source: trunk/lib/import/older/pir.ift

Last change on this file was 11965, checked in by westram, 11 years ago
  • move old import filters into '$ARBHOME/lib/import/older'
  • Property svn:eol-style set to native
  • Property svn:keywords set to Author Date Id Revision
File size: 1.8 KB
Line 
1AUTODETECT      "??;*\n*Type: P*"
2                #Global settings:
3#KEYWIDTH       1
4FILETAG         "PIR"
5
6MATCH           "C;Accession: *"
7                ACI             "extract_words("0123456789",4.0)"
8                WRITE           "acc"
9
10MATCH           "C;Species: *"
11                SRT             "* *=*2"
12                WRITE           "full_name"
13
14MATCH           "C;Species: *"
15                SRT             "* *=*2"
16                TAG             "PIR"
17                APPEND          "db_name"
18
19MATCH           "C;Date: *"
20                SRT             "* *=*2"
21                TAG             "PIR"
22                APPEND          "date"
23
24MATCH           "R;*"
25                SRT "R;*=*"
26                TAG             "PIR"
27                APPEND          "author"
28
29MATCH           "R;*\n*"
30                TAG             "PIR"
31                APPEND          "journal"
32
33MATCH           "A;Title: *"
34                SRT             "* *=*2"
35                TAG             "PIR"
36                APPEND          "title"
37
38MATCH           "A;Cross-references: *"
39                SRT             "* *=*2"
40                TAG             "PIR"
41                APPEND          "cross_ref"
42
43MATCH           "A;Experimental source: *"
44                SRT             "* *=*2"
45                TAG             "PIR"
46                APPEND          "strain"
47
48MATCH           "C;Superfamily: *"
49                SRT             "* *=*2"
50                TAG             "PIR"
51                APPEND          "protein"
52
53MATCH           "C;Keywords: *"
54                SRT             "* *=*2"
55                TAG             "PIR"
56                APPEND          "keywords"
57
58
59BEGIN           "??;*"
60SEQUENCESTART   "*Check:*"
61SEQUENCESRT     "*Check*..*=*3"
62SEQUENCEACI     "remove("0123456789. /")"
63SEQUENCEEND     "/END/"
64CREATE_ACC_FROM_SEQUENCE
65
66END             "/END/"
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.