source: branches/nameserver/SL/ALILINK/TranslateRealign.h

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1// ============================================================== //
2//                                                                //
3//   File      : TranslateRealign.h                               //
4//   Purpose   : Translate and realign interface                  //
5//                                                                //
6//   Coded by Ralf Westram (coder@reallysoft.de) in August 2014   //
7//   http://www.arb-home.de/                                      //
8//                                                                //
9// ============================================================== //
10
11#ifndef TRANSLATEREALIGN_H
12#define TRANSLATEREALIGN_H
13
14#ifndef ARBDB_BASE_H
15#include <arbdb_base.h>
16#endif
17
18#define AUTODETECT_STARTPOS 3
19
20GB_ERROR ALI_translate_marked(GBDATA *gb_main, bool use_entries, bool save_entries, int selected_startpos, bool translate_all, const char *ali_source, const char *ali_dest);
21GB_ERROR ALI_realign_marked(GBDATA *gb_main, const char *ali_source, const char *ali_dest, size_t& neededLength, bool unmark_succeeded, bool cutoff_dna);
22
23#else
24#error TranslateRealign.h included twice
25#endif // TRANSLATEREALIGN_H
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.