Override renaming in merge tool

[westram]

wir sind hier auf ein doch erhebliches Problem mit der strikten Bedingung im Merge Tool gestoßen nur nach "generate new names" das mergen zu erlauben. Problemfall: Externes Alignen von DNA oder Proteinsequenzen mit anschließendem mergen in einen ARB Datensatz Vorgehen:

• Anlegen einer ARB Datenbank mit den entsprechenden Sequenzen.
• Generate new names
• Export der Sequenzen in Multi_Fasta format
• Alignen der Sequenzen mit externen Tools (Maft, Muscle etc.)
• Create new ARB Database mit den alignierten Sequenzen aus aligniertem

Multi-Fasta file - keep names

• Mergen der neuen Datenbank mit der alten wobei nur die Sequenzen

transferiert und in der alten Datenbank ersetzt werden.

• Speichern der neuen Datenbank

Das Ganze funktioniert nur wenn man die unique names auf dem ganzen Weg nicht antastet, da wir die alignierten Sequenzen sozusagen der Datenbank unterschieben.

Mit dem neuen Merge Tool ist das nicht möglich, da beim mergen die Namen neu generiert werden müssen - diese sind aber anders, da die exportierten Sequenzen ja keine accession numbers tragen sondern nur die arb names.

Wenn es eine andere Möglichkeit gibt das oben genannte Vorgehen zu realisieren soll es mir recht sein (mir fällt nur keine ein). Wenn nicht schlage ich vor, dass das merge Tool eine weitere Option erhält, dass man auch ohne generate new names mergen kann.

[westram]

• added an override toggle