source: tags/arb_5.3/GDEHELP/FASTA/MATRIX/pam120.mat

Last change on this file was 2, checked in by oldcode, 24 years ago

Initial revision
  • Property svn:eol-style set to native
  • Property svn:keywords set to Author Date Id Revision
File size: 1.0 KB
Line 
1;P standard pam250 matrix for proteins
2 4 27 200 5 2 50 2
3 -12 -4
4@ *
5A R N B D C Q Z E G H I  L  K  M  F  P  S  T  W  Y  V  X
60 1 2 2 3 4 5 6 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19  0
7  3
8 -3  6
9  0 -1  4
10  0 -2  3  4
11  0 -3  2  3  5
12 -3 -4 -5 -6 -7  9
13 -1  1  0  0  1 -7  6
14 -1 -1  0  1  2 -7  4  5
15  0 -3  1  2  3 -7  2  3  5
16  1 -4  0  0  0 -5 -3 -2 -1  5
17 -3  1  2  1  0 -4  3  1 -1 -4  7
18 -1 -2 -2 -3 -3 -3 -3 -3 -3 -4 -4  6
19 -3 -4 -4 -5 -5 -7 -2 -3 -4 -5 -3  1  5
20 -2  2  1  0 -1 -7  0 -1 -1 -3 -2 -2 -4  5
21 -2 -1 -3 -4 -4 -6 -1 -3 -4 -4 -4  1  3  0  8
22 -4 -4 -4 -6 -7 -6 -6 -6 -6 -5 -2  0  0 -6 -1  8
23  1 -1 -2 -2 -2 -3  0 -1 -1 -2 -1 -3 -3 -2 -3 -5  6
24  1 -1  1  0  0 -1 -2 -2 -1  1 -2 -2 -4 -1 -2 -3  1  3
25  1 -2  0 -1 -1 -3 -2 -2 -2 -1 -3  0 -3 -1 -1 -4 -1  2  4
26 -7  1 -5 -7 -8 -8 -6 -7 -8 -8 -5 -7 -5 -5 -7 -1 -7 -2 -6 12
27 -4 -6 -2 -4 -5 -1 -5 -5 -4 -6 -1 -2 -3 -6 -4  4 -6 -3 -3 -1  8
28  0 -3 -3 -3 -3 -2 -3 -3 -3 -2 -3  3  1 -4  1 -3 -2 -2  0 -8 -3  5
29  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.