source: tags/ms_r16q3/GENOM_IMPORT/MetaTag.h

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1// ================================================================ //
2//                                                                  //
3//   File      : MetaTag.h                                          //
4//   Purpose   :                                                    //
5//                                                                  //
6//   Coded by Ralf Westram (coder@reallysoft.de) in November 2006   //
7//   Institute of Microbiology (Technical University Munich)        //
8//   http://www.arb-home.de/                                        //
9//                                                                  //
10// ================================================================ //
11#ifndef METATAG_H
12#define METATAG_H
13
14#ifndef TYPES_H
15#include "types.h"
16#endif
17
18enum MetaTagType {
19    MT_HEADER,                                      // Header tag (ID or LOCUS)
20    MT_BASIC,                                       // Basic tag -> gets written to DB (into 'field')
21    MT_REF_START,                                   // Start of (new) reference
22    MT_REF,                                         // Reference data, 'field' describes type of reference
23    MT_REF_DBID,                                    // Database reference (PUBMED, MEDLINE, DOI, ...)
24    MT_FEATURE_START,                               // Start of feature table
25    MT_FEATURE,                                     // Feature table
26    MT_SEQUENCE_START,                              // Start of sequence
27    MT_CONTIG,                                      // contig entry
28    MT_END,                                         // End of file (or section, if multiple entries)
29    MT_IGNORE,                                      // is ignored
30};
31
32struct MetaTag {
33    std::string tag;                                     // tag name (in flatfile)
34    std::string field;                                   // field name
35    MetaTagType type;
36};
37
38typedef std::map<std::string, const MetaTag *> MetaTagMap;
39
40class MetaTagTranslator : virtual Noncopyable {
41    MetaTagMap translate;
42
43public:
44    MetaTagTranslator(const struct MetaTag *meta_description) {
45        for (int idx = 0; !meta_description[idx].tag.empty(); ++idx) {
46            const MetaTag& mt  = meta_description[idx];
47            translate[mt.tag] = &mt;
48        }
49    }
50
51    const MetaTag *get(const std::string& tag) const {
52        MetaTagMap::const_iterator found = translate.find(tag);
53        if (found != translate.end()) return found->second;
54        return 0;
55    }
56};
57
58
59
60#else
61#error MetaTag.h included twice
62#endif // METATAG_H
63
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.