| 1 | #FIG 2.1 |
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| 2 | 80 2 |
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| 3 | 2 2 0 1 -1 0 0 0 0.000 0 0 0 |
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| 4 | 39 39 39 39 39 39 39 39 39 39 9999 9999 |
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| 5 | 2 2 0 1 -1 0 0 0 0.000 0 0 0 |
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| 6 | 59 99 59 99 59 99 59 99 59 99 9999 9999 |
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| 7 | 2 2 0 1 -1 0 0 0 0.000 0 0 0 |
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| 8 | 359 359 359 9 29 9 29 359 359 359 9999 9999 |
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| 9 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 9 74 134 C |
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| 10 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 10 74 174 G |
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| 11 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 9 74 214 U |
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| 12 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 21 109 99 $aa |
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| 13 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 23 229 219 $uu |
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| 14 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 9 149 59 C |
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| 15 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 10 189 59 G |
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| 16 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 9 229 59 U |
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| 17 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 4 269 59 . |
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| 18 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 8 309 59 - |
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| 19 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 23 189 179 $gg |
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| 20 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 22 189 99 $ag |
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| 21 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 22 229 99 $au |
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| 22 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 18 269 99 $a. |
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| 23 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 22 309 99 $a- |
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| 24 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 21 109 139 $ca |
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| 25 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 22 189 139 $cg |
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| 26 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 22 229 139 $cu |
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| 27 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 18 269 139 $c. |
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| 28 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 22 309 139 $c- |
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| 29 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 22 109 179 $ga |
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| 30 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 22 149 179 $gc |
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| 31 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 23 229 179 $gu |
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| 32 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 19 269 179 $g. |
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| 33 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 23 309 179 $g- |
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| 34 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 22 109 219 $ua |
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| 35 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 22 149 219 $uc |
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| 36 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 23 189 219 $ug |
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| 37 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 19 269 219 $u. |
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| 38 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 23 309 219 $u- |
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| 39 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 19 189 259 $.g |
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| 40 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 19 229 259 $.u |
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| 41 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 15 269 259 $.. |
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| 42 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 19 309 259 $.- |
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| 43 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 22 109 299 $-a |
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| 44 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 22 149 299 $-c |
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| 45 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 23 189 299 $-g |
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| 46 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 23 229 299 $-u |
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| 47 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 8 74 294 - |
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| 48 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 4 74 254 . |
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| 49 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 19 269 299 $-. |
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| 50 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 23 309 299 $-- |
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| 51 | 4 0 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 222 39 29 Give Value / Rank for each Basepair |
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| 52 | 4 0 18 13 0 -1 0 0.00000 4 17 40 39 349 $close |
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| 53 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 13 77 94 A |
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| 54 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 13 111 59 A |
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| 55 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 18 109 259 $.a |
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| 56 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 18 149 259 $.c |
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| 57 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 21 149 99 $ac |
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| 58 | 4 1 18 13 0 -1 0 0.00000 4 15 21 149 139 $cc |
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