source: branches/lib/EDIT4/ED4_colStat.cxx

Last change on this file was 16763, checked in by westram, 8 years ago
File size: 7.2 KB
Line 
1// =========================================================== //
2//                                                             //
3//   File      : ED4_colStat.cxx                               //
4//   Purpose   :                                               //
5//                                                             //
6//   Institute of Microbiology (Technical University Munich)   //
7//   http://www.arb-home.de/                                   //
8//                                                             //
9// =========================================================== //
10
11#include "ed4_colStat.hxx"
12#include "ed4_class.hxx"
13#include "ed4_extern.hxx"
14
15#include <st_window.hxx>
16#include <aw_root.hxx>
17#include <aw_msg.hxx>
18
19static void toggle_detailed_column_stat(ED4_sequence_terminal *seq_term, bool force_off) {
20    ED4_base *ms_man = seq_term->get_parent(LEV_MULTI_SEQUENCE);
21    if (ms_man) {
22        ED4_multi_sequence_manager *multi_seq_man    = ms_man->to_multi_sequence_manager();
23        ED4_base                   *existing_colstat = multi_seq_man->search_spec_child_rek(LEV_COL_STAT);
24
25        if (existing_colstat) {
26            ED4_manager *colstat_seq_man = existing_colstat->get_parent(LEV_SEQUENCE);
27            colstat_seq_man->Delete();
28        }
29        else { // add
30            if (!force_off) {
31                char namebuffer[NAME_BUFFERSIZE];
32                int  count = 1;
33
34                sprintf(namebuffer, "Sequence_Manager.%ld.%d", ED4_counter, count++);
35
36                ED4_sequence_manager *new_seq_man = new ED4_sequence_manager(namebuffer, 0, 0, multi_seq_man);
37                new_seq_man->set_property(PROP_MOVABLE);
38                multi_seq_man->append_member(new_seq_man);
39
40                int    pixel_length     = max_seq_terminal_length;
41                AW_pos font_height      = ED4_ROOT->font_group.get_height(ED4_G_SEQUENCES);
42                AW_pos columnStatHeight = ceil((COLUMN_STAT_ROWS+0.5 /* reserve a bit more space */)*COLUMN_STAT_ROW_HEIGHT(font_height));
43
44                ED4_columnStat_terminal    *ref_colStat      = ED4_ROOT->ref_terminals.column_stat();
45                ED4_sequence_info_terminal *ref_colStat_info = ED4_ROOT->ref_terminals.column_stat_info();
46
47                ref_colStat->extension.size[HEIGHT] = columnStatHeight;
48                ref_colStat->extension.size[WIDTH]  = pixel_length;
49
50                ED4_sequence_info_terminal *new_colStat_info_term = new ED4_sequence_info_terminal("CStat", SEQUENCE_INFO_WIDTH, columnStatHeight, new_seq_man);
51                new_colStat_info_term->set_property((ED4_properties) (PROP_SELECTABLE | PROP_DRAGABLE | PROP_IS_HANDLE));
52                new_colStat_info_term->set_links(ref_colStat_info, ref_colStat);
53                new_seq_man->append_member(new_colStat_info_term);
54
55                sprintf(namebuffer, "Column_Statistic_Terminal.%ld.%d", ED4_counter, count++);
56                ED4_columnStat_terminal *new_colStat_term = new ED4_columnStat_terminal(namebuffer, 0, columnStatHeight, new_seq_man);
57                new_colStat_term->set_both_links(ref_colStat);
58                new_seq_man->append_member(new_colStat_term);
59
60                ED4_counter++;
61
62                new_seq_man->resize_requested_by_child();
63            }
64        }
65    }
66}
67
68static ARB_ERROR forget_cached_column_stat(ED4_base *base) {
69    if (base->is_sequence_terminal()) {
70        ED4_sequence_terminal *seqTerm = base->to_sequence_terminal();
71        toggle_detailed_column_stat(seqTerm, true);
72        seqTerm->st_ml_node = NULp;
73    }
74    return NULp;
75}
76
77inline void set_col_stat_activated_and_refresh(bool activated) {
78    ED4_ROOT->column_stat_activated = activated;
79    ED4_ROOT->request_refresh_for_sequence_terminals();
80}
81
82static void col_stat_activated(AW_window *) {
83    ED4_ROOT->column_stat_initialized  = true;
84    set_col_stat_activated_and_refresh(true);
85}
86
87static void configureColumnStat(bool forceConfig, WindowCallbackSimple post_config_cb, AW_window *cb_win) {
88    STAT_set_postcalc_callback(ED4_ROOT->st_ml, post_config_cb, cb_win);
89
90    static AW_window *aw_config = NULp;
91    bool              do_config = forceConfig;
92    if (!aw_config) {
93        aw_config = STAT_create_main_window(ED4_ROOT->aw_root, ED4_ROOT->st_ml);
94        do_config = true; // always configure on first call
95    }
96    if (do_config) aw_config->activate();
97}
98
99void ED4_activate_col_stat(AW_window *aww) {
100    if (!ED4_ROOT->column_stat_activated || !ED4_ROOT->column_stat_initialized) {
101        if (ED4_ROOT->column_stat_initialized) {
102            // re-initialize column-stat! first cleanup old column stat data
103            ED4_ROOT->main_manager->route_down_hierarchy(makeED4_route_cb(forget_cached_column_stat)).expect_no_error();
104        }
105        configureColumnStat(true, col_stat_activated, aww);
106    }
107}
108void ED4_disable_col_stat(AW_window *) {
109    if (ED4_ROOT->column_stat_initialized && ED4_ROOT->column_stat_activated) {
110        set_col_stat_activated_and_refresh(false);
111    }
112}
113
114static void show_detailed_column_stats_activated(AW_window *aww) {
115    ED4_ROOT->column_stat_initialized = true;
116    ED4_toggle_detailed_column_stats(aww);
117}
118
119double ED4_columnStat_terminal::threshold = -1;
120int ED4_columnStat_terminal::threshold_is_set() {
121    return threshold>=0 && threshold<=100;
122}
123void ED4_columnStat_terminal::set_threshold(double aThreshold) {
124    threshold = aThreshold;
125    e4_assert(threshold_is_set());
126}
127
128void ED4_set_col_stat_threshold() {
129    double default_threshold = 90.0;
130    if (ED4_columnStat_terminal::threshold_is_set()) {
131        default_threshold = ED4_columnStat_terminal::get_threshold();
132    }
133    char default_input[40];
134    sprintf(default_input, "%6.2f", default_threshold);
135
136    char *input = aw_input("Please insert threshold value for marking:", default_input);
137    if (input) {
138        double input_threshold = atof(input);
139
140        if (input_threshold<0 || input_threshold>100) {
141            aw_message("Illegal threshold value (allowed: 0..100)");
142        }
143        else {
144            ED4_columnStat_terminal::set_threshold(input_threshold);
145            ED4_ROOT->request_refresh_for_specific_terminals(LEV_COL_STAT);
146        }
147        free(input);
148    }
149}
150
151void ED4_toggle_detailed_column_stats(AW_window *aww) {
152    while (!ED4_columnStat_terminal::threshold_is_set()) {
153        ED4_set_col_stat_threshold();
154    }
155
156    ED4_LocalWinContext  uses(aww);
157    ED4_cursor          *cursor = &current_cursor();
158
159    GB_ERROR error = NULp;
160    if (!cursor->owner_of_cursor) {
161        error = "First you have to place your cursor";
162    }
163    else if (!cursor->in_species_seq_terminal()) {
164        error = "Display of column-statistic-details is only possible for species!";
165    }
166    else {
167        ED4_sequence_terminal *seq_term = cursor->owner_of_cursor->to_sequence_terminal();
168        if (!seq_term->st_ml_node && !(seq_term->st_ml_node = STAT_find_node_by_name(ED4_ROOT->st_ml, seq_term->species_name))) {
169            if (ED4_ROOT->column_stat_initialized) {
170                error = "Cannot display column statistics for this species (internal error?)";
171            }
172            else {
173                configureColumnStat(false, show_detailed_column_stats_activated, aww);
174            }
175        }
176        else {
177            toggle_detailed_column_stat(seq_term, false);
178        }
179    }
180
181    if (error) aw_message(error);
182}
183
184
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.