;N0.040146,0.0376007;N0.029517,0.0188004;LVibFurni\ALVibVulni\ALVibChole\ALHlmHalod\AN0.0469181,0.0358744;LPseAerug\ALPseFlave\AN0.158228,0.122028;LFrnPhilo\ALLegLytic\ALDchNodos\AN0.0324893,0.0436433;N0.0240964,0.149359;N0.106316,0.146212;LDsfDesul\ALSt0Isola\ALDslToluo\AN0.089539,0.0960352;LPelAcety\ALPelPropi\AN0.0952844,0.0537849;N0.0201149,0.089566;LAnaMargi\ALCowRumin\AN0.0807985,0.1;LAzoCauli\ALBraJapon\AN0.251016,0.170384;LBctFragi\ALRhoMarin\AN0.0770053,0.185617;N0.228022,0.272727;N0.0545295,0.056239;LChlPneum\ALChlTrach\ALPlaLimno\AN0.102588,0.0761559;LFusNecro\ALProModes\AN0.00757217,0.0338983;LMycChlor\ALBifBifid\AN0.0168234,0.143393;N0.0304878,0.154057;N0.123572,0.0373932;LNatMagad\AN0.04617,0.158337;N0.0726916,0.070936;LMetMazei\ALMthBurto\ALMtsHunga\ALDicTherm\AN0.0373066,0.0429224;LCalSacch\ALThnCellu\AN0,0.153705;N0.0373832,0.0472367;N0.0358999,0.166041;N0.0226843,0.0723112;N0.0177986,0.0783242;N0.0102756,0.0227058;N0.00744186,0.061762;N0.0122008,0.0292104;LCloCorin\ALCloParap\ALCloPerfr\AN0.0540541,0.0376665;LCloColla\ALCloSardi\ALCloTyrob\ALCloProte\AN0.0267775,0.023084;LCloBifer\ALCloGhoni\ALClrFervi\ALCloTherm\ALMooTherm\AN0.0135931,0.0299033;N0.0183066,0.0337029;N0.0537341,0.0102948;N0.018648,0.0603372;N0.0372727,0.0759734;N0.0139991,0.0173437;N0.0379919,0.0918728;N0.0318443,0.0300752;LLacPonti\ALLacReute\ALLacAcido\AN0.0318443,0.0503311;LLacFruct\ALLacSanfr\ALStrSaliv\ALCarAlter\AN0.0967169,0.0769911;N0.00980829,0.016696;N0.00709849,0.00886525;LStaHaemo\ALStaHomin\ALStaAureu\ALBacGlobi\ALBacLiche\ALBacMetha\ALBacStear\A"
1252                nnodes                          %i 59
1253                remark                          "PRG=dnadist CORR=jukes_cantor FILTER=POS_VAR_BY_PARSIMONY PKG=ARB\n[created as copy of 'tree_NJ']"
1254                security                        %i 0
1255                ruler                           %% (%
1256                        size                            %f 0.1
1257                        LIST                            %% (%
1258                                ruler_y                         %f 0
1259                                ruler_x                         %f 0
1260                                text_x                          %f 0
1261                                text_y                          %f 0
1262                                %) /*LIST*/
1263
1264                        ruler_width                     %i 0
1265                        %) /*ruler*/
1266
1267                order                           %i 2
1268                %) /*tree_pars*/
1269
1270        tree_NJ_pars_lengths            %% (%
1271                tree                            "N0.00708885,0.00708885;N0.0161061,0.00381679;N0.016152,0.00761905;N0.00558919,0.013579;N0.00279851,0.00289855;N0.0171674,0.00839944;N0.0152745,0.0267592;N0.0335893,0.0708861;N0.0120968,0.146643;N0.0456158,0.257833;N0.0133197,0.166205;N0.0433711,0.185448;N0.145606,0.0145822;LNatMagad\AN0.0502765,0.173182;N0.0666667,0.101478;LMetMazei\ALMthBurto\ALMtsHunga\ALStaHaemo\ALCloGhoni\ALDchNodos\ALBacLiche\ALClrFervi\AN0.164358,0.137961;LCloBifer\ALStaAureu\AN0.0331439,0.0719212;N0.0152526,0.0185275;N0.0123692,0.0230005;N0.0104812,0.012487;N0.0624113,0.206167;N0.0805106,0.11727;N0.0731949,0.11535;N0.0543953,0.245931;N0.017769,0.20327;N0.0308347,0.0436548;LBctFragi\AN0.129474,0.157732;LDsfDesul\ALSt0Isola\ALDslToluo\ALFrnPhilo\ALCloPerfr\ALCloColla\ALPelPropi\ALCloProte\AN0.148791,0.21086;LCloParap\ALMycChlor\AN0.0331061,0.179329;N0.247949,0.27102;LDicTherm\ALVibFurni\ALLacAcido\AN0.10531,0.157403;LBacGlobi\ALStrSaliv\AN0.0144648,0.0215054;LVibVulni\AN0.085669,0.17639;LAzoCauli\ALCloSardi\AN0.0520482,0.0272241;N0.176391,0.222422;N0.0327289,0.0318443;LLacPonti\ALLacReute\ALPseFlave\AN0.0408163,0.191083;LCloTherm\ALCalSacch\AN0.168589,0.245317;LMooTherm\ALRhoMarin\AN0.00551724,0.0440252;N0.128298,0.153369;LCarAlter\ALStaHomin\AN0.22192,0.181738;LBifBifid\ALPelAcety\AN0.0046729,0.0067731;N0.071681,0.12489;N0.0126459,0.2;N0.0624086,0.201432;N0.00301811,0.0117302;N0.18668,0.0335637;N0.039272,0.0831025;LAnaMargi\ALCowRumin\AN0.0727459,0.182153;N0.176604,0.200368;LBacStear\ALCloCorin\ALPseAerug\AN0.0631016,0.0630081;N0.195055,0.282628;N0.0510114,0.0544815;LChlPneum\ALChlTrach\ALPlaLimno\ALLegLytic\ALVibChole\ALBraJapon\ALBacMetha\AN0.0256937,0.0364173;N0.0646388,0.172131;N0.161742,0.200359;N0.104436,0.0897552;LFusNecro\ALProModes\ALHlmHalod\ALCloTyrob\AN0.0451514,0.237443;N0.0415745,0.0476821;LLacFruct\ALLacSanfr\ALThnCellu\A"
1272                nnodes                          %i 59
1273                remark                          "PRG=dnadist CORR=jukes_cantor FILTER=POS_VAR_BY_PARSIMONY PKG=ARB\n[created as copy of 'tree_NJ']"
1274                security                        %i 0
1275                ruler                           %% (%
1276                        size                            %f 0.1
1277                        LIST                            %% (%
1278                                ruler_y                         %f 0
1279                                ruler_x                         %f 0
1280                                text_x                          %f 0
1281                                text_y                          %f 0
1282                                %) /*LIST*/
1283
1284                        ruler_width                     %i 0
1285                        %) /*ruler*/
1286
1287                order                           %i 3
1288                %) /*tree_NJ_pars_lengths*/
1289
1290        tree_NJ                         %% (%
1291                tree                            "N1.20794e-07,1.20794e-07;N5.36178e-09,5.13692e-07;N2.6823e-08,5.13692e-07;N1.01294e-07,5.11672e-07;N6.65139e-08,4.14239e-07;N5.34411e-07,3.15082e-07;N1.13907e-06,7.16579e-06;N1.36055e-06,6.06164e-06;N7.63187e-06,-7.59554e-06;N1.23855e-05,-1.69153e-05;N9.21659e-05,-5.63937e-05;N0.00139054,0.00671661;N0.014944,0.00649882;LNatMagad\AN0.00578574,0.0304762;N0.00100608,0.00605296;LMetMazei\ALMthBurto\ALMtsHunga\ALStaHaemo\ALCloGhoni\ALDchNodos\ALBacLiche\ALClrFervi\AN0.00703765,-1.18327e-05;LStaAureu\ALCloBifer\AN1.2028e-07,7.41039e-06;N9.25764e-07,7.01916e-07;N6.57095e-06,-6.57095e-06;N0.0141492,-3.10914e-05;LDicTherm\ALVibFurni\ALLacAcido\AN1.56168e-06,6.74319e-06;N3.94903e-06,4.99126e-06;N1.48935e-05,-2.44286e-05;N0.0001535,0.0141357;N0.000231034,0.006855;N0.000873399,-0.00037473;N0.00145389,0.00577492;N0.00162711,0.00356337;LBctFragi\AN0.00641692,0.00307688;LSt0Isola\ALDsfDesul\ALDslToluo\ALFrnPhilo\ALCloPerfr\ALCloColla\ALPelPropi\ALCloProte\AN-1.21249e-05,0.00703794;LCloParap\ALMycChlor\AN0.00703748,-1.1668e-05;LStrSaliv\ALBacGlobi\AN9.57905e-07,7.50668e-06;LVibVulni\AN-1.25744e-05,1.25744e-05;LCloSardi\ALAzoCauli\AN8.71008e-07,7.51314e-06;N-6.8609e-06,6.8609e-06;LCalSacch\ALCloTherm\AN0.0070884,-2.9366e-05;N0.0071434,0.00697466;LLacPonti\ALLacReute\ALPseFlave\AN0.00703983,-1.40191e-05;LMooTherm\ALRhoMarin\AN8.6323e-07,7.44164e-06;N6.35181e-06,-6.35181e-06;LCarAlter\ALStaHomin\AN-1.36336e-05,0.00703945;LBifBifid\ALPelAcety\AN2.70727e-06,2.27964e-07;N1.07651e-05,-1.07651e-05;N2.51562e-05,-2.51562e-05;N1.74899e-05,-6.04537e-05;N0.000718602,0.000768073;N0.000988143,0.00617481;LLegLytic\AN0.0292277,0.0147038;N0.00720378,0.00691429;LChlTrach\ALChlPneum\ALPlaLimno\AN0.00107696,0.00646355;N0.00174288,-0.00174288;N-0.00340997,0.00340997;LBacStear\ALCloCorin\ALPseAerug\AN0.00344312,-0.000162454;LAnaMargi\ALCowRumin\ALVibChole\ALBraJapon\ALBacMetha\AN8.83039e-07,7.38748e-06;N-6.70158e-06,6.70158e-06;LThnCellu\AN0,-0;LLacSanfr\ALLacFruct\AN1.28789e-05,-1.28789e-05;N3.01765e-05,-3.01765e-05;N0.00717832,0.0142517;LFusNecro\ALProModes\ALHlmHalod\ALCloTyrob\A"
1292                nnodes                          %i 59
1293                remark                          "PRG=dnadist CORR=jukes_cantor FILTER=POS_VAR_BY_PARSIMONY PKG=ARB"
1294                security                        %i 0
1295                ruler                           %% (%
1296                        size                            %f 0.1
1297                        LIST                            %% (%
1298                                ruler_y                         %f 0
1299                                ruler_x                         %f 0
1300                                text_x                          %f 0
1301                                text_y                          %f 0
1302                                %) /*LIST*/
1303
1304                        ruler_width                     %i 0
1305                        %) /*ruler*/
1306
1307                order                           %i 4
1308                %) /*tree_NJ*/
1309
1310        %) /*tree_data*/
1311
1312description                     "User text"
1313focus                           %% (%
1314        tree_name                       "tree_pars"
1315        configuration                   "other"
1316        %) /*focus*/
1317
1318nt                              %% (%
1319        target_string                   "AAACUCAAA"
1320        itarget_string                  "AAACUCAAA"
1321        primer_target_string            ""
1322        gene_content                    ""
1323        %) /*nt*/
1324
1325awt                             %% (%
1326        dtree                           %% (%
1327                show_circle                     %i 1
1328                radial                          %% (%
1329                        %) /*radial*/
1330
1331                dendro                          %% (%
1332                        %) /*dendro*/
1333
1334                %) /*dtree*/
1335
1336        %) /*awt*/
1337
1338submission                      %% (%
1339        %) /*submission*/
1340
1341arb_edit                        %% (%
1342        top_area_species                ""
1343        bottom_area_species             ""
1344        %) /*arb_edit*/
1345
1346ARB_EDIT                        %% (%
1347        action                          ""
1348        value                           ""
1349        awar                            ""
1350        %) /*ARB_EDIT*/
1351
1352pars                            %% (%
1353        pars_type                       %i 0
1354        %) /*pars*/
1355
1356genetic                         %% (%
1357        kh                              %% (%
1358                nodes                           %f 1.7
1359                maxdepth                        %i 15
1360                incdepth                        %i 5
1361                static                          %% (%
1362                        enable                          %i 1
1363                        depth0                          %i 2
1364                        depth1                          %i 2
1365                        depth2                          %i 2
1366                        depth3                          %i 2
1367                        depth4                          %i 1
1368                        %) /*static*/
1369
1370                dynamic                         %% (%
1371                        enable                          %i 1
1372                        start                           %i 100
1373                        maxx                            %i 6
1374                        maxy                            %i 150
1375                        %) /*dynamic*/
1376
1377                function_type                   %i 5
1378                %) /*kh*/
1379
1380        %) /*genetic*/
1381
1382genom_db                        %i 0
1383sai_visualize                   %% (%
1384        %) /*sai_visualize*/
1385
1386MAUS                            %% (%
1387        excl_acc                        ""
1388        %) /*MAUS*/
1389
1390checks                          %% (%
1391        check                           "fix gene_data"
1392        check                           "fix_dict_compress"
1393        check                           "del_mark_move_REF"
1394        check                           "duplicated_item_colors"
1395        %) /*checks*/
1396
1397track                           %% (%
1398        initials                        "westram"
1399        %) /*track*/
1400
1401secedit                         %% (%
1402        structs                         %% (%
1403                ali_16s                         %% (%
1404                        current                         %i 0
1405                        struct                          %% (%
1406                                name                            "Default"
1407                                data                            "VERSION=3\nLOOP={\n\tRADIUS=0:0\n\tREL=0\n\tSTRAND={\n\t\tSEQ=2:3\n\t\tREL=0\n\t\tLENGTH=0:0\n\t\tLOOP={\n\t\t\tRADIUS=0:0\n\t\t\tREL=0\n\t\t\tSEGMENT={\n\t\t\t\tSEQ=3:0\n\t\t\t}\n\t\t}\n\t\tSEQ=0:1\n\t}\n\tSEGMENT={\n\t\tSEQ=1:2\n\t}\n}\n"
1408                                ref                             "...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................x....................................................................................................................................................................x........................................................................................x...............................................................................................................................................................................................................x..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................."
1409                                %) /*struct*/
1410
1411                        %) /*ali_16s*/
1412
1413                %) /*structs*/
1414
1415        %) /*secedit*/
1416
1417table_data                      %% (%
1418        %) /*table_data*/
1419
1420configuration_data              %% (%
1421        configuration                   %% (%
1422                name                            "some"
1423                top_area                        "\ASHELIX_NR\ASHELIX\ASECOLI"
1424                middle_area                     "\AGSAI-Maingroup\AFSAI:SAI's\ASAaaa\ASmarkerline\ASposvar_full_all\ASprimer_3\AE\AFSAI:default_group\ASPOS_VAR_BY_PARSIMONY\AE\AE\AFMore Sequences\AE\ALNatMagad\ALMetMazei\ALMthBurto\ALMtsHunga\ALLacPonti\ALLacReute\ALPseFlave\ALCloTherm\ALCalSacch"
1425                %) /*configuration*/
1426
1427        configuration                   %% (%
1428                name                            "other"
1429                top_area                        "\ASHELIX_NR\ASHELIX\ASECOLI"
1430                middle_area                     "\AGSAI-Maingroup\AFSAI:SAI's\ASAaaa\ASmarkerline\ASposvar_full_all\ASprimer_3\AE\AFSAI:default_group\ASPOS_VAR_BY_PARSIMONY\AE\AE\AFMore Sequences\AE\ALBctFragi\ALDsfDesul\ALSt0Isola\ALDslToluo\ALFrnPhilo\ALLacPonti\ALLacReute\ALPseFlave\ALCloTherm\ALCalSacch"
1431                %) /*configuration*/
1432
1433        configuration                   %% (%
1434                name                            "rest"
1435                top_area                        "\ASHELIX_NR\ASHELIX\ASECOLI"
1436                middle_area                     "\AGSAI-Maingroup\AFSAI:SAI's\ASAaaa\ASmarkerline\ASposvar_full_all\ASprimer_3\AE\AFSAI:default_group\ASPOS_VAR_BY_PARSIMONY\AE\AE\AFMore Sequences\AE\ALVibFurni\ALVibVulni\ALVibChole\ALHlmHalod\ALPseAerug\ALLegLytic\ALDchNodos\ALPelAcety\ALPelPropi\ALAnaMargi\ALCowRumin\ALAzoCauli\ALBraJapon\ALRhoMarin\ALChlPneum\ALChlTrach\ALPlaLimno\ALFusNecro\ALProModes\ALMycChlor\ALBifBifid\ALDicTherm\ALThnCellu\ALCloCorin\ALCloParap\ALCloPerfr\ALCloColla\ALCloSardi\ALCloTyrob\ALCloProte\ALCloBifer\ALCloGhoni\ALClrFervi\ALMooTherm\ALLacAcido\ALLacFruct\ALLacSanfr\ALStrSaliv\ALCarAlter\ALStaHaemo\ALStaHomin\ALStaAureu\ALBacGlobi\ALBacLiche\ALBacMetha\ALBacStear"
1437                %) /*configuration*/
1438
1439        configuration                   %% (%
1440                name                            "inboth"
1441                top_area                        "\ASHELIX_NR\ASHELIX\ASECOLI"
1442                middle_area                     "\AGSAI-Maingroup\AFSAI:SAI's\ASAaaa\ASmarkerline\ASposvar_full_all\ASprimer_3\AE\AFSAI:default_group\ASPOS_VAR_BY_PARSIMONY\AE\AE\AFMore Sequences\AE\ALPseFlave\ALCalSacch\ALCloTherm\ALLacPonti\ALLacReute"
1443                %) /*configuration*/
1444
1445        %) /*configuration_data*/
1446
1447colorsets                       %% (%
1448        species                         %% (%
1449                colorset                        %% (%
1450                        name                            "someother"
1451                        color_set                       "MetMazei=2;MthBurto=2;MtsHunga=2;NatMagad=2;CalSacch=1;VibChole=0;LacPonti=1;LacReute=1;CloTherm=1;BctFragi=3;DslToluo=3;St0Isola=3;DsfDesul=3;FrnPhilo=3;PseFlave=1"
1452                        %) /*colorset*/
1453
1454                %) /*species*/
1455
1456        %) /*colorsets*/
1457
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.