source: trunk/etc/pt_prof

Last change on this file was 2, checked in by oldcode, 24 years ago

Initial revision
  • Property svn:eol-style set to native
  • Property svn:keywords set to Author Date Id Revision
File size: 9.0 KB
Line 
1 %time  cumsecs  #call  ms/call  name
28 22.3   990.433893803     0.25  _PT_add_to_chain__FP11PTMM_structP15POS_TREE_structiN23
38 16.6  1726.244314622     0.17  _PT_size_of_chain_entries__FPc
48 15.7  2424.41499924499     0.00  _PT_WRITE_CHAIN_ENTRY__FPciN32
5   6.8  2726.47                  mcount
68  6.3  3007.72  92977     3.02  _gb_uncompress_huffmann
72  4.0  3183.04141270061     0.00  _PT_read_son__FP11PTMM_structP15POS_TREE_struct13PT_bases_enum
8#  3.8  3353.43116684550     0.00  _get_abs_align_pos__FPci
98  2.9  3483.37      1 129940.00  _enter_stage_1_build_tree__FP14struct_PT_mainPc
10#  2.2  3581.45100836149     0.00  _PT_read_type__FP15POS_TREE_struct
11   2.2  3677.934585865     0.02  _build_pos_tree__FP15POS_TREE_structiN32
12   2.2  3774.28  92977     1.04  _gb_uncompress_equal_bytes
13   1.9  3859.457931292     0.01  _memcpy
14   1.6  3931.014647722     0.02  _strlen
15   1.3  3986.894514357     0.01  _PT_create_leaf__FP11PTMM_structPP15POS_TREE_struct13PT_bases_enumiN24
16   0.9  4027.9023260153     0.00  _strncmp
17   0.9  4066.6312233324     0.00  _PT_change_father__FP15POS_TREE_structN21
18   0.8  4103.223404352     0.01  _PTD_write_node_to_disk__FP6_iobufP11PTMM_structP15POS_TREE_structPil
19   0.8  4139.5016747687     0.00  _PTM_get_mem__Fi
20   0.8  4175.5316747686     0.00  _PTM_free_mem__FPci
21   0.7  4207.7612233324     0.00  _PT_GET_CODE2__FP15POS_TREE_structi
22   0.6  4236.561808631     0.02  _bzero
23   0.6  4264.154593186     0.01  _PTD_write_leafs_to_disk__FP6_iobufP11PTMM_structP15POS_TREE_structiPiT5
24   0.4  4283.71                  ___dt__14GB_transactionFv
25   0.4  4300.9916237136     0.00  _memset
26   0.4  4317.44                  _malloc
27   0.4  4333.73 420819     0.04  _PTD_write_chain_to_disk__FP6_iobufP11PTMM_structP15POS_TREE_structl
28   0.3  4348.184514382     0.00  _PTD_clear_fathers__FP11PTMM_structP15POS_TREE_struct
29   0.3  4362.33                  _free
30   0.2  4371.343404352     0.00  _PT_change_leaf_to_node__FP11PTMM_structP15POS_TREE_struct
31   0.2  4379.87   3576     2.39  _probe_compress_sequence__FPc
32   0.1  4385.844514357     0.00  _PTD_set_object_to_saved_status__FP15POS_TREE_structli
33   0.1  4391.754021272     0.00  _gb_give_buffer
34   0.1  4397.51 689186     0.01  _PTD_write_tip_to_disk__FP6_iobufP11PTMM_structP15POS_TREE_structl
35   0.1  4401.28   4448     0.85  _write
36   0.1  4404.59  92978     0.04  _gb_build_uncompress_tree
37   0.1  4407.511297822     0.00  _gbm_get_mem
38   0.1  4410.321811075     0.00  .umul
39   0.1  4412.80 420819     0.01  _PT_leaf_to_chain__FP11PTMM_structP15POS_TREE_struct
40   0.0  4414.93   8701     0.24  _gb_read_bin_rek
41   0.0  4417.001808631     0.00  _calloc
42   0.0  4419.04                  _realloc
43   0.0  4420.991238445     0.00  _gbm_free_mem
44   0.0  4422.591187083     0.00  _PT_read_apos__FP11PTMM_structP15POS_TREE_struct
45   0.0  4424.14 393395     0.00  _GB_find
46   0.0  4425.611238445     0.00  _gb_free_compress_tree
47   0.0  4426.731187083     0.00  _PT_read_rpos__FP11PTMM_structP15POS_TREE_struct
48   0.0  4427.541187083     0.00  _PT_read_name__FP11PTMM_structP15POS_TREE_struct
49   0.0  4428.35  89400     0.01  _probe_read_alignment__FiPi
50   0.0  4429.07  92976     0.01  _probe_read_string_append_point__FP17gb_data_base_typePi
51   0.0  4429.74 100139     0.01  _GB_read_char_pntr
52   0.0  4430.32 100130     0.01  _GB_read_string
53   0.0  4430.83 150371     0.00  _PTD_put_short__FP6_iobufUl
54   0.0  4431.26  55732     0.01  _gb_link_entry
55   0.0  4431.67   2447     0.17  _sbrk
56   0.0  4432.06 229078     0.00  _strcmp
57   0.0  4432.41  92977     0.00  _gb_uncompress_bytes
58   0.0  4432.69  92976     0.00  _GB_read_string_count
59   0.0  4432.96    551     0.49  _read
60   0.0  4433.21 126091     0.00  _gbs_malloc_copy
61   0.0  4433.45  57918     0.00  _PTD_put_int__FP6_iobufUl
62   0.0  4433.63  92977     0.00  _gb_give_buffer2
63   0.0  4433.80  92977     0.00  _gb_give_other_buffer
64   0.0  4433.94  47031     0.00  _gb_make_entry
65   0.0  4434.07  92996     0.00  .rem
66   0.0  4434.18  32807     0.00  _gb_read_in_long
67   0.0  4434.23   1287     0.04  __doprnt
68   0.0  4434.26   8701     0.00  _gb_make_container
69   0.0  4434.29      1    30.00  _probe_read_alignments__Fv
70   0.0  4434.31   3167     0.01  __flsbuf
71   0.0  4434.33      4     5.00  _close
72   0.0  4434.35   3596     0.01  _gbs_hash_index
73   0.0  4434.37   1281     0.02  _printf
74   0.0  4434.39   3793     0.01  _strcpy
75   0.0  4434.40                  .div
76   0.0  4434.41   3576     0.00  _GBS_write_hash_no_strdup
77   0.0  4434.42   7152     0.00  _GBT_next_species
78   0.0  4434.43      1    10.00  _PT_init_count_bits__Fv
79   0.0  4434.44   4449     0.00  __xflsbuf
80   0.0  4434.45   5107     0.00  _fread
81   0.0  4434.46      3     3.33  _fstat
82   0.0  4434.47      6     1.67  _open
83   0.0  4434.48   3790     0.00  _strdup
84   0.0  4434.48   5107     0.00  .mul
85   0.0  4434.48   3146     0.00  .udiv
86   0.0  4434.48    310     0.00  .udiv_o3
87   0.0  4434.48    702     0.00  .urem
88   0.0  4434.48      2     0.00  _GBS_create_hash
89   0.0  4434.48      1     0.00  _GBS_find_lib_file
90   0.0  4434.48      4     0.00  _GBS_find_string
91   0.0  4434.48      1     0.00  _GBS_read_arb_tcp
92   0.0  4434.48      9     0.00  _GBS_string_cmp
93   0.0  4434.48      1     0.00  _GBS_string_eval
94   0.0  4434.48     20     0.00  _GBS_write_hash
95   0.0  4434.48      1     0.00  _GBT_find_extended
96   0.0  4434.48      1     0.00  _GBT_find_species
97   0.0  4434.48      2     0.00  _GBT_first_species
98   0.0  4434.48      1     0.00  _GBT_get_default_alignment
99   0.0  4434.48      1     0.00  _GBT_get_default_ref
100   0.0  4434.48      1     0.00  _GBT_read_sequence
101   0.0  4434.48      5     0.00  _GB_begin_transaction
102   0.0  4434.48      5     0.00  _GB_commit_transaction
103   0.0  4434.48      1     0.00  _GB_get_father
104   0.0  4434.48      1     0.00  _GB_install_command_table
105   0.0  4434.48      2     0.00  _GB_install_pid
106   0.0  4434.48      1     0.00  _GB_login
107   0.0  4434.48      1     0.00  _GB_open
108   0.0  4434.48      2     0.00  _GB_search
109   0.0  4434.48      1     0.00  _GB_set_mode_of_file
110   0.0  4434.48     26     0.00  _PTD_debug_nodes__Fv
111   0.0  4434.48     76     0.00  _PTD_save_partial_tree__FP6_iobufP11PTMM_structP15POS_TREE_structPcilPi
112   0.0  4434.48     26     0.00  _PTM_debug_mem__Fv
113   0.0  4434.48      1     0.00  _PT_build_species_hash__Fv
114   0.0  4434.48     25     0.00  _PT_inc_base_string_count__FPccT2i
115   0.0  4434.48      1     0.00  _PT_init__Fi
116   0.0  4434.48      1     0.00  _PT_init_base_string_counter__FPcci
117   0.0  4434.48      1     0.00  ___ct__12BI_ecoli_refFv
118   0.0  4434.48      3     0.00  ___dl__FPv
119   0.0  4434.48      1     0.00  ___dtors__Fv
120   0.0  4434.48      5     0.00  ___nw__FUi
121   0.0  4434.48    310     0.00  ___quorem10000
122   0.0  4434.48      1     0.00  ___start_libm
123   0.0  4434.48      1     0.00  ___sti__PT_main_cxx_pt_init_main_struct_
124   0.0  4434.48    551     0.00  __filbuf
125   0.0  4434.48      4     0.00  __findbuf
126   0.0  4434.48      6     0.00  __findiop
127   0.0  4434.48      1     0.00  __main
128   0.0  4434.48      2     0.00  __wrtchk
129   0.0  4434.48      1     0.00  _arb_trace_argv
130   0.0  4434.48      1     0.00  _chmod
131   0.0  4434.48      1     0.00  _exit
132   0.0  4434.48      1     0.00  _exit__12BI_ecoli_refFv
133   0.0  4434.48      4     0.00  _fclose
134   0.0  4434.48      4     0.00  _fflush
135   0.0  4434.48     32     0.00  _fgets
136   0.0  4434.48      6     0.00  _fopen
137   0.0  4434.48      6     0.00  _freopen
138   0.0  4434.48      1     0.00  _gb_build_compress_list
139   0.0  4434.48      5     0.00  _gb_commit_transaction_local_rek
140   0.0  4434.48     10     0.00  _gb_do_callback_list
141   0.0  4434.48      1     0.00  _gb_init_gb
142   0.0  4434.48      1     0.00  _gb_make_gb_main_type
143   0.0  4434.48      1     0.00  _gb_read_bin
144   0.0  4434.48      5     0.00  _gb_untouch
145   0.0  4434.48      1     0.00  _gbcm_login
146   0.0  4434.48      1     0.00  _gbl_install_standard_commands
147   0.0  4434.48      1     0.00  _gbs_build_replace_string
148   0.0  4434.48     16     0.00  _gbs_chrcat
149   0.0  4434.48      1     0.00  _gbs_compress_command
150   0.0  4434.48      1     0.00  _gbs_strcat
151   0.0  4434.48      1     0.00  _gbs_strclose
152   0.0  4434.48      1     0.00  _gbs_strncat
153   0.0  4434.48      1     0.00  _gbs_stropen
154   0.0  4434.48      9     0.00  _getenv
155   0.0  4434.48      1     0.00  _getpagesize
156   0.0  4434.48      2     0.00  _getpid
157   0.0  4434.48      1     0.00  _init__12BI_ecoli_refFPcl
158   0.0  4434.48      4     0.00  _ioctl
159   0.0  4434.48      4     0.00  _isatty
160   0.0  4434.48   1287     0.00  _localeconv
161   0.0  4434.48      1     0.00  _main
162   0.0  4434.48     32     0.00  _memccpy
163   0.0  4434.48   1281     0.00  _memchr
164   0.0  4434.48      1     0.00  _on_exit
165   0.0  4434.48      1     0.00  _probe_read_data_base__FPc
166   0.0  4434.48      1     0.00  _profil
167   0.0  4434.48      1     0.00  _pt_init_main_struct__FP14struct_PT_mainPc
168   0.0  4434.48      6     0.00  _sprintf
169   0.0  4434.48     13     0.00  _strchr
170   0.0  4434.48      3     0.00  _strpbrk
171   0.0  4434.48      2     0.00  _strrchr
172   0.0  4434.48      3     0.00  _strspn
173   0.0  4434.48      4     0.00  _strtok
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.