| 1 | // =============================================================== // |
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| 2 | // // |
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| 3 | // File : sec_gc.hxx // |
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| 4 | // Purpose : GC definitions // |
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| 5 | // // |
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| 6 | // Coded by Ralf Westram (coder@reallysoft.de) in July 2007 // |
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| 7 | // Institute of Microbiology (Technical University Munich) // |
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| 8 | // http://www.arb-home.de/ // |
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| 9 | // // |
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| 10 | // =============================================================== // |
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| 11 | |
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| 12 | #ifndef SEC_GC_HXX |
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| 13 | #define SEC_GC_HXX |
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| 15 | enum { |
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| 16 | SEC_GC_LOOP = 0, SEC_GC_FIRST_FONT = SEC_GC_LOOP, SEC_GC_FIRST_DATA = SEC_GC_LOOP, |
|---|
| 17 | SEC_GC_HELIX, |
|---|
| 18 | SEC_GC_NHELIX, SEC_GC_LAST_DATA = SEC_GC_NHELIX, |
|---|
| 19 | SEC_GC_DEFAULT, SEC_GC_ERROR = SEC_GC_DEFAULT, |
|---|
| 20 | SEC_GC_BONDS, |
|---|
| 21 | SEC_GC_ECOLI, SEC_GC_LAST_FONT = SEC_GC_ECOLI, |
|---|
| 22 | SEC_GC_HELIX_NO, |
|---|
| 23 | |
|---|
| 24 | SEC_GC_CBACK_0, // Ranges for SAI visualization |
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| 25 | SEC_GC_CBACK_1, |
|---|
| 26 | SEC_GC_CBACK_2, |
|---|
| 27 | SEC_GC_CBACK_3, |
|---|
| 28 | SEC_GC_CBACK_4, |
|---|
| 29 | SEC_GC_CBACK_5, |
|---|
| 30 | SEC_GC_CBACK_6, |
|---|
| 31 | SEC_GC_CBACK_7, |
|---|
| 32 | SEC_GC_CBACK_8, |
|---|
| 33 | SEC_GC_CBACK_9, |
|---|
| 34 | |
|---|
| 35 | SEC_GC_CURSOR, |
|---|
| 36 | SEC_GC_MBACK, // mismatches |
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| 37 | |
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| 38 | SEC_GC_SBACK_0, // User 1 |
|---|
| 39 | SEC_GC_SBACK_1, // User 2 |
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| 40 | SEC_GC_SBACK_2, // Probe |
|---|
| 41 | SEC_GC_SBACK_3, // Primer (local) |
|---|
| 42 | SEC_GC_SBACK_4, // Primer (region) |
|---|
| 43 | SEC_GC_SBACK_5, // Primer (global) |
|---|
| 44 | SEC_GC_SBACK_6, // Signature (local) |
|---|
| 45 | SEC_GC_SBACK_7, // Signature (region) |
|---|
| 46 | SEC_GC_SBACK_8, // Signature (global) |
|---|
| 47 | |
|---|
| 48 | SEC_SKELE_HELIX, // skeleton helix color |
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| 49 | SEC_SKELE_LOOP, // skeleton loop color |
|---|
| 50 | SEC_SKELE_NHELIX, // skeleton non-pairing helix color |
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| 51 | |
|---|
| 52 | SEC_GC_MAX |
|---|
| 53 | }; |
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| 54 | |
|---|
| 55 | #define SEC_GC_DATA_COUNT (SEC_GC_LAST_DATA-SEC_GC_FIRST_DATA+1) |
|---|
| 56 | #define SEC_GC_FONT_COUNT (SEC_GC_LAST_FONT-SEC_GC_FIRST_FONT+1) |
|---|
| 57 | |
|---|
| 58 | #else |
|---|
| 59 | #error sec_gc.hxx included twice |
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| 60 | #endif // SEC_GC_HXX |
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