source: branches/port5/lib/arb_default/ntree.arb

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based on a ​patch from Andreas Tille (thank you)

  • removed textedit relicts
  • removed some ancient scripts
  • arb_textedit
    • separates between X- and non-X-editors (and prefer X-editors)
    • added 'editor' with low priority (not neccessarily uses X, may point to nano which fails in xterm)
    • start Xterm (ARB_XCMD) to run non-X-editors (did not edit anything at all when a non-X-editor was selected)
  • removed default configs
    • instead in 'SH/arb'
      • set ARB_XTERM
      • set ARB_XCMD to '$ARB_XTERM -e'
      • no longer overwrite ARB_TEXTEDIT and ARB_GS
  • replaced ARB_TEXTEDIT in GDEmenus (file is obsolete, but i wont clean it up in stable)
  • Property svn:eol-style set to native
  • Property svn:keywords set to Author Date Id Revision
File size: 8.8 KB
Line 
1/*ARBDB ASCII*/
2window  %% (%
3        font            "8x13bold"
4        foreground              "black"
5        background              "grey"
6        color_1         "red"
7        color_2         "green"
8        color_3         "blue"
9        ARB_NT  %% (%
10                horizontal_page_increment       %i 50
11                vertical_page_increment %i 50
12                scroll_delay_vertical   %i 20
13                scroll_delay_horizontal %i 20
14                scroll_width_horizontal %i 9
15                scroll_width_vertical   %i 20
16                %) /*ARB_NT*/
17
18        GDE     %% (%
19                horizontal_page_increment       %i 50
20                vertical_page_increment %i 50
21                scroll_delay_vertical   %i 20
22                scroll_delay_horizontal %i 20
23                scroll_width_horizontal %i 9
24                scroll_width_vertical   %i 20
25                %) /*GDE*/
26
27        windows %% (%
28                ARB_INTRO       %% (%
29                        width   %i 560
30                        height  %i 440
31                        posx    %i 261
32                        posy    %i 195
33                        %) /*ARB_INTRO*/
34
35                ARB_NT  %% (%
36                        width   %i 954
37                        height  %i 801
38                        posx    %i 0
39                        posy    %i 3
40                        %) /*ARB_NT*/
41
42                SELECT_AN_ALIGNMENT     %% (%
43                        width   %i 207
44                        height  %i 118
45                        posx    %i 395
46                        posy    %i 174
47                        %) /*SELECT_AN_ALIGNMENT*/
48
49                SELECT_A_TREE   %% (%
50                        width   %i 207
51                        height  %i 237
52                        posx    %i 385
53                        posy    %i 122
54                        %) /*SELECT_A_TREE*/
55
56                SAVE_ARB_DB     %% (%
57                        width   %i 360
58                        height  %i 384
59                        posx    %i 68
60                        posy    %i 124
61                        %) /*SAVE_ARB_DB*/
62
63                SEARCH_and_QUERY        %% (%
64                        width   %i 460
65                        height  %i 550
66                        posx    %i 37
67                        posy    %i 285
68                        %) /*SEARCH_and_QUERY*/
69
70                TREE_ADMIN      %% (%
71                        width   %i 405
72                        height  %i 265
73                        posx    %i 76
74                        posy    %i 112
75                        %) /*TREE_ADMIN*/
76
77                HELP_WINDOW     %% (%
78                        width   %i 720
79                        height  %i 680
80                        posx    %i 417
81                        posy    %i 97
82                        %) /*HELP_WINDOW*/
83
84                ARB_EXPORT      %% (%
85                        width   %i 520
86                        height  %i 560
87                        posx    %i 68
88                        posy    %i 112
89                        %) /*ARB_EXPORT*/
90
91                NDS     %% (%
92                        width   %i 710
93                        height  %i 373
94                        posx    %i 64
95                        posy    %i 464
96                        %) /*NDS*/
97
98                NDS_SELECT      %% (%
99                        width   %i 240
100                        height  %i 320
101                        posx    %i 195
102                        posy    %i 0
103                        %) /*NDS_SELECT*/
104
105                SPECIES_INFORMATION     %% (%
106                        width   %i 320
107                        height  %i 715
108                        posx    %i 817
109                        posy    %i 42
110                        %) /*SPECIES_INFORMATION*/
111
112                Consensus       %% (%
113                        width   %i 170
114                        height  %i 620
115                        posx    %i 5
116                        posy    %i 0
117                        %) /*Consensus*/
118
119                Expert_Window   %% (%
120                        width   %i 505
121                        height  %i 625
122                        posx    %i 79
123                        posy    %i 123
124                        %) /*Expert_Window*/
125
126                COLORS_AND_FONTS        %% (%
127                        width   %i 794
128                        height  %i 256
129                        posx    %i 50
130                        posy    %i 491
131                        %) /*COLORS_AND_FONTS*/
132
133                WINDOW_PROPERTIES       %% (%
134                        width   %i 596
135                        height  %i 332
136                        posx    %i 192
137                        posy    %i 110
138                        %) /*WINDOW_PROPERTIES*/
139
140                GDE__File__Import_Foreign_Format_using_GDEreadseq_dangerous__   %% (%
141                        width   %i 520
142                        height  %i 324
143                        posx    %i 67
144                        posy    %i 120
145                        %) /*GDE__File__Import_Foreign_Format_using_GDEreadseq_dangerous__*/
146
147                GDE__File__Export_Foreign_Format_using_GDEreadseq_slow_ %% (%
148                        width   %i 520
149                        height  %i 362
150                        posx    %i 71
151                        posy    %i 126
152                        %) /*GDE__File__Export_Foreign_Format_using_GDEreadseq_slow_*/
153
154                GDE__File__Pretty_Print_using_GDEreadseq_       %% (%
155                        width   %i 774
156                        height  %i 679
157                        posx    %i 62
158                        posy    %i 115
159                        %) /*GDE__File__Pretty_Print_using_GDEreadseq_*/
160
161                EXPORT_TREE_TO_FILE     %% (%
162                        width   %i 400
163                        height  %i 470
164                        posx    %i 52
165                        posy    %i 110
166                        %) /*EXPORT_TREE_TO_FILE*/
167
168                GDE__Phylogeny__FastDnaMl_max_50_Species        %% (%
169                        width   %i 520
170                        height  %i 356
171                        posx    %i 72
172                        posy    %i 119
173                        %) /*GDE__Phylogeny__FastDnaMl_max_50_Species*/
174
175                GDE__Phylogeny__Phylip_help     %% (%
176                        width   %i 520
177                        height  %i 321
178                        posx    %i 59
179                        posy    %i 124
180                        %) /*GDE__Phylogeny__Phylip_help*/
181
182                GDE__Phylogeny__DeSoete_Tree_fit        %% (%
183                        width   %i 536
184                        height  %i 568
185                        posx    %i 87
186                        posy    %i 122
187                        %) /*GDE__Phylogeny__DeSoete_Tree_fit*/
188
189                GDE__Phylogeny__Phylip_ParsimonyML      %% (%
190                        width   %i 520
191                        height  %i 643
192                        posx    %i 67
193                        posy    %i 119
194                        %) /*GDE__Phylogeny__Phylip_ParsimonyML*/
195
196                GDE__Phylogeny__Phylip_Distance_methods %% (%
197                        width   %i 520
198                        height  %i 635
199                        posx    %i 76
200                        posy    %i 151
201                        %) /*GDE__Phylogeny__Phylip_Distance_methods*/
202
203                GDE__Phylogeny__Phylip_Distance_Matrix  %% (%
204                        width   %i 520
205                        height  %i 429
206                        posx    %i 75
207                        posy    %i 126
208                        %) /*GDE__Phylogeny__Phylip_Distance_Matrix*/
209
210                ALIGNMENT_INFORMATION   %% (%
211                        width   %i 525
212                        height  %i 345
213                        posx    %i 611
214                        posy    %i 0
215                        %) /*ALIGNMENT_INFORMATION*/
216
217                INSERT_CHAR     %% (%
218                        width   %i 360
219                        height  %i 170
220                        posx    %i 233
221                        posy    %i 0
222                        %) /*INSERT_CHAR*/
223
224                ALIGNMENT_RENAME        %% (%
225                        width   %i 280
226                        height  %i 130
227                        posx    %i 331
228                        posy    %i 40
229                        %) /*ALIGNMENT_RENAME*/
230
231                ALIGNMENT_CREATE        %% (%
232                        width   %i 280
233                        height  %i 130
234                        posx    %i 343
235                        posy    %i 40
236                        %) /*ALIGNMENT_CREATE*/
237
238                ALIGNMENT_COPY  %% (%
239                        width   %i 280
240                        height  %i 130
241                        posx    %i 340
242                        posy    %i 33
243                        %) /*ALIGNMENT_COPY*/
244
245                COPY_DNA_to_PRO %% (%
246                        width   %i 400
247                        height  %i 340
248                        posx    %i 173
249                        posy    %i 157
250                        %) /*COPY_DNA_to_PRO*/
251
252                SAI_INFORMATION %% (%
253                        width   %i 405
254                        height  %i 425
255                        posx    %i 231
256                        posy    %i 129
257                        %) /*SAI_INFORMATION*/
258
259                SAI_RENAME      %% (%
260                        width   %i 280
261                        height  %i 130
262                        posx    %i 0
263                        posy    %i 126
264                        %) /*SAI_RENAME*/
265
266                SAI_COPY        %% (%
267                        width   %i 280
268                        height  %i 130
269                        posx    %i 0
270                        posy    %i 162
271                        %) /*SAI_COPY*/
272
273                Conservation_Profile_Distance_Matrix    %% (%
274                        width   %i 410
275                        height  %i 320
276                        posx    %i 99
277                        posy    %i 144
278                        %) /*Conservation_Profile_Distance_Matrix*/
279
280                AUTORENAME_SPECIES      %% (%
281                        width   %i 320
282                        height  %i 240
283                        posx    %i 95
284                        posy    %i 103
285                        %) /*AUTORENAME_SPECIES*/
286
287                SORT_DATABASE   %% (%
288                        width   %i 300
289                        height  %i 400
290                        posx    %i 241
291                        posy    %i 120
292                        %) /*SORT_DATABASE*/
293
294                PROBE_DESIGN    %% (%
295                        width   %i 600
296                        height  %i 380
297                        posx    %i 49
298                        posy    %i 83
299                        %) /*PROBE_DESIGN*/
300
301                PROBE_MATCH     %% (%
302                        width   %i 880
303                        height  %i 455
304                        posx    %i 32
305                        posy    %i 0
306                        %) /*PROBE_MATCH*/
307
308                PD_RESULT       %% (%
309                        width   %i 940
310                        height  %i 360
311                        posx    %i 15
312                        posy    %i 483
313                        %) /*PD_RESULT*/
314
315                GDE     %% (%
316                        width   %i 700
317                        height  %i 30
318                        posx    %i 410
319                        posy    %i 1000
320                        %) /*GDE*/
321
322                CHECK_GCG_LIST  %% (%
323                        width   %i 360
324                        height  %i 650
325                        posx    %i 162
326                        posy    %i 106
327                        %) /*CHECK_GCG_LIST*/
328
329                %) /*windows*/
330
331        %) /*window*/
332
333presets %% (%
334        tree_name               ""
335        tree_dest               ""
336        tree_security   %i 0
337        use             ""
338        alignment_name          ""
339        alignment_dest          ""
340        alignment_type          ""
341        alignment_len   %i 0
342        aligned %i 0
343        security        %i 0
344        extended_name           ""
345        extended_dest           ""
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531        file_name               "lib/pictures/fontgfx.vfont"
532        %) /*vectorfont*/
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.