source: branches/lib/ARB_GDE/GDE_extglob.h

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1// ================================================================ //
2//                                                                  //
3//   File      : GDE_extglob.h                                      //
4//                                                                  //
5//   Institute of Microbiology (Technical University Munich)        //
6//   http://www.arb-home.de/                                        //
7//                                                                  //
8// ================================================================ //
9
10#ifndef GDE_EXTGLOB_H
11#define GDE_EXTGLOB_H
12
13enum GapCompression {
14    COMPRESS_NONE            = 0,
15    COMPRESS_VERTICAL_GAPS   = 1,
16    COMPRESS_ALL             = 2,
17    COMPRESS_NONINFO_COLUMNS = 3,
18};
19
20#define GDEMAXMENU 100
21
22class AP_filter;
23
24#ifndef GDE_PROTO_H
25#include "GDE_proto.h"
26#endif
27
28extern Gmenu menu[GDEMAXMENU];
29extern int   num_menus;
30extern int   DataType;
31extern int   FileFormat;
32extern char  FileName[80];
33
34// Months of the year
35extern const char *GDEmonth[12];
36
37// Tables for DNA/RNA <--> ASCII translation
38extern int Default_RNA_Trans[];
39extern int Default_DNA_Trans[];
40extern int Default_NA_RTrans[];
41
42// Character->color lookup table
43extern int Default_NAColor_LKUP[];
44extern int Default_PROColor_LKUP[];
45
46#else
47#error GDE_extglob.h included twice
48#endif // GDE_EXTGLOB_H
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.