| 1 | #NEXUS |
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| 2 | [! RDP - the Ribosomal Database Project, (Mon Oct 25 12:26:33 2010).] |
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| 3 | [! To get started, send HELP to rdp@info.mcs.anl.gov ] |
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| 4 | BEGIN DATA; |
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| 5 | DIMENSIONS |
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| 6 | NTAX = 5 |
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| 7 | NCHAR = 1546 |
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| 8 | ; |
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| 9 | FORMAT |
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| 10 | LABELPOS = LEFT |
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| 11 | MISSING = . |
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| 12 | EQUATE = "~=.|><" |
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| 13 | INTERLEAVE |
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| 14 | DATATYPE = RNA |
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| 15 | GAP = - |
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| 16 | ; |
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| 17 | OPTIONS |
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| 18 | GAPMODE = MISSING |
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| 19 | ; |
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| 20 | MATRIX |
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| 21 | 'AF375552; cattgtcgcg catgaactgc aactgctgag ggatcaggat aatcatccgc [1 - 50] |
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| 22 | A1MVRNA2 gtttttatct tttcgcgatt gaaaagataa gtttttcagt ttaatctttt |
|---|
| 23 | 'ER781674_ tggcgccgta gatgcagcgc gactggcccg gcttctcggc gtcgaggtac |
|---|
| 24 | 'AY704744_ gcatcgatga agaacgcagc gaaatgcgat aagtaatgtg aattgcagaa |
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| 25 | 'Y15714;' agagtttgat nngggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg |
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| 26 | |
|---|
| 27 | 'AF375552; agataaatat aactgctaaa aataatacac aaacttacgc aatggcagcc [51 - 100] |
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| 28 | A1MVRNA2 caatatgttc actcttttga gatgtctcgg attcggtgtt aatgaaccta |
|---|
| 29 | 'ER781674_ tgcgccacgg ccttggcgct ggccacgtcc gggcagacca cgatgctctt |
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| 30 | 'AY704744_ ttcagtgaat catcgaatct ttgaacgcac attgcgccca ttagtattct |
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| 31 | 'Y15714;' caagtcgagc ggacagacga ggtgcttgca cctctgaagt cagcggcgga |
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| 32 | |
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| 33 | 'AF375552; taaacagcac catgcgtgcc tgatttttgc tcactgatgg caatttgacg [101 - 150] |
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| 34 | A1MVRNA2 ctaacacttc ctcatcagag tatgttcccg agtattccgt tgaagagatt |
|---|
| 35 | 'ER781674_ gcgtgagccg gcgacgtgga cgatgccctt ggccagttcg atcatcgtct |
|---|
| 36 | 'AY704744_ agtgggcatg cctgttcgag cgtcatttca acccttaagc ttagcttagt |
|---|
| 37 | 'Y15714;' cgggtgagta acacgtgggt aacctacctg taagactggg ataacttcgg |
|---|
| 38 | |
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| 39 | 'AF375552; gcctaaactt ttagtcagat acgttgttgt ggaggcttga cgcagcaaaa [151 - 200] |
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| 40 | A1MVRNA2 tccaacgaag tcgctgaact cgattcagtg gatccattat tccaatgtta |
|---|
| 41 | 'ER781674_ ggtcgttggt gatccgggcg gcgatctcgg cgtcggaata gtccttctcg |
|---|
| 42 | 'AY704744_ attgggaatc tgcttaaccg cagctcctta aatctagttg gcagagcaca |
|---|
| 43 | 'Y15714;' gaaaccggag ctaataccgg ataatatttt ccacctcatg gtggaatagt |
|---|
| 44 | |
|---|
| 45 | 'AF375552; gagatttaaa gccccgcaaa atgtcgctgt ttgagactgg ctttggcatt [201 - 250] |
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| 46 | A1MVRNA2 caaacatgtt tttgtatcat tgatgctcgt aagaaagatg actcaagctg |
|---|
| 47 | 'ER781674_ ccggcctcgt tctccgccac ggtcagcgtg gagaagtcga tggagacgcg |
|---|
| 48 | 'AY704744_ gctgtactct gagcgtagta attcattatc tcgctttctg aagacagtcg |
|---|
| 49 | 'Y15714;' gaaagacggt tttgctgtca cttacagatg gacccgcggc gcattagcta |
|---|
| 50 | |
|---|
| 51 | 'AF375552; ttgttaaatt tgagaaagtc ctatggttgt agacgttgat gtagcaaggt [251 - 300] |
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| 52 | A1MVRNA2 ccgaagactt cctcgagagt tttgggggag a |
|---|
| 53 | 'ER781674_ gacgaacgcc tgcttggcgg ggcagagcca taccgttggc catgcctcac |
|---|
| 54 | 'AY704744_ tacgatagcc acaaactttg catcttgcaa actttttaat ggttgacctc |
|---|
| 55 | 'Y15714;' gttggtgagg taacggctca ccaaggcgac gatgcgtagc cgacctgaga |
|---|
| 56 | |
|---|
| 57 | 'AF375552; gtttggacag [301 - 310] |
|---|
| 58 | A1MVRNA2 |
|---|
| 59 | 'ER781674_ aggatgtcgc ggttgaaggc gaggccctgg aacaggttgg ccatcgccac |
|---|
| 60 | 'AY704744_ ggatcaggta ggaatacccg ctgaacttaa gcatatcaat aagcggagga |
|---|
| 61 | 'Y15714;' gggtgatcgg ccacactggg actgagacac ggcccagact cctacgggag |
|---|
| 62 | |
|---|
| 63 | 'AF375552; |
|---|
| 64 | A1MVRNA2 |
|---|
| 65 | 'ER781674_ |
|---|
| 66 | 'AY704744_ |
|---|
| 67 | 'Y15714;' gcagcagtag ggaatcttcc gcaatggacg aaagtctgac ggagcaacgc [351 - 400] |
|---|
| 68 | |
|---|
| 69 | 'AF375552; |
|---|
| 70 | A1MVRNA2 |
|---|
| 71 | 'ER781674_ |
|---|
| 72 | 'AY704744_ |
|---|
| 73 | 'Y15714;' cgcgtgagtg aagaaggtct tcggatcgta aaactctgtt gtaagggaag [401 - 450] |
|---|
| 74 | |
|---|
| 75 | 'AF375552; |
|---|
| 76 | A1MVRNA2 |
|---|
| 77 | 'ER781674_ |
|---|
| 78 | 'AY704744_ |
|---|
| 79 | 'Y15714;' aacaagtacg ttagtaactg aacgtacctt gacggtacct taccagaaag [451 - 500] |
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| 80 | |
|---|
| 81 | 'AF375552; |
|---|
| 82 | A1MVRNA2 |
|---|
| 83 | 'ER781674_ |
|---|
| 84 | 'AY704744_ |
|---|
| 85 | 'Y15714;' ccacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag gtggcaagcg [501 - 550] |
|---|
| 86 | |
|---|
| 87 | 'AF375552; |
|---|
| 88 | A1MVRNA2 |
|---|
| 89 | 'ER781674_ |
|---|
| 90 | 'AY704744_ |
|---|
| 91 | 'Y15714;' ttatccggaa ttattgggcg taaagcgcgc gtaggcggtt tcttaagtct [551 - 600] |
|---|
| 92 | |
|---|
| 93 | 'AF375552; |
|---|
| 94 | A1MVRNA2 |
|---|
| 95 | 'ER781674_ |
|---|
| 96 | 'AY704744_ |
|---|
| 97 | 'Y15714;' gatgtgaaag cccccggctc aaccggggag ggtcattgga aactgggaga [601 - 650] |
|---|
| 98 | |
|---|
| 99 | 'AF375552; |
|---|
| 100 | A1MVRNA2 |
|---|
| 101 | 'ER781674_ |
|---|
| 102 | 'AY704744_ |
|---|
| 103 | 'Y15714;' cttgagtgca gaagaggaga gtggaattcc atgtgtagcg gtgaaatgcg [651 - 700] |
|---|
| 104 | |
|---|
| 105 | 'AF375552; |
|---|
| 106 | A1MVRNA2 |
|---|
| 107 | 'ER781674_ |
|---|
| 108 | 'AY704744_ |
|---|
| 109 | 'Y15714;' cagagatatg gaggaacacc agtggcgaag gcggctctct ggtctgtaac [701 - 750] |
|---|
| 110 | |
|---|
| 111 | 'AF375552; |
|---|
| 112 | A1MVRNA2 |
|---|
| 113 | 'ER781674_ |
|---|
| 114 | 'AY704744_ |
|---|
| 115 | 'Y15714;' tgacgctgag gtgcgaaagc gtggggatca aacaggatta gataccctgg [751 - 800] |
|---|
| 116 | |
|---|
| 117 | 'AF375552; |
|---|
| 118 | A1MVRNA2 |
|---|
| 119 | 'ER781674_ |
|---|
| 120 | 'AY704744_ |
|---|
| 121 | 'Y15714;' tagtccacgc cgtaaacgat gagtgctaag tgttgggggg tttccgcccc [801 - 850] |
|---|
| 122 | |
|---|
| 123 | 'AF375552; |
|---|
| 124 | A1MVRNA2 |
|---|
| 125 | 'ER781674_ |
|---|
| 126 | 'AY704744_ |
|---|
| 127 | 'Y15714;' tcagtgctgc agctaacgca ttaagcactc cgcctgggga gtacggtcgc [851 - 900] |
|---|
| 128 | |
|---|
| 129 | 'AF375552; |
|---|
| 130 | A1MVRNA2 |
|---|
| 131 | 'ER781674_ |
|---|
| 132 | 'AY704744_ |
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| 133 | 'Y15714;' aagactgaaa ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag cggtggagca [901 - 950] |
|---|
| 134 | |
|---|
| 135 | 'AF375552; |
|---|
| 136 | A1MVRNA2 |
|---|
| 137 | 'ER781674_ |
|---|
| 138 | 'AY704744_ |
|---|
| 139 | 'Y15714;' tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac cttaccaaat cttgacatcc [951 - 1000] |
|---|
| 140 | |
|---|
| 141 | 'AF375552; |
|---|
| 142 | A1MVRNA2 |
|---|
| 143 | 'ER781674_ |
|---|
| 144 | 'AY704744_ |
|---|
| 145 | 'Y15714;' tctgacaact ctggagacag agcgttcccc ttcgggggac agagtgacag [1001 - 1050] |
|---|
| 146 | |
|---|
| 147 | 'AF375552; |
|---|
| 148 | A1MVRNA2 |
|---|
| 149 | 'ER781674_ |
|---|
| 150 | 'AY704744_ |
|---|
| 151 | 'Y15714;' gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc [1051 - 1100] |
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| 152 | |
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| 153 | 'AF375552; |
|---|
| 154 | A1MVRNA2 |
|---|
| 155 | 'ER781674_ |
|---|
| 156 | 'AY704744_ |
|---|
| 157 | 'Y15714;' cgcaacgagc gcaaccctta tctttagttg ccatcattca gttgggcact [1101 - 1150] |
|---|
| 158 | |
|---|
| 159 | 'AF375552; |
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| 160 | A1MVRNA2 |
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| 161 | 'ER781674_ |
|---|
| 162 | 'AY704744_ |
|---|
| 163 | 'Y15714;' ctagagagac tgccggtgac aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaaa [1151 - 1200] |
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| 164 | |
|---|
| 165 | 'AF375552; |
|---|
| 166 | A1MVRNA2 |
|---|
| 167 | 'ER781674_ |
|---|
| 168 | 'AY704744_ |
|---|
| 169 | 'Y15714;' tcatcatgcc ccttatgatt tgggctacac acgtgctaca atggatggta [1201 - 1250] |
|---|
| 170 | |
|---|
| 171 | 'AF375552; |
|---|
| 172 | A1MVRNA2 |
|---|
| 173 | 'ER781674_ |
|---|
| 174 | 'AY704744_ |
|---|
| 175 | 'Y15714;' caaagggcag caaaaccgcg aggtcaagca aatcccataa aaccattctc [1251 - 1300] |
|---|
| 176 | |
|---|
| 177 | 'AF375552; |
|---|
| 178 | A1MVRNA2 |
|---|
| 179 | 'ER781674_ |
|---|
| 180 | 'AY704744_ |
|---|
| 181 | 'Y15714;' agttcggatt gtagtctgca actcgactac atgaagctgg aatcgctagt [1301 - 1350] |
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| 182 | |
|---|
| 183 | 'AF375552; |
|---|
| 184 | A1MVRNA2 |
|---|
| 185 | 'ER781674_ |
|---|
| 186 | 'AY704744_ |
|---|
| 187 | 'Y15714;' aatcgtagat cagcatgcta cggtgaatac gttcccgggt cttgtacaca [1351 - 1400] |
|---|
| 188 | |
|---|
| 189 | 'AF375552; |
|---|
| 190 | A1MVRNA2 |
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| 191 | 'ER781674_ |
|---|
| 192 | 'AY704744_ |
|---|
| 193 | 'Y15714;' ccgcccgtca caccacgaga gtttgtaaca cccgaagccg gtggagtaac [1401 - 1450] |
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| 194 | |
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| 195 | 'AF375552; |
|---|
| 196 | A1MVRNA2 |
|---|
| 197 | 'ER781674_ |
|---|
| 198 | 'AY704744_ |
|---|
| 199 | 'Y15714;' ctttacagga gctagccgtc gaaggtggga cagatgattg gggtgaagtc [1451 - 1500] |
|---|
| 200 | |
|---|
| 201 | 'AF375552; |
|---|
| 202 | A1MVRNA2 |
|---|
| 203 | 'ER781674_ |
|---|
| 204 | 'AY704744_ |
|---|
| 205 | 'Y15714;' gtaacaaggt agccgtatcg gaaggtgcgg ctggatcacc tccttt [1501 - 1546] |
|---|
| 206 | ; |
|---|
| 207 | ENDBLOCK; |
|---|
