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    • updated test-results for changed data
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    • no additional errors caused
    • i.e. index-errors seem to occur only on 3'-end
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Line 
1/*ARBDB ASCII*/
2genom_db                %i 0
3presets                 %% (%
4        alignment       :6000   %% (%
5                alignment_name  :7600   "ali_mini"
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7                aligned         :7000   %i 1
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9                alignment_type  :7000   "rna"
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12                %) /*alignment*/
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15                key                     %% (%
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56                ali_mini                %% (%
57                        data            :7000   "........AGAGUUUGAUCAAGUCGAGCGG--ACCGA----C--GGGAGCUUGCUCCC-------UUAG--GUCAGCGGC-GGACGGACUCCGGGAAACCGGGGCUAAUACCGGAUGCU-GAUGAUUGGGGUGAAGUCGUAACAA-GGUAGCCGUAUCGGAAGGUGCGGCUGGAUC..........."
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64                name            :7600   "ClnCorin"
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66                        data            :7000   ".........GAGUUUGAUCAAGUCGAG-------CGA----U--GAAGUUCCUUCGGGA------AUGG--AUUAGCGGC-GGACGGGCCUUUCGAAAGGAAGAUUAAUACCGCAUAAG-ACAGCGAUUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAGGAGAACCUU--GCCUGGCUGGAUCAUC.."
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74                ali_mini                %% (%
75                        data            :7000   "................AUCAAGUCGAG-------CGA----U--GAAGCUUCUUCGGAA------GUGG--AUUAGCGGC-GGACGGGCCUUUCGAAAGGAAGAUUAAUACCUCAUAAG-ACAGCGAUUGGGGUGAAGUCGUAACAG---------------G--U------------------U.."
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84                        data            :7000   "NNNNNNGA-GAGUUUGAUCAAGUCGAG-------CGA----U--GAAGUUCCUUCGGGA------ACGG--AUUAGCGGC-GGACGGGCCUUCCGAAAGGAAGAUUAAUACCGCAUAAGAUCAGCGAUUGGGGU-AAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAGGAGAACCUGCGGNUGGAUCACCUCCUU.."
85                        %) /*ali_mini*/
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93                        data            :7000   "-AAAUUGA-GAGUUUGAUCAAGUCGAG-------CGA----U--GAAGUUUCCUUCGGGAA----ACGG--AUUAGCGGCGGGACGGGCCUUCAGAACCUGCGGCUGGAUCAUCAUAAUGCAGCGAUUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAGGCGAAAGGAAGAUUAAUACCCCUCCUUUCU"
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102                        data            :7000   "........AGAGUUUGAUCAAGUCGAACGA--G-AA-----AGGGAUUGCUUGCAAUCCU------GAG--UAGAGUGGC-GCACGGACUGCCCGAAAGGACAGCUAAUACCGGAUGAA-GAUAAUUGGGGUGAAGUCGUAACAA-GGUAGCCGUUGAGGAAUCAGCGGCUGGAUCACCUCCUUNNN"
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111                        data            :7000   "........AGAGUUUGAUCAAGUCGAACGU--G-AA-----A--GGGACUUCGGUCCU--------GAG--UAAAGUGGC-GCACGGACACUUCGAAAGGGGUGCUAAUACCGGAUAAG-GGUAACUGGGGUGAAGUCGUAACAA-GGUAGCCGUAGGGGAACCUGCGGCUGGAUCACCUCCUUUNN"
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123                acc                     "ARB_2B59EE6C"
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128                ali_mini                %% (%
129                        data            :7000   "AAACUGG-AGAGUUUGAUCAAGUCGAACGU--G-AA-----A-----GUCUUCGGGAU--------GAG--UAAAGUGGC-GCACGGACGGCUGGAAACGGUCGCUAAUACCGGAUAAC-AAUGAUUGGGGUGAAGUCGUAACAA-GGUAGCCGUAGGGGAACCUGCGGCUGGAUCACCUCCUUU.."
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138                        data            :7000   "-AACUGG-AGAGUUUGAUCAAGUCGUACGA--G-AA-----AGGGG----CUUCGGCCCU------GAG--UAGAGUGGC-GCACGGACUCUGCGAAAGUGGAGCUAAUACCGGAUACA-G--------------A--------------------------------------------------G"
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146                ali_mini                %% (%
147                        data            :7000   "........AGAGUUUGAUCAAGUCGAACGGCAG-CACAGUCU--AGCUUGCUAGACGG--------GUG--GCGAGUGGC-GAACGGACUUGGGGAAACUCAAGCUAAUACCGCAUAAU-CAUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAA-GGUAGCCGUAGGGGAACCUGCGGCUGGAUCACCUCCUN..."
148                        %) /*ali_mini*/
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165                        data            :7000   "UUG-----AAGAGUUGAUCAAGUCGAACGG--U-AA-----C--AGGUCUUCGGAUGC--------UGA--CGA-GUGGC-GGACGGCCAGUUGGAAACGACUGUUAAUACCGCAUAAU-CAUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAUGGUAGCCGUA-GGGAACCUGCGGCUGGAUCACCUCCUU..."
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251                        data            :7000   ".AAAUUGAAGAGUUUGAUCAUG----UCGAGCGGGCGGAACACAUGCAAAGCUUGCUUCUUUGCG------ACGAGUGGC-GGACGGGUGAGGGGAAACGGUAGCUAAUACCGCAUAAC-GAUGACUAAAGUUAAUACCUAUUGA-CGUUACCCGCAGAAGAAGCACCGGCUAACUCCGUGCCAG.."
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256        %) /*extended_data*/
257
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.