source: tags/arb_5.3/GDEHELP/FASTA/MATRIX/prot.mat

Last change on this file was 2, checked in by oldcode, 24 years ago

Initial revision
  • Property svn:eol-style set to native
  • Property svn:keywords set to Author Date Id Revision
File size: 1.0 KB
Line 
1;P standard pam250 matrix for proteins
2 4 27 200 5 2 50 2
3 -12 -4
4@ *
5A R N D C Q E G H I  L  K  M  F  P  S  T  W  Y  V B Z X
60 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 2 6 0
7  2
8 -2  6
9  0  0  2
10  0 -1  2  4
11 -2 -4 -4 -5 12
12  0  1  1  2 -5  4
13  0 -1  1  3 -5  2  4
14  1 -3  0  1 -3 -1  0  5
15 -1  2  2  1 -3  3  1 -2  6
16 -1 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -3 -2  5
17 -2 -3 -3 -4 -6 -2 -3 -4 -2  2  6
18 -1  3  1  0 -5  1  0 -2  0 -2 -3  5
19 -1  0 -2 -3 -5 -1 -2 -3 -2  2  4  0  6
20 -4 -4 -4 -6 -4 -5 -5 -5 -2  1  2 -5  0  9
21  1  0 -1 -1 -3  0 -1 -1  0 -2 -3 -1 -2 -5  6
22  1  0  1  0  0 -1  0  1 -1 -1 -3  0 -2 -3  1  2
23  1 -1  0  0 -2 -1  0  0 -1  0 -2  0 -1 -3  0  1  3
24 -6  2 -4 -7 -8 -5 -7 -7 -3 -5 -2 -3 -4  0 -6 -2 -5 17
25 -3 -4 -2 -4  0 -4 -4 -5  0 -1 -1 -4 -2  7 -5 -3 -3  0 10
26  0 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -1 -2  4  2 -2  2 -1 -1 -1  0 -6 -2  4
27  0 -1  2  3 -4  1  2  0  1 -2 -3  1 -2 -5 -1  0  0 -5 -3 -2  2
28  0  0  1  3 -5  3  3 -1  2 -2 -3  0 -2 -5  0  0 -1 -6 -4 -2  2  3
29  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
30 
31
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.