| 1 | // =============================================================== // |
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| 2 | // // |
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| 3 | // File : ed4_extern.hxx // |
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| 4 | // Purpose : external interface (e.g. for secedit) // |
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| 5 | // // |
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| 6 | // Coded by Ralf Westram (coder@reallysoft.de) in August 2007 // |
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| 7 | // Institute of Microbiology (Technical University Munich) // |
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| 8 | // http://www.arb-home.de/ // |
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| 9 | // // |
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| 10 | // =============================================================== // |
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| 11 | |
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| 12 | #ifndef ED4_EXTERN_HXX |
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| 13 | #define ED4_EXTERN_HXX |
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| 14 | |
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| 15 | #ifndef AW_COLOR_GROUPS_HXX |
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| 16 | #include <aw_color_groups.hxx> |
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| 17 | #endif |
|---|
| 18 | #ifndef AW_WINDOW_HXX |
|---|
| 19 | #include <aw_window.hxx> |
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| 20 | #endif |
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| 21 | |
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| 22 | |
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| 23 | // define GCs |
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| 24 | // (used by secedit to sync colors) |
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| 25 | |
|---|
| 26 | #define ED4_G_FIRST_FONT ED4_G_STANDARD // ED4_G_SEQUENCES |
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| 27 | #define ED4_G_LAST_FONT ED4_G_HELIX |
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| 28 | |
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| 29 | typedef enum |
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| 30 | { |
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| 31 | ED4_G_STANDARD, |
|---|
| 32 | |
|---|
| 33 | ED4_G_SEQUENCES, |
|---|
| 34 | ED4_G_HELIX, |
|---|
| 35 | |
|---|
| 36 | ED4_G_COLOR_2, |
|---|
| 37 | ED4_G_COLOR_3, |
|---|
| 38 | ED4_G_COLOR_4, |
|---|
| 39 | ED4_G_COLOR_5, |
|---|
| 40 | ED4_G_COLOR_6, |
|---|
| 41 | ED4_G_COLOR_7, |
|---|
| 42 | ED4_G_COLOR_8, |
|---|
| 43 | ED4_G_COLOR_9, |
|---|
| 44 | |
|---|
| 45 | ED4_G_CBACK_0, // Ranges for column statitics |
|---|
| 46 | ED4_G_CBACK_1, |
|---|
| 47 | ED4_G_CBACK_2, |
|---|
| 48 | ED4_G_CBACK_3, |
|---|
| 49 | ED4_G_CBACK_4, |
|---|
| 50 | ED4_G_CBACK_5, |
|---|
| 51 | ED4_G_CBACK_6, |
|---|
| 52 | ED4_G_CBACK_7, |
|---|
| 53 | ED4_G_CBACK_8, |
|---|
| 54 | ED4_G_CBACK_9, |
|---|
| 55 | |
|---|
| 56 | ED4_G_SBACK_0, // Background for search |
|---|
| 57 | ED4_G_SBACK_1, |
|---|
| 58 | ED4_G_SBACK_2, |
|---|
| 59 | ED4_G_SBACK_3, |
|---|
| 60 | ED4_G_SBACK_4, |
|---|
| 61 | ED4_G_SBACK_5, |
|---|
| 62 | ED4_G_SBACK_6, |
|---|
| 63 | ED4_G_SBACK_7, |
|---|
| 64 | ED4_G_SBACK_8, |
|---|
| 65 | ED4_G_MBACK, // Mismatches |
|---|
| 66 | |
|---|
| 67 | ED4_G_CURSOR, // Color of cursor |
|---|
| 68 | ED4_G_MARKED, // Background for marked species |
|---|
| 69 | ED4_G_SELECTED, // Background for selected species |
|---|
| 70 | |
|---|
| 71 | ED4_G_FIRST_COLOR_GROUP, // Background colors for colored species |
|---|
| 72 | ED4_G_LAST_COLOR_GROUP = ED4_G_FIRST_COLOR_GROUP+AW_COLOR_GROUPS-1, |
|---|
| 73 | |
|---|
| 74 | ED4_G_DRAG = ED4_G_LAST_COLOR_GROUP+1 // must be last |
|---|
| 75 | } ED4_gc; |
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| 76 | |
|---|
| 77 | // ------------------------------ |
|---|
| 78 | // get background colors |
|---|
| 79 | // ------------------------------ |
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| 80 | |
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| 81 | // search background : |
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| 82 | |
|---|
| 83 | #define ED4_AWAR_SEARCH_RESULT_CHANGED "tmp/search/result_changed" // triggered when search result changes |
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| 84 | #define AWAR_EDIT_DIRECTION "tmp/edit4/edit_direction" |
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| 85 | |
|---|
| 86 | class ED4_sequence_terminal; |
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| 87 | |
|---|
| 88 | ED4_sequence_terminal *ED4_find_seq_terminal(const char *species_name); |
|---|
| 89 | const char *ED4_buildColorString(const ED4_sequence_terminal *seq_term, int start, int end); // search results |
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| 90 | |
|---|
| 91 | // visualized SAIs |
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| 92 | |
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| 93 | bool ED4_SAIs_visualized(); |
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| 94 | const char *ED4_getSaiColorString(AW_root *aw_root, int start, int end); |
|---|
| 95 | |
|---|
| 96 | int ED4_get_base_position(const ED4_sequence_terminal *seq_term, int seq_position); |
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| 97 | |
|---|
| 98 | // ------------------------ |
|---|
| 99 | // event injection |
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| 100 | // ------------------------ |
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| 101 | |
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| 102 | void ED4_remote_event(AW_event *faked_event); // used to forward keystrokes from SECEDIT |
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| 103 | |
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| 104 | #else |
|---|
| 105 | #error ed4_extern.hxx included twice |
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| 106 | #endif // ED4_EXTERN_HXX |
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